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《7月24日_科学家通过大规模化合物再利用发现SARS-CoV-2抗病毒药物》

  • 来源专题：COVID-19科研动态监测
  • 编译者： zhangmin
  • 发布时间：2020-07-28

  • 《自然》于7月24日发表了一篇关于通过大规模化合物再利用发现SARS-CoV-2抗病毒药物的已被接受出版但未经编辑的手稿。
    2019年，SARS-CoV-2的出现引发了一场严重肺炎样疾病的全球大流行，被称为2019冠状病毒病（COVID-19）。疫苗的研制可能需要至少12-18个月的时间，而批准一种新型抗病毒治疗药物的典型时间可能超过10年。因此，重新利用已知药物可以显著加快新疗法在COVID-19大流行中的应用。为此，美国桑福德•伯纳姆•普雷比斯医学发现研究所建立了一个包含约12000个临床阶段或FDA批准的小分子的已知药物库。该团队报告了对100个抑制病毒复制的分子的鉴定，包括21种显示剂量反应关系的已知药物。其中13种有效浓度可能与患者可达到的治疗剂量相当，包括PIKfyve激酶抑制剂apilimod2-4和半胱氨酸蛋白酶抑制剂MDL-28170、Z LVG CHN2、VBY-825和ONO 5334。值得注意的是，MDL-28170、ONO 5334和apilimod被发现可以拮抗人ipsc衍生的肺细胞样细胞中的病毒复制，而PIKfyve抑制剂在原代人肺外植体模型中也显示出抗病毒效果。由于该研究中发现的大多数分子已经进入临床，这些化合物已知的药理和人体安全性将有助于加速这些药物治疗COVID-19的临床前和临床评估。
    原文链接：
    https://www.nature.com/articles/s41586-020-2577-1

  • 原文来源：https://www.nature.com/articles/s41586-020-2577-1
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  • 《2月23日_基于生物活性的建模可识别针对SARS-CoV-2的抗病毒药物》
    • 来源专题：COVID-19科研动态监测
    • 编译者：zhangmin
    • 发布时间：2021-02-25
    • Nature Biotechnology于2月23日发表了美国国立卫生研究院和加拿大公共卫生署等机构的文章“Biological activity-based modeling identifies antiviral leads against SARS-CoV-2”，描述了基于生物活性的建模可识别针对SARS-CoV-2的抗病毒药物。 文章称，药物发现的计算方法，例如定量结构与活性之间的关系，依靠小分子的结构相似性可以推断生物活性，但通常仅限于在接近已知配体的化学空间中识别新的候选药物。该研究报告了一种基于生物活性的建模（BABM）方法，在这种方法中，跨多个试验建立的化合物活性谱被用作在其他试验中或针对新目标预测化合物活性的信号。通过基于高通量筛选数据识别寨卡病毒和埃博拉病毒的候选抗病毒药物，验证了此方法的有效性。然后应用BABM模型预测了311种对SARS-CoV-2具有潜在活性的化合物。在预测的化合物中，有32％的化合物在细胞培养活病毒分析中具有抗病毒活性，最有效的化合物在纳摩尔浓度范围内显示出半最大抑制浓度。大多数已确认的抗SARS-CoV-2化合物是病毒进入抑制剂和/或自噬调节剂。这些确认的化合物有潜力进一步开发为抗SARS-CoV-2疗法。 原文链接：https://www.nature.com/articles/s41587-021-00839-1
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  • 《10月15日_科学家开发新冠快速中和测试和抗病毒药物筛选平台》
    • 来源专题：COVID-19科研动态监测
    • 编译者：zhangmin
    • 发布时间：2020-11-16
    • 得克萨斯大学和吉利德科学公司的研究人员10月15日在Nature期刊发表题为“A nanoluciferase SARS-CoV-2 for rapid neutralization testing and screening of anti-infective drugs for COVID-19”的文章。 文章称，高通量平台将大大促进COVID-19血清学测试和抗病毒筛选。研究人员提出了一种高通量的SARS-CoV-2纳米荧光素酶（SARS-CoV-2-Nluc），它具有遗传稳定性，并且在培养细胞中的复制与野生型病毒相似。SARS-CoV-2-Nluc可在5小时内测量患者血清中的中和抗体活性，其结果与血小板减少中和试验（PRNT）一致。此外，使用SARS-CoV-2-Nluc感染人体ACE2受体（A549-hACE2）的A549细胞，证明了该测定可用于抗病毒筛选。使用优化的SARS-CoV-2-Nluc分析，研究人员评估了抗病毒药物和其他抗感染药物，并鉴定了奈非那韦、芦平曲韦、考比司他是最具潜力的SARS-CoV-2-Nluc抑制剂（浓度 0.77~2.74 µM）。相反，大多数经临床批准的抗病毒药，包括替诺福韦艾拉酚胺、恩曲他滨、索非布韦、雷迪帕韦和维帕他韦浓度高达10µM也无效。总的来说，这个高通量平台可用于SARS-CoV-2的快速中和测试和抗病毒药物筛选。 原文链接：https://www.nature.com/articles/s41467-020-19055-7
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