丙肝病毒和艾滋病毒合并感染的患者发展为肝硬化或肝代谢失调的概率是单独感染丙肝病毒患者后的3倍。临床上,持续病毒学应答(SVR)被认为是根除丙肝感染的指标,尽管还可能会再感染。治疗丙肝与艾滋病合并感染的临床医师一直不大愿意使用干扰素。然后肝脏疾病是HIV感染者死亡的第二大因素。