柯萨奇病毒A6(CV-A6)是与手足口病(HFMD)相关的新兴病原体。其遗传特征和致病性质在很大程度上是未知的。本文报告了2013年在中国东北地区手足口病患者中分离的39个循环CV-A6毒株。鉴定了CV-A6的三个主要簇,并且与CV-A6相关,主要来自上海,表明国内CV-A6毒株是造成中国东北地区出现手足口病的原因。对代表每个簇的四个全长CV-A6基因组进行测序并进一步分析。启动扫描检测表明,所有四种CV-A6-长春株最有可能是CV-A6原型Gdula与原型CV-A4或CV-A4相关病毒??之间的重组体,而重组模式与菌株相关但不同与中国其他地区隔绝。此外,不同的CV-A6毒株在小鼠模型中表现出不同的病毒复制,释放和发病能力。进一步的分析表明,病毒蛋白2C通过引起自噬和诱导细胞死亡来促成CV-A6的多种致病能力。这项研究报道了与手足口病相关的致死性和非致死性CV-A6株。 2C蛋白质区域可能在CV-A6毒株的致病性中起关键作用。