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《BioRxiv，3月11日，Larger viral genome size facilitates emergence of zoonotic diseases》

  • 来源专题：COVID-19科研动态监测
  • 编译者： zhangmin
  • 发布时间：2020-03-12

  • Larger viral genome size facilitates emergence of zoonotic diseases

    Richard E Grewelle

    doi: https://doi.org/10.1101/2020.03.10.986109

    Abstract

    Emergence of new viral diseases is linked to mutation or recombination events. The likelihood of cross-species transmission is related to phenotypic plasticity of a virus and its capacity to produce genetically variable progeny. Herein a model is described connecting the production of genetic variability with increasing genome size. Comparing all known zoonotic viral genome sizes to known non-zoonotic viral genome sizes demonstrates that zoonotic viruses have significantly larger genomes. These results support the notion that large viral genomes are important in producing new zoonotic disease, and suggest that genome size may be a useful surrogate in screening for potential zoonotic viruses.

    *注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用.

  • 原文来源：https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.10.986109v1
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    • 3月11日_更大的病毒基因组大小有助于人畜共患病的出现 1.时间：2020年3月11日 2.机构或团队：斯坦福大学 3.事件概要： bioRxiv预印平台于3月11日发布了斯坦福大学的文章“Larger viral genome size facilitates emergence of zoonotic diseases”。 文章称新型病毒疾病的出现与突变或重组事件有关。跨物种传播的可能性与病毒的表型可塑性及其产生可遗传变异后代的能力有关。该文章描述了将遗传变异性的产生与基因组大小增加联系起来的模型。将所有已知的人畜共患病毒基因组大小与已知的非人畜共患病毒基因组大小进行比较，表明了人畜共患病毒具有明显更大的基因组。文章称这些结果支持以下观点：大型病毒基因组在产生新的人畜共患病中很重要，并表明基因组大小可能是筛选潜在人畜共患病病毒的有用指标。 文章结论称其发现强烈表明，较大的基因组大小促进了病毒人畜共患病的出现。尽管巴尔摩分类系统每个组的病毒种类繁多，尽管没有考虑到在动物宿主物种之间共享或跳跃的病毒，但结果释放出的信号仍然很清新。文章讨论称，具有广泛宿主范围的病毒可能与引起人畜共患病的病毒具有共同的特征，并且基于这些结果，也应具有较大的基因组。例如，多种冠状病毒不直接参与人畜共患病，是非人畜共患病的病毒，但已知它们具有广泛的宿主范围。具体而言，一些蝙蝠冠状病毒包括在非人畜病患病的病毒中，尽管研究者在很大程度认为这些病毒与SARS和MERS 冠状病毒密切相关。大的基因组可能通过每个基因组复制的高突变量或重组的高概率来促进人畜共患病的传播。这两种过程都会产生变异，从而可能发生跨物种感染。 文章讨论称，在病毒组之间，复制策略存在很大差异，因此在产生导致人畜共患传播事件的遗传变异的主要策略中存在差异的可能。尽管dsDNA病毒每个核苷酸的突变率比dsRNA病毒的低100倍，但它们更大的基因组使复制过程中积累至少一个突变的可能性相当。冠状病毒已经发展了3'→5'端校对能力，以适应与大型基因组相关的突变。冠状病毒属于dsRNA病毒，dsRNA病毒是高度分段的，并且片段数量与基因组大小高度相关，这允许在共感染期间通过片段的重新排列实现高度重组，这类病毒由于在不连续转录过程中频繁进行模板切换，因此具有很高的同源重组水平。冠状病毒具有最大的RNA病毒基因组，可以以高重组率产生超过25％的重组后代。 *注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用。 4.附件： 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.10.986109v1
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