2024年5月29日,东京大学的研究人员在 Nature 期刊发表了题为Structural basis for pegRNA-guided reverse transcription by a prime editor的文章。
由化脓性链球菌Cas9缺口酶(nSpCas9)和工程化的莫罗尼小鼠白血病病毒反转录酶(M-MLV RT)组成的质粒编辑器系统与质粒编辑引导RNA(pegRNA)合作,促进了活细胞中各种精确的基因组编辑。然而,由于缺乏结构信息,人们对主编辑引导的 pegRNA 反转录的分子机制仍然知之甚少。
该研究展示了 SpCas9-M-MLV RTΔRNaseH-pegRNA-target DNA 复合物在多种状态下的冷冻电镜结构。终止结构以及我们的功能分析显示,M-MLV RT 将反转录扩展到了预期的位点之外,导致支架衍生的结合,从而在靶基因座上造成了不希望的编辑。此外,启动前、启动和延伸状态的结构比较表明,在反转录过程中,M-MLV RT 相对于 SpCas9 保持一致的位置,而 pegRNA 合成的 DNA 杂复合物则沿着 SpCas9 的表面堆积。根据该结构见解,研究人员合理地设计了 pegRNA 变体和质粒编辑器变体,其中 M-MLV RT 与 SpCas9 融合。总之,该发现从结构上揭示了质粒编辑的逐步机制,并将为开发多功能质粒编辑工具箱铺平道路。