《Nature | 不坦诚论文中使用ChatGPT会被发现吗?》

  • 来源专题:数智化图书情报
  • 编译者: 于彰淇
  • 发布时间:2023-12-07
  • 2022年11月底,OpenAI发布了一款聊天机器人:ChatGPT。ChatGPT是一种由人工智能(AI)驱动的工具,可以理解和生成类似人类语言习惯的文本。至今为止,它已经升级到了ChatGPT-4架构,可以用文字方式与用户互动,还可以用于处理相对复杂的工作,并且能够通过强化训练不断学习。

    如今,已有研究者利用ChatGPT进行科学论文的撰写,但并不是所有文章都会承认ChatGPT提供的帮助。那么,研究者在论文生成过程里使用ChatGPT,但却不在文章中披露,这一行为会被发现吗?

    一篇论文的构成有两位科学家做过一个尝试:在ChatGPT的帮助下,不到一个小时的时间就发表了一篇研究论文,这篇文章流畅,有见地,并以科学论文的预期结构呈现出来。但在该工具真正有用之前,仍然有许多障碍需要克服。

    研究人员设计了一个软件包,可以自动向ChatGPT提供提示,并基于其响应随着时间的推移不断改进论文。这种自主数据到论文系统,引导聊天机器人完成了一个反映科学过程的分步过程——从最初的数据探索到编写数据分析代码和解释结果,再到撰写精美的手稿。

    为了测试他们的系统,研究人员从美国疾病控制和预防中心的行为风险因素监测系统下载了一个公开的数据集,这是一个与健康相关的电话调查数据库。该数据集包括从25万多人那儿收集到的数据,主要关于其糖尿病状况、水果和蔬菜消费以及身体活动的信息。人工智能聊天机器人ChatGPT一直是制作研究论文的助手。图片来源:Ascannio/Shutterstock

    首先,系统要求ChatGPT编写数据探索代码。在第一次尝试时,聊天机器人生成的数据探索代码充满了错误并且不起作用。但当团队的系统检测到这些错误时,它会自动向ChatGPT发送提示,接着ChatGPT会修复代码。

    接下来,研究人员的这一系统促使ChatGPT制定一个研究目标。ChatGPT建议探索体力活动和饮食如何影响糖尿病风险。然后,研究人员继续要求ChatGPT创建一个数据分析计划和数据分析代码,并根据该代码的输出给出结果。ChatGPT很好地完成了这一任务,并得到结论:多吃水果和蔬菜以及锻炼与降低患糖尿病的风险有关。

    有了结果,系统就进一步指导ChatGPT撰写论文。它打开了两个ChatGPT对话。在其中一个例子中,该工具告诉聊天机器人它是一位科学家,并指示它撰写论文的每个部分。第二个ChatGPT则扮演审阅者的角色,为“科学家”版本的聊天机器人生成的文本提供建设性反馈。

    生成式人工智能工具的一个常见问题是它们倾向于通过编造东西来填补空白,这种现象被称为幻觉。为了帮助解决伪造参考文献的可能性,该团队允许ChatGPT访问文献搜索引擎,以便它可以生成具有正确引用的论文。

    ChatGPT生成了一份清晰的手稿和可靠的数据分析。但这篇论文并不完美。例如,耶路撒冷希伯来大学计算机科学家Tom Hope表示,该研究“解决了文献中的一个空白”——这句话在论文中很常见,但在本例中并不准确。他说,这一发现“不会让任何医学专家感到惊讶”。

    研究人员还担心,此类工具可能会让研究人员更容易从事P-hacking等不诚实行为,即科学家在数据集上测试多个假设,但只报告那些产生显著结果的假设。他补充说,另一个担忧是,使用生成式人工智能工具生成论文的便利性可能会导致期刊充斥着低质量的论文。

    尽管该团队的数据到论文方法展示了如何自主生成论文,但它也是专门设计用于创建论文来解释ChatGPT实现这一目标所采取的步骤,这意味着研究人员可以理解、检查和复制这些方法和研究结果。

    南澳大利亚大学开发人工智能教育技术的Vitomir Kovanovi?表示,研究论文中需要提高人工智能工具的可见度,否则将很难评估研究结果是否正确。“如果制造假论文如此容易,我们将来可能需要做更多的事情。”

    马萨诸塞州剑桥市麻省理工学院和哈佛大学博德研究所的计算生物学家 Shantanu Singh 表示,生成式人工智能工具有潜力通过执行简单但耗时的任务(例如编写摘要和生成代码)来加速研究过程,它们可能用于从数据集生成论文或提出假设。但由于研究人员很难发现幻觉和偏见,Singh 说,“我认为写一整篇论文——至少在可预见的未来——不会有特别好的用途。”

    没有披露AI帮助的手稿,正从同行评审员手中溜走8月9日,《Physica Scripta》杂志发表了一篇论文,旨在发现复杂数学方程的新解。这似乎是真的,但科学侦探Guillaume Cabanac在手稿的第三页上发现了一个奇怪的短语:“Regenerate response”。

    该短语是ChatGPT上按钮的标签。法国图卢兹大学的计算机科学家Cabanac立即在PubPeer(科学家们讨论已发表研究的网站)上发布了相关页面的屏幕截图。一些研究人员正在使用ChatGPT撰写论文,但没有透露它。图片来源:Jonathan Raa/NurPhoto via Getty

    英国布里斯托尔《Physica Scripta》出版商IOP Publishing的同行评审和研究诚信负责人Kim Eggleton表示,作者后来向期刊证实,他们使用ChatGPT来帮助起草手稿。在两个月的同行评审(论文于5月提交,修改版于7月发送)或排版过程中并未发现异常情况。出版商现已决定撤回该论文,因为作者在提交时没有声明他们使用了该工具。

    “这违反了我们的道德政策,”Eggleton说。伊斯坦布尔比鲁尼大学和贝鲁特黎巴嫩美国大学联合任职的Abdullahi Yusuf是通讯作者,但目前还没有回应《Nature》杂志的置评请求。

    “冰山一角”这并不是ChatGPT协助的手稿未经声明就溜进同行评审期刊的唯一案例。

    自4月以来,Cabanac标记了十几篇包含泄露ChatGPT短语“重新生成响应”或“作为人工智能语言模型,我……”的期刊文章,并将它们发布在PubPeer上。今年早些时候,ChatGPT的“重新生成响应”按钮在工具更新中更改为“重新生成”。

    包括Elsevier和Springer Nature在内的许多出版商都表示,作者可以使用ChatGPT和其他大型语言模型(LLM)工具来帮助他们制作稿件,只要他们声明即可。(《Nature》杂志的新闻团队在编辑上独立于其出版商Springer Nature。)

    搜索关键短语只会发现ChatGPT的原始而未声明的标记,其中作者忘记编辑掉明显的迹象。因此,使用未公开使用了ChatGPT的文章可能要多得多。“这只是冰山一角,”Cabanac说。

    Cabanac在Elsevier期刊上发表的一些论文中检测到了典型的ChatGPT短语。最新的一篇论文于8月3日发表在《Resources Policy》上,探讨了电子商务对发展中国家化石燃料效率的影响。Cabanac注意到论文中的一些方程没有意义,但在表格上方的话语暴露出了真相:“请注意,作为人工智能语言模型,我无法生成特定的表格或进行测试……”

    Elsevier发言人告诉《Nature》杂志,出版商“意识到了这个问题”并正在调查。该论文的作者分别来自中国沈阳的辽宁大学和北京的中国国际贸易经济合作研究院,他们没有回应《Nature》杂志的置评请求。

    令人毛骨悚然的流畅性论文全部或部分由计算机软件撰写,但作者没有披露这一事实,并不是什么新鲜事。

    然而,总部位于伦敦的英国研究诚信办公室的研究诚信经理Matt Hodgkinson表示,它们通常包含微妙但可检测的痕迹,例如特定的语言模式或误译的“折磨短语”,这些痕迹将它们与人类书写的对应物区分开来。但Hodgkinson表示,如果研究人员删除了ChatGPT样板短语,那么更复杂的聊天机器人的流畅文本“几乎不可能”被发现。“这本质上是一场军备竞赛,”他说,“骗子与试图将他们拒之门外者之间的较量”。

    Cabanac和其他人还在同行评审的会议论文和预印本(未经同行评审的手稿)中发现了ChatGPT的未公开使用。当这些问题在PubPeer上提出时,作者有时承认他们使用了ChatGPT来帮助创作。

    加利福尼亚州旧金山的微生物学家兼独立研究诚信顾问Elisabeth Bik表示,ChatGPT和其他生成性人工智能工具的迅速崛起将为论文工厂提供燃料——这些公司为希望提高出版产量的研究人员制作和销售假手稿。“这将使问题变得更糟一百倍,” Bik说,“我非常担心,已经涌入了大量我们甚至不再认识的论文。”

    极限拉扯期刊中未公开的法学硕士论文问题指出了一个更深层次的问题:时间紧张的同行评审员通常没有足够时长来彻底检查稿件是否存在危险信号。David Bimler以笔名Smut Clyde发现了假论文。“整个科学生态系统要么出版,要么灭亡,”前新西兰北帕默斯顿梅西大学的退休心理学家Bimler说,“看门人的数量跟不上。”

    Hodgkinson表示,ChatGPT和其他LLMs倾向于吐出虚假参考文献,这可能是同行评审员寻找手稿中使用这些工具的一个信号。“如果参考文献不存在,那就是一个危险信号,”他说。例如,Retraction Watch网站报道了使用ChatGPT编写的有关千足虫的预印本;该作品引用的一位研究人员发现了它,并注意到其引用是假的。

    哥本哈根国家血清研究所的微生物学家Rune Stensvold遇到了虚假参考文献的问题,当时一名学生向他索要一篇论文的副本,ChatGPT说是Stensvold在2006年与他的一位同事共同撰写的。但实际上根本不存在这篇论文。然后,当该学生要求人工智能聊天机器人推荐有关芽囊菌(一种肠道寄生虫属)的论文,聊天机器人却拼凑了一篇假的、带有Stensvold名字的参考文献。“它看起来很真实,” Stensvold说,“它告诉我,当我要审阅论文时,我可能应该首先查看参考文献部分。”

  • 原文来源:https://www.nature.com/articles/d41586-023-02477-whttps://www.nature.com/articles/d41586-023-02218-z
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    • 编译者:hujm
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    • 冠状病毒SARS-CoV-2变体出现在世界不同地区,其中的许多变体以惊人的速度传播。在一项新的研究中,一个国际研究小组在南非鉴定出一种传染性的SARS-CoV-2变体(下称SA变体)。相关研究结果近期发表在Nature期刊上,论文标题为“Emergence of a SARS-CoV-2 variant of concern with mutations in spike glycoprotein”。 论文共同作者、美国加州大学河滨分校医学院生物医学科学教授Adam Godzik说,“这些新的COVID-19变体是下一个新的前沿。其中,SA毒株和巴西毒株最令人担忧。它们的突变使它们对我们用现有疫苗产生的抗体产生抵抗性。人们普遍认为,我们正处于一场激烈的竞赛中:除非我们迅速给人们接种疫苗,并消灭这种流行病,否则新的变体将占据主导地位,以至于我们所有的COVID -19疫苗都将无效。” Godzik和两年前加入他的实验室的博士后研究员Arghavan Alisoltani-Dehkordi通过使用计算机模拟提供这种SA变体的刺突蛋白结构来帮助描述它。 Alisoltani-Dehkordi提到,南非夸祖鲁-纳塔尔大学和开普敦大学的研究团队从2020年10月15日至11月25日期间在南非三个省份收集的样本中发现了这种SARS-CoV-2的新谱系或变体,即SA变体。到2020年11月初,这种SA变体迅速成为来自其中两个省份的样本中的主导变体。 Alisoltani-Dehkordi说,“每种SARS-CoV-2变体都有特定的突变。Godzik教授和我利用计算机建模,提出了SA谱系中刺突蛋白突变的可能结构后果和功能后果。我们的分析,也得到了其他几个研究小组的证实,表明其中的一些突变可能导致这种病毒的更高传播性和较弱的免疫反应。” 至少有40个国家发现了这种SA变体,包括美国。Godzik说,“这种变体很可能在尚未测序的地区传播,因此尚未识别到。在美国,测序仍然是一个缓慢的过程。在该国的许多地区,包括加州的河滨市,我们没有任何关于这种变体的信息。” 对SA变体的初步研究表明,它可能对抗体产生抵抗性,这可能会降低疫苗的功效。Godzik说,“这时它受到了高度的关注。随后的研究证实它对疫苗有抵抗性,并且正在蔓延。不过,南非在通过隔离和其他措施控制这种变体方面做得很好。” 英国、南非、巴西和美国加州新出现的所有值得关注的SARS-CoV-2变体都显示出共同的突变特征。但这些变体中的每种也都有一套独特的突变。例如,SA变体和巴西变体分别在刺突蛋白K417N和E484K上有两个独特的突变。 Alisoltani-Dehkordi说,“我们的初步研究结果表明,一些刺突蛋白突变可能与SA变体的传播性增加有关。然而,在这种新的谱系中,刺突蛋白编码基因和其他基因组突变的全部意义还有待确定。需要强调的是,我们并没有足够的证据证实SA谱系与其他谱系相比有更高的疾病进展、严重性或死亡率。但与野生型相比,SA谱系和其他新近出现的谱系具有较高的传播性和不同寻常的分化性,这对SARS-CoV-2毒株的系统监测和在转为疫情暴发之前的变体早期发现提出了很高的要求。” Godzik解释说,不存在单一的COVID-19病毒。相反,存在一个不断进化的病毒群体。变体也会不断进化,获得突变,随时可能发生病毒逃逸。 他说,“很难说只有一种SA变体。理解这一点的一种方法是想象这种变体是一棵树的主要分支,该树有许多较小的分支。其中一些较小的分支可能比其他分支生长得更快,承担更多的重要性。这个动态过程很难预测。” Godzik预测COVID-19将成为我们生活中的常客,就像流感一样。他说,“开发一种流感疫苗需要六个月的时间。模型可以预测流感病毒的进化,疫苗在变体出现之前就会被生产出来。如果预测良好,疫苗就会发挥作用。如果预测出错了,一个沉重的流感季节就会随之而来。这就是COVID-19可能的表现。将会投入大量精力来预测下一年会发生什么,疫苗就会被更新,人们将需要强化疫苗注射。”
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    • 来源专题:中国科学院病毒学领域知识资源中心
    • 编译者:malili
    • 发布时间:2020-12-02
    • 再过一个月,就是新冠大流行暴发一周年了。截止到今天,全球已有58425681人感染,已有1385218人因新冠肺炎死亡。 病毒的源头虽然还未查明,但溯源工作一直在进行着。 北京时间11月24日,《Nature》头条新闻发布关于新冠病毒溯源工作的最新消息。 柬埔寨的一个研究团队在一个冷藏箱里的蝙蝠中发现了一种与SARS-CoV-2(新冠病毒)密切相关的冠状病毒。与此同时,日本的一个研究团队报告称,他们也在冷冻的蝙蝠粪便中发现了另一种密切相关的冠状病毒。 上述两种病毒是在中国以外发现的首个已知的新冠病毒近亲,这为世界卫生组织在亚洲各地寻找新冠大流行的动物来源提供了支持。强有力的证据表明,新冠病毒起源于蝙蝠,但它是直接从蝙蝠跨种传播给人类,还是通过中间宿主传播的,仍然是个谜。 2010年在柬埔寨北部捕获的两只shameli菊头蝠(Rhinolophus shameli)中发现了这种病毒。该病毒的基因组还没有完成测序,这项发现也没有被发表,因此很难确定它对大流行的全部意义。 柬埔寨巴斯德研究所的病毒学家Veasna Duong说,如果这种病毒与导致大流行的新冠病毒有非常密切的联系,甚至是它的祖先,那么它可以提供关于新冠病毒如何从蝙蝠传给人类的重要信息,并有助于寻找大流行的源头。Duong领导了柬埔寨的样本搜索,并于11月初提交给《Nature》杂志。研究人员说,要提供这样的见解,该病毒必须与新冠病毒共享97%以上的基因组。 法国巴斯德研究所的病毒学家Etienne Simon Loriere说,但这种新病毒的关系可能更为疏远,在这种情况下,对它的研究将有助于科学家们更多地了解冠状病毒家族的多样性。他计划对病毒进行测序,然后将其公开分享。 日本研究团队曾在2013年捕获的一只角菊头蝠(Rhinolophus cornutus)中发现的另一种病毒Rc-o319就是这种情况。澳大利亚悉尼大学的病毒学家Edward Holmes说,根据11月2日发表的一篇论文,这种病毒与新冠病毒只有81%的共享基因组,这使我们很难深入了解大流行的起源。 越南野生动物保护协会的进化生物学家Alice Latine说,无论柬埔寨的研究团队发现的是什么,这两项新发现都令人兴奋,因为它们证实了与新冠病毒密切相关的病毒在角菊头蝠中也相对常见,甚至在中国境外发现的蝙蝠中也是如此。世卫组织看过柬埔寨研究团队的一些分析,但没有参与调查。 Duong说:“这就是我们要找的。这既令人兴奋又令人惊讶。” 大流行的起源 浙江大学爱丁堡大学联合学院传染病专家Aaron Irving说:“这些发现还表明,其他尚未被发现的与新冠病毒有亲缘关系的病毒可能会被储存在实验室的冰箱里。他计划对储存的蝙蝠和其他哺乳动物样本进行新冠病毒抗体检测。 东京大学的病毒学家Shin Murakami说:“我没想到会找到新冠病毒的近亲。”Murakami是在新冠大流行之后决定重新检测冷冻动物样本中病毒的研究团队成员。 只有少数已知的冠状病毒与新冠病毒密切相关,包括已知最接近的RaTG13。它于2013年在中国云南的中华菊头蝠(Rhinolophus affinis)中发现,该研究于今年早些时候已经发表。在2015年至2019年间捕获的其他角菊头蝠和穿山甲中也发现了其他几种冠状病毒。科学家现在知道这些病毒与新冠病毒密切相关。 参与柬埔寨研究团队的美国加州大学戴维斯分校健康研究所副所长Tracey Goldstein说:“新冠病毒可能不是一种突然冒出来的全新病毒。这组病毒在我们2019年意识到它们之前可能就已经存在了。” Latinne说,这些发现证实了角菊头蝠是这些病毒的宿主。 柬埔寨的病毒 作为美国政府资助的“PREDICT”项目的一部分,Duong的团队在柬埔寨捕获了Shamel菊头蝠。PREDICT项目对世界各地的野生动物进行了数十年的跟踪调查,以寻找可能引发大流行的病毒,但于今年早些时候被特朗普政府终止。今年4月,美国国际开发署向该项目追加了300万美元,并延长了6个月,以在老挝、马来西亚、尼泊尔、泰国、越南和柬埔寨的实验室冰箱中寻找动物样本(主要是蝙蝠、穿山甲和其他动物)中发现新冠病毒的证据。这些调查的完整报告预计将在未来几周公布。 Duong说,对新蝙蝠病毒的一个短片段(324个碱基对)的初步基因组测序显示,它与新冠病毒和RaTG-13的的同一区域相似,表明这三个病毒是密切相关的。 Latinne说,这个区域在冠状病毒中高度保守,经常被用来快速识别病毒是新的还是已知的。但目前还不清楚究竟是RaTG-13病毒还是新病毒与新冠病毒的关系更为密切。 同样在柬埔寨巴斯德研究所工作的病毒学家Vibol Hul说,很难用这么小的片段来说明,大多数已知冠状病毒的基因组包含约3万个碱基对。Hul曾于2010年在一个洞穴的入口处捕获过Shamel菊头蝠。 柬埔寨巴斯德研究所的病毒学家Erik Karlsson表示,在另一项分析中,他们使用当地可用的技术对新病毒基因组的约70%进行了测序。该序列缺少有关病毒关键部分的信息,例如编码冠状病毒通常用于进入细胞的刺突蛋白(S蛋白)的基因。Duong说,对该部分进行测序将表明该病毒是否可以感染人类细胞。 Irving说,新病毒必须与新冠病毒至少有99%的相似度,才能成为当前大流行病毒的直接祖先。RaTG13和新冠病毒的基因组仅有4%的差异,表明它们拥有共同的祖先,但这种差异也代表了40至70年的进化过程。虽然相隔数十年,但这两种病毒非常相似,可以使用相同的受体进入细胞。细胞研究表明,RaTG13可以感染人类。 另一个近亲 Duong说,在已知与新冠病毒相关的冠状病毒中,新发现的Rc-o319似乎是关系最远的。 在细胞研究中,日本研究团队发现这种病毒不能与新冠病毒用来进入人体细胞的受体结合,这表明它不容易感染人。 Shin说,他的同事今年早些时候在日本捕获了更多的蝙蝠,并计划对它们进行冠状病毒检测。今年10月的时候,Hul回到柬埔寨北部的洞穴去捕捉更多的蝙蝠。 Holmes说:“生活在该地区的角菊头蝠种群中可能存在更多与新冠病毒相关的冠状病毒。希望其中一个或多个与新冠病毒密切相关,我们可以将其视为真正的祖先。”    (来源:中国生物技术网) 原文出处:Smriti Mallapaty. Coronaviruses closely related to the pandemic virus discovered in Japan and Cambodia[J].Nature. 23 NOVEMBER 2020. 链接:https://www.nature.com/articles/d41586-020-03217-0