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《HIV蛋白酶结构数据库》

  • 来源专题：艾滋病防治
  • 编译者： 李越
  • 发布时间：2005-03-02
  • HIV structual database & Chem-blast an archive of experimentally determined 3-D structures of Human Immunodeficiency Virus 1 (HIV-1), Human Immunodeficiency Virus 2 (HIV-2) and Simian Immunodeficiency Virus (SIV) Proteases and their complexes with inhibitors or products of substrate cleavage. It serves a global community of researches, educators and students
  • 原文来源：http://xpdb.nist.gov/hivsdb/hivsdb.html
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相关报告

  • 《HIV结构数据库》
    • 来源专题：艾滋病防治
    • 编译者：李越
    • 发布时间：2005-03-03
    • The HIV Sequence Database provides the HIV and SIV sequence data Collected since 1987 from Genbank,computer analysis of HIV and related sequences ,production of software for the analysis of (sequence) data ,publication of the data and analyses on this site and in a yearly printed publication and the HIV sequence Compendium, which is available free of charge.
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  • 《SARS-CoV-2（COVID-19）蛋白酶结构的刚性、正常模式和柔性运动》
    • 来源专题：生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者：hujm
    • 发布时间：2020-03-19
    • 英国巴斯大学的科研人员在bioRxiv预印版平台发表论文“Rigidity, normal modes and flexible motion of a SARS-CoV-2 (COVID-19) protease structure”，探讨了SARS-CoV-2（COVID-19）蛋白酶结构的刚性、正常模式和柔性运动。 最近已经报道了通过卵石博弈刚性分析（pebble-game rigidity analysis）、弹性网络结构模型和全原子模拟分析的SARS-CoV-2病毒的一种蛋白酶的两个晶体结构，病毒蛋白酶的这种计算研究遵循了在研究其他同二聚体酶中有效的方案。预测该蛋白酶在体内表现出柔性运动，其直接影响已知抑制剂结合位点的几何形状，并在结构的其他位置打开新的潜在结合位点。已经生成了代表晶体结构上自然柔性变化的生成的PDB文件的数据库，并可以从机构数据档案中下载该数据库。文章指出，该信息可能会为基于结构的药物设计和片段筛选工作提供信息，这些工作旨在为确定用于治疗COVID-19的特定抗病毒疗法打下基础。
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