《COVID-19患者和未暴露个体针对SARS-CoV-2的T细胞反应靶标》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2020-05-21
  • 5月14日,Cell发表了来自拉霍亚免疫学研究所(LJI),加利福尼亚大学圣地亚哥分校,美国北卡罗来纳大学医学院,纽约西奈山伊坎医学院研究团队的题为“Targets of T cell responses to SARS-CoV-2 coronavirus in humans with COVID-19 disease and unexposed individuals”的文章。
    文章指出,了解对SARS-CoV-2的适应性免疫对于疫苗开发、发病机理研究以及大流行控制至关重要。该研究使用HLA I和II类预测的肽“巨池”,分别在约70%和100%的COVID-19康复患者中鉴定出循环中的SARS-CoV-2特异性CD8 +和CD4 + T细胞。CD4 + T细胞对刺突蛋白这种大多数疫苗研究的主要靶标的反应强烈,并且与抗SARS-CoV-2 IgG和IgA滴度的大小相关。M蛋白、刺突蛋白和N蛋白各自占总CD4 +反应的11%-27%,其他反应通常针对nsp3,nsp4,ORF3a和ORF8等。对于CD8 + T细胞,可识别到刺突蛋白和M蛋白,至少靶向8个SARS-CoV-2 ORF。重要的是,研究人员在约40%-60%的未暴露个体中检测到SARS-CoV-2反应性CD4 + T细胞,这表明“普通感冒”冠状病毒与SARS-CoV-2之间具有交叉反应性T细胞识别。

  • 原文来源:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)30610-3
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    • 编译者:zhangmin
    • 发布时间:2020-05-17
    • 1.时间:2020年5月14日 2.机构或团队:拉霍亚免疫学研究所(LJI)、加利福尼亚大学圣地亚哥分校、美国北卡罗来纳大学医学院、纽约西奈山伊坎医学院 3.事件概要: 5月14日,Cell发表了来自拉霍亚免疫学研究所(LJI),加利福尼亚大学圣地亚哥分校,美国北卡罗来纳大学医学院,纽约西奈山伊坎医学院研究团队的题为“Targets of T cell responses to SARS-CoV-2 coronavirus in humans with COVID-19 disease and unexposed individuals”的文章。 文章指出,了解对SARS-CoV-2的适应性免疫对于疫苗开发、发病机理研究以及大流行控制至关重要。该研究使用HLA I和II类预测的肽“巨池”,分别在约70%和100%的COVID-19康复患者中鉴定出循环中的SARS-CoV-2特异性CD8 +和CD4 + T细胞。CD4 + T细胞对刺突蛋白这种大多数疫苗研究的主要靶标的反应强烈,并且与抗SARS-CoV-2 IgG和IgA滴度的大小相关。M蛋白、刺突蛋白和N蛋白各自占总CD4 +反应的11%-27%,其他反应通常针对nsp3,nsp4,ORF3a和ORF8等。对于CD8 + T细胞,可识别到刺突蛋白和M蛋白,至少靶向8个SARS-CoV-2 ORF。重要的是,研究人员在约40%-60%的未暴露个体中检测到SARS-CoV-2反应性CD4 + T细胞,这表明“普通感冒”冠状病毒与SARS-CoV-2之间具有交叉反应性T细胞识别。 4.附件: 原文链接https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)30610-3
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    • 编译者:张虎
    • 发布时间:2020-05-28
    • 1.测定COVID-19恢复期患者的免疫学表型 对COVID-19恢复期成年患者和2015-2018年收集的非暴露人群外周血单核细胞(PBMCs)和血清样本进行侧向层析、SARS-CoV-2刺突蛋白受体结合域(RBD) ELISA、流式细胞检测。结果显示所有患者IgG阳性,绝大多数患者IgM、IgA阳性;CD3+细胞轻度增加;CD19+细胞轻度减少,CD4+ T细胞、CD8+ T细胞、CD3-CD19-细胞或CD14+CD16-单核细胞与非暴露组无明显差异。同时非暴露组HCoV-OC43和HCoV-NL63RBD呈现不同程度的IgG阳性。 2.构建SARS-CoV-2表位库 根据预测的SARS-CoV-2抗原表位,作者构建了不同的表位库(megapool,MP)——排除了刺突蛋白抗原、能够捕获50%总反应、用于预测主要HLA-ⅡCD4+ T细胞表位的CD4_R MP;覆盖整个刺突蛋白抗原的MP_S;针对12个主要HLA-Ⅰ等位基因(ⅠA、ⅠB)的CD8 MP_A和CD8 MP_B。 3.分析特异性T细胞应答反应 使用CD4_R MP或MP_S刺激PMBCs,通过流式检测TCR依赖的激活诱导标志物(AIM)定性或定量分析CD4+ T细胞应答反应。结果显示所有患者CD4+T细胞对SARS-CoV-2刺突蛋白和非刺突蛋白均存在明显的异性反应,且平均约有50%的反应针对刺突蛋白表位;有趣的是,非暴露组同样检测到刺突蛋白和非刺突蛋白特异性CD4+T细胞,说明存在交叉免疫反应。为进一步评估SARS-CoV-2 特异性CD4+T细胞的功能和分化情况,作者检测了MP刺激后的细胞因子水平,发现IL-2 、IFN-γ分泌增加,几乎没有IL-4、IL-5、IL-13或IL-17α表达,说明特异性CD4+T细胞是有功能的,且以TH1型为主。 类似地,使用CD8 MP_A、CD8 MP_B刺激PBMCs,通过检测AIM和细胞内细胞因子染色(ICS)分析CD8+T应答反应。结果显示70%患者CD69+CD137+阳性,ICS检测到IFNγ+CD8+T细胞,且大多数共表达颗粒酶B,少部分表达TNF,而不表达IL-10,说明COVID-19患者存在SARS-CoV-2特异性CD8+T细胞反应。 由于刺突蛋白是SARS中和抗体的主要靶标,且抗体依赖于CD4+T细胞的辅助发挥保护作用,于是作分析了CD4+T细胞与抗体之间的相关性。结果显示抗刺突蛋白RBD Ig和IgG与CD4+T细胞、CD4+T细胞与CD8+T细胞高度相关。 4.CD4+和CD8+T细胞SARS-CoV-2 ORF靶点的研究 作者设计了代表单一抗原的表位库用以进一步探究CD4+T细胞和CD8+T细胞靶向抗原。结果显示引起COVID-19患者特异性CD4+T细胞反应的主要有刺突蛋白(27%)、M蛋白(21%)和N蛋白(11%),nsp3, nsp4 and ORF8引起部分反应(大约各占5%);在非暴露组,主要由刺突蛋白(23%)、nsp14 (25%)、nsp4 (15%) 和 nsp6 (14%)引起CD4+T反应。与CD4+T细胞反应不同,引起COVID-19患者CD8+T细胞反应的有刺突蛋白(~26%)、N(~12%)、M(22%)、NSP6(15%)、ORF8(10%)和ORF3a(7%);未暴露组未显示明显的靶向抗原,提示冠状病毒CD8+T细胞交叉反应存在,但不如CD4+T细胞交叉反应广泛。