《Nature|南极微生物可依靠微量气体生存》

  • 来源专题:中国科学院文献情报系统—海洋科技情报网
  • 编译者: mall
  • 发布时间:2017-12-22
  • 南极洲是地球上环境最严酷的地区之一,然而这里的微生物群落种类丰富,令科学家费解。新一期英国《自然》杂志刊登研究报告说,南极洲的一些微生物可在极端条件下依靠空气中微量的氢气、一氧化碳等气体存活。

      由澳大利亚新南威尔士大学领导的研究团队在南极洲东部的威尔克斯地和伊丽莎白公主地两处无冰区采集了土壤样本,两地都是原始极地荒漠,不存在能进行光合作用的植物。研究人员分析了在土壤表层生活的微生物的基因特征,并重建了23种微生物的基因组,包括两种以前未知的代号为WPS-2和AD3的细菌的基因组。

      分析显示,在土壤样本中占优势的细菌能利用空气中的氢气、一氧化碳和二氧化碳,为自己提供能量来源和碳。虽然空气中只存在微量的氢气和一氧化碳,但它们也有办法从空气中吸取这些气体分子。

      研究人员表示,这一发现对在其他行星上寻找生命有参考意义,即地球外的微生物也可能依靠微量气体生存,他们将进一步研究该现象在地球其他地方是否也存在。

相关报告
  • 《研究揭示微生物如何在海底洋壳中生存》

    • 来源专题:中国科学院文献情报系统—海洋科技情报网
    • 编译者:liguiju
    • 发布时间:2020-04-09
    • 伍兹霍尔海洋研究所(WHOI)的科学家们揭示了微生物是如何在数千英尺深的海底岩石中生存的。这项研究已发表在《自然》(Nature)期刊上。研究成果首次分析了来自深海海底的含有制造蛋白质指令的活性遗传物质——信使RNA,并结合酶活性的测量、显微镜、培养物和生物标记物分析,提供了微生物群落多样性的证据,这些微生物从活的和死的生物体中获取碳。 为找出生活在极端环境下的微生物,了解它们是如何生存的,科学家们乘坐科考船前往“亚特兰蒂斯岸”的水下山脊,历时三个月收集了来自下海底洋壳的岩石样本。该山脊横穿南印度洋,构造活动使得海底洋壳得以暴露,为在该领域开展研究提供了便利。WHOI的微生物学家Virginia Edgcomb提到,他们使用一种全新的混合方法,尽可能深入地研究这些样本。她是这个项目的负责人,也是这篇论文的合著者。 一些微生物似乎能在它们的细胞中储存碳,这样就可以应对碳短缺。还有一些研究表明,它们可以利用氮和硫来产生能量,生产维生素E和B12,循环利用氨基酸并从难分解的聚芳香烃中提取碳。这一罕见的观点扩展了对海底碳循环的看法。Edgcomb还提到,深层生物圈包括较浅的洋壳位置,即使代谢率非常低,也能产生数量可观的碳。 (刘思青 编译)
  • 《Nature:98%的人体肠道微生物组差异竟由环境决定》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2018-03-04
    • 关于与生俱来与后天培养(nature vs nurture)的问题延伸到了我们的微生物组(microbiome)---我们每个人携带的细菌(它们中的大多数是有益细菌)群体。接二连三的研究已发现我们的微生物组几乎影响到我们的健康的每一个方面;它的微生物组成因人而异,而且可能是包括从体重增加到情绪在内的一切的关键因素。一些微生物组研究人员认为,这种差异始于我们的基因上的差异;但是,如今,以色列魏兹曼科学研究所开展的一项大规模研究挑战了这一观点,并提供证据证实微生物组和健康之间的关联性可能比我们想象中的更加重要。相关研究结果于2018年2月28日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“Environment dominates over host genetics in shaping human gut microbiota”。 事实上,现行的假设一直认为遗传学在决定人与人之间的微生物组差异方面起着重要的作用。根据这一观点,我们的基因决定着我们的微生物组所占据的环境,并且每种特定的环境允许某些细菌菌株茁壮成长。然而,在这项新的研究中,这些研究人员令人吃惊地发现宿主的遗传因素在决定微生物组的组成方面起着微小的作用---仅导致人与人之间的微生物组差异的2%。 这项研究由来自魏兹曼科学研究所计算机科学与应用数学系Eran Segal教授实验室的研究生Daphna Rothschild、Omer Weissbrod博士和Elad Barkan博士以及魏兹曼科学研究所免疫学系Eran Elinav教授团队成员领导的。他们的研究结果是基于来自于大约1000名以色列人的一个独特的数据库,其中这些以色列人已参与一项关于个人化营养的纵向研究。以色列具有高度多样化的人口,这就为研究遗传差异的影响提供了一种理想的实验环境。除了遗传数据和微生物组组成之外,从每名研究参与者中收集的信息还包括饮食习惯,生活方式,药物和其他的测量指标。这些研究人员分析这些数据后得出结论:饮食和生活方式是塑造我们微生物组组成的最主要因素。 如果微生物组中的细菌群体不被我们的遗传因素所塑造,那么它们又如何与我们的基因相互作用来改变我们的健康?这些研究人员研究了微生物组与胆固醇、体重、血糖水平和其他临床参数数据库中的测量值之间的关联性。这项研究的结果是非常令人吃惊的:对于大多数这些临床参数而言,与细菌基因组的关联至少与作为宿主的人类基因组的关联性一样强,而且在某些情况下要强于与人类基因组的关联性。 根据这些研究人员的说法,这些发现为理解塑造我们微生物组的因素可能是理解和治疗许多常见健康问题的关键提供了坚实的证据。 Segal说,“我们不能够改变我们的基因,但我们如今知道我们能够影响---甚至是重塑---我们体内存在的不同类型细菌的组成。因此我们的研究结果是非常有前景的;它们提示着我们的微生物组可能是改善我们健康状况的一种强有力的手段。” 微生物组研究领域是相对较新的;魏兹曼科学研究所收集的这个1000名以色利人数据库是世界上最为广泛的数据库之一。Segal和Elinav认为随着时间的推移和随着新的研究数据添加到他们的研究和其他人的研究中,这些最新的发现可能会得到进一步验证,而且我们的微生物组、遗传因素和我们的健康之间的关联性将会变得更加清晰。