2025年3月12日,北京大学白洋团队在Cell 在线发表题为“Crop root bacterial and viral genomes reveal unexplored species and microbiome patterns”的研究论文,该研究利用作物根部细菌和病毒基因组揭示了未开发的物种和微生物组模式。 该研究通过将高通量细菌培养与宏基因组测序相结合,从小麦、水稻、玉米和苜蓿的根部构建了全面的细菌和病毒基因组集合。作物根细菌基因组收集(CRBC)显著扩展了公开可获得的作物根细菌基因组的数量和系统发育多样性,具有6,699个细菌基因组(68.9%来自分离物)和1,817个未定义的物种,将作物根细菌多样性扩展了290.6%。作物根病毒基因组文库(CRVC)包含9,736个非冗余病毒基因组,在作物根微生物组中有1,572个以前未报道的属级簇。该研究确定了土壤和宿主物种中富含的保守细菌功能,并揭示了作物根系生态系统中以前未探索的细菌-病毒联系。