《COVID-19的移动网络模型解释感染人口之间差异并评估重新开放策略》

  • 来源专题:新发突发疾病(新型冠状病毒肺炎)
  • 编译者: 蒋君
  • 发布时间:2021-06-17
  • COVID-19大流行显著改变了人类的流动模式,因此需要建立流行病学模型,以捕捉这些流动性变化对SARS-CoV-2传播的影响。研究人员介绍了一个集合种群(SEIR)模型,该模型集成了细粒度、动态的流动网络,以模拟SARS-CoV-2在美国十大大都市地区的传播。该移动网络来自移动电话数据,将9.8亿人每小时的移动情况从社区(或普查区组)映射到餐馆和宗教机构等关注点,将56945个普查区组与552758个关注点连接起来,每小时的移动量为54亿。研究表明,通过整合这些网络,一个相对简单的SEIR模型可以准确地拟合真实的案例轨迹,尽管随着时间的推移人口的行为发生了实质性的变化。模型预测,少数“超级传播者”感兴趣的点占了感染的绝大多数,限制每个感兴趣点的最大占有率比统一减少流动性更有效。模型还正确地预测了弱势种族和社会经济群体中较高的感染率,这仅仅是流动性差异的结果:研究发现弱势群体并没有能够大幅降低他们的流动性,他们访问的兴趣点更拥挤,因此与更高的风险相关。通过捕捉谁在哪个地方被感染,模型支持详细的分析,可以提供对COVID-19更有效和公平的政策反应。

  • 原文来源:;https://www.nature.com/articles/s41586-020-2923-3
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  • 《基于空间网络的多城市流行病模型对印度COVID-19的应用》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2020-03-28
    • medRxiv预印平台于3月17日发表了印度普纳大学的题为“Multi-city modeling of epidemics using spatial networks: Application to 2019-nCov (COVID-19) coronavirus in India”的文章。文章称由于2019-nCov(COVID-19)冠状病毒的持续流行,目前迫切需要建立可靠的流行病学模型。但目前大多数现有的模型存在过于细粒度而导致效率低下和过于粗粒度而不可靠的问题。 该研究中,研究人员提出了一种计算效率高的混合方法,该方法使用了各个城市的SIR模型(易感-感染-恢复模型,Susceptible Infected Recovered Model),并耦合了各个城市的交通网络从而可以加强城市之间的迁移。研究人员指出该模型与现有模型有两个重要的不同之处:第一,耦合参数的自洽性的确定可便于维持单个城市的人口;第二,在迁移过程中加入与距离相关的时间延迟。研究人员将模型应用于印度的航空和铁路网络。研究结果预测,通过印度国内的运输系统,相当一部分人口在疫情暴发后90天内随时可能处于2019-nCov的暴露之中。因此,即使在限制了国际人口迁移之后,仍然有必要对印度国内运输网络进行认真的监督管理。 *注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。
  • 《辉瑞和默克公司讨论重新开放社会与社区一级对COVID-19进行实时评估的必要性》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2020-05-21
    • 5月15日,JAMA期刊在线发表了辉瑞和默克公司的观点文章“Reopening Society and the Need for Real-Time Assessment of COVID-19 at the Community Level”。 文章指出,快速社区调查已被世界卫生组织和其他组织广泛用于快速评估健康状况,例如免疫接种覆盖率或进行人口统计调查。在社区COVID-19快速调查中,将对选中的个人进行指定日期的询问,询问他们或他们的家庭成员是否具有COVID-19症状,是否曾寻就医、接受过检测、住院、重症监护室住院或经历了通气,以及家庭成员是否死亡。如果在调查时收集了血液样本和上呼吸道样本,则可以估算出具有SARS-CoV-2抗体的社区比例,以及过去和当前感染的有症状的社区比例。这些数据对于确定先前的社区缓解策略的有效性以及未来此类策略的方向至关重要。可以将快速调查中有症状的人的比例与血清学结果进行比较,以估计无症状感染SARS-CoV-2的人的比例。 文章指出,政策、公共卫生计划和干预措施制定需要对社区未来COVID-19情景进行预测。社区将需要预测未来的情景,以调整非药物干预措施的强度,并决定何时重新开放企业和学校。另外,有关基线免疫水平的信息对于规划疫苗和治疗剂的临床试验很重要。社区和血清流行病学调查与建模方法相结合是预测未来情况的有用工具。许多研究小组已经开发了国家和地方COVID-19情景预测模型。尽管这些模型一直存在争议,但社区和流行病学调查可以获取数据,减少基本假设的不确定性。 在社区一级对COVID-19的准确评估需要可靠的证据来证明接受过COVID-19检测的有症状人员的比例、无症状病例的比例、COVID-19累计发病率、住院患者的比例以及死亡比例。确定非药物干预以及开发COVID-19疫苗和治疗剂需要对抗体水平和群体免疫力进行连续测量。综合社区和流行病学调查,结合建模和乘数方法,以估计社区一级COVID-19的发病率和流行率,对于评估大流行的现状,规划当前的和未来的干预措施以及为社区逐步恢复到正常活动提供决策依据至关重要。