《比较代谢组学揭示了山羊在不同发育阶段的血清代谢物变化》

  • 来源专题:农业生物安全
  • 编译者: 刘小燕
  • 发布时间:2024-07-15
  • 山羊可以为人类提供肉、奶和皮,是具有高经济效益的牲畜。然而,尽管山羊具有经济意义,但对山羊血清代谢特征及其在整个发育过程中的复杂变化的全面分析仍然明显缺乏。为探究山羊生长发育过程中代谢物的阶段特异性和动态变化特征,本研究比较了雌性山羊不同发育阶段(1、60、120和180日龄;n=5)血清激素水平和血清生化标志物的变化。此外,还进行了血清非靶向LC-MS代谢组学分析。共有504个DAM被鉴定为年龄。结果表明,PE、PC、Lyso-PE、Lyso-PC和FAFHA可能在山羊出生后的脂质代谢中发挥重要作用。加权基因共表达网络分析(WGCNA)鉴定了两个代谢物模块(绿松石色和黄色)以及这些模块中与表型特征显著相关的关键代谢物。左旋肉碱可能是与山羊肌肉发育有关的代谢物。这项研究的结果表明,山羊血清代谢物在不同发育阶段存在显着差异。脂质和有机酸在山羊的不同发育阶段起着重要作用。
  • 原文来源:https://www.nature.com/articles/s41598-024-57803-7?error=cookies_not_supported&code=b6318d51-ec58-4ca6-9c9e-f829be4b399d
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  • 《Nature | 跨物种蛋白质组学图谱揭示了人类突触发育的可塑性》

    • 来源专题:战略生物资源
    • 编译者:李康音
    • 发布时间:2023-09-18
    • 2023年9月13日,加州大学旧金山分校LiWang及Arnold R. Kriegstein共同通讯在Nature 在线发表题为“A cross-species proteomic map reveals neoteny of human synapse development”的研究论文,该研究生成了人类、猕猴和小鼠新皮层突触发育的跨物种蛋白质组学图。 通过跟踪1000多个突触后密度(PSD)蛋白从妊娠中期到青年期的变化,该研究发现人类PSD成熟分为三个主要阶段,这些阶段由不同的途径主导。跨物种比较表明,人类PSD的成熟速度比其他物种慢两到三倍,并且在围产期含有更高水平的Rho鸟嘌呤核苷酸交换因子(RhoGEF)。人类神经元中RhoGEF信号的增强延迟了树突棘的形态成熟和突触的功能成熟,可能有助于人类大脑发育的新生特征。此外,PSD蛋白可以分为四个模块,发挥阶段和细胞类型特异性功能,可能解释它们与认知功能和疾病的差异关联。总之,突触发育蛋白质组学图谱为研究突触成熟的分子基础和进化变化提供了蓝图。 本文内容转载自“ iNature”微信公众号。原文链接: https://mp.weixin.qq.com/s/j1cPeGy0ebJWZng-RhSWXg
  • 《植物所揭示穗发育的关键调控因子及网络》

    • 来源专题:生物育种
    • 编译者:季雪婧
    • 发布时间:2023-11-21
    •     大麦(Hordeum vulgare L.)是重要的谷物,也是最古老的作物之一,属禾本科大麦属。大麦的花序为穗状花序,着生于茎秆顶部,由中央的花序轴和两侧的小穗所组成。大麦穗发育复杂,且不同位置的小穗发育不均等,中间部位发育较快,两端较慢。在穗发育过程中,单个穗子顶端和底部约30%-50%的小穗/小穗原基会发生退化,导致潜在籽粒数的损失。因此,研究大麦穗部的发育过程对于揭示花器官发育的生物学问题和提高大麦产量具有重要意义。     中国科学院植物研究所郭自峰研究组利用六棱大麦测序品种Morex绘制了穗部发育的时空转录组图谱。该图谱覆盖大麦穗部发育的17个阶段。各阶段的小穗从上到下分为5个部位——顶部、中上部、中部、中下部和底部。每个部位设置3个重复,共255个样本。科研人员分析这些样本的转录组数据发现,在5个部位共同表达的基因9228个,且根据表达模式分为15个cluster。不同cluster的表达峰值分布在不同的发育时期,调控小穗不同的发育过程。同时,该研究对所有cluster中的转录因子、激素相关基因和已知功能基因的进行相关性分析,发现了重要的节点基因,如编码海藻糖-6-磷酸磷酸酶(TPP)的HvTPP7基因、SHI家族转录因子VRS2及MADS家族转录因子HvAGL6基因等。这些基因可能在表达峰值时期参与重要的调控功能。研究对不同部位的差异表达分析发现,顶部位置的差异基因高达1043个,包含衰老相关蛋白、生长素和BR途径、植物特有的LOB转录因子家族等基因。     基于这一表达谱,科研人员鉴定到一个编码GDSL脂肪酶的HvGELP96基因。它在黄色花药期特异高表达,是大麦小穗育性和粒数的重要调控因子。转录图谱的发布,为研究大麦的穗部发育提供了丰富的信息资源。