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《植保所构建国际首个双生病毒-植物-昆虫数据库》

  • 来源专题：农业生物安全
  • 编译者： 李周晶
  • 发布时间：2023-05-31

  • 中国农科院植保所作物病原生物功能基因组研究创新团队联合浙江大学李飞教授团队构建了国际首个双生病毒-植物-昆虫数据库GPIBase（Geminiviridae-Plant-Insect Database），研究成果“GPIBase: A comprehensive resource for geminivirus-plant-insect research”在线发表于 Molecular Plant（IF =" 21.949）。该数据库提供了最完整的双生病毒、病毒寄主信息、病毒媒介遗传信息，病毒-植物-昆虫互作信息以及多种在线工具，可实现相关文献同步更新，并初步搭建了国际双生病毒研究人员社区。

    双生病毒科（ Geminiviridae ）病毒是全球范围内危害植物最严重的病原物之一，也是植物病毒中唯一具有孪生颗粒形态的单链环状DNA病毒，为双连体结构。双生病毒有520多种，可通过烟粉虱、叶蝉和蚜虫等传播，侵染多种重要经济作物，如棉花、番茄、烟草、木薯及各类瓜果等，在全世界农作物上引起严重病害，造成重大经济损失。

    GPIBase共包括五大主要模块：1）“Browse”：包括双生病毒、病毒宿主、病毒寄主以及病毒伴随卫星β信息的完整搜索与下载，同时详情界面提供了全面的基础与遗传信息；2）“Network”：将病毒-植物-昆虫的互作关系通过网络结构进行可视化，直观分析不同病毒、宿主和寄主的关系；3）“Phylogeny”：基于双生病毒全基因组序列比对，构建了目前最为全面的双生病毒科的系统发育关系；4）“Tools”：提供了BLAST功能进行病毒基因蛋白的比对与搜索；5）“Literature”：及时更新双生病毒相关的研究进展，同时通过分析双生病毒文献作者，初步构建了国际双生病毒研究人员社区。该数据库为双生病毒的后续研究提供了便捷和重要基础。

  • 原文来源：https://ipp.caas.cn/kyjz/21e02920c9e74c7bb02f6db81f59abe3.htm
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  • 《微生物所叶健团队揭示红光调控植物抗虫媒病毒新机制》
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    • 编译者：hujm
    • 发布时间：2021-01-13
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