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《“全球科研项目数据库（ProjectGate）”正式上线》

  • 来源专题：中国科学院亮点监测
  • 编译者： liuzh
  • 发布时间：2018-12-12

  • 　　11月16日，由中国科学院西北生态环境资源研究院（筹）兰州文献情报中心开发建设的“全球科研项目数据库(ProjectGate)”正式上线，为系统了解全球主要国家科技部署和科研项目信息提供信息支持和决策支撑。

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相关报告

  • 《FishBase：鱼类研究数据库》
    • 来源专题：中国科学院文献情报系统—海洋科技情报网
    • 编译者：郭琳
    • 发布时间：2017-01-17
    • 据统计，FishBase数据库每月有超过50万的访问量。FishBase是全球最大的海洋生物门户网站。该门户网站于1998年建立，至今仍在不断的更新和扩展，研究人员及公众均可自由使用该网站。该数据包含超过3.3万个物种，逾30万个物种名和近6万张图像。建立该数据库的倡议是由国际海洋生物研究人员发起的，28年前在德国赫姆霍兹基尔海洋研究所（GEOMAR）建成。你想知道在哪里能找到Gadus morhua？你不知道这是什么？不知道也是正常的，因为这是鳕鱼cod这一物种的科学命名。不论以哪个名字在www.fishbase.org网站进行查询，均可给出大西洋鳕鱼这一物种的全面信息，对于其他33000物种而言亦是如此。 该项目的创始人之一，GEOMAR的Rainer Froese博士解释说：“FishBase的本质是一个科学项目。”该项目起始于上世纪80年代，1995年发布了第一张CD，1998年上线了第一版的FishBase数据库。Froese博士继续说：“当时的数据库约有15000物种，每月大概2000访问量，主要是来自于研究人员。”如今，该门户网站记录的物种数目已经显著增多，并增加了有关生长、饮食、繁殖及来源于文献资料的其他关键要素的信息，研究人员已不再是门户网站的主要用户。Froese博士表示：“所有人都在使用FishBase网站，无论是渔民、钓鱼者、学生、记者还是鱼类爱好者。”自2000年以来，FishBase一直由一个国际团队管理，其中也包括来自GEOMAR的代表。这些数据主要由来自菲律宾的专家团队输入，得到了全球科学家的支持。如今，FishBase提供 20余种语言的版本，可在全球范围广泛使用。 FishBase的未来在何处？Froese博士说：“每年有数百种新的鱼类物种被描述，另有许多新研究发表，因此还有大量的工作要做。”此外，Froese还审慎的表示，希望能开发可在移动设备上使用的版本，但就目前的情形而言还无法实现，因为FishBase主要是由研究项目和捐赠资助。在科学界，该项目受到了广泛的认可：2017年初，它被列为鱼类和渔业期刊引用最多的出版物第四名。 （郭琳 编译）
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  • 《昆明动物所与北京基因组所联合开发iDog数据库》
    • 来源专题：中国科学院亮点监测
    • 编译者：yanyf@mail.las.ac.cn
    • 发布时间：2019-01-10
    • 近日，由昆明动物所与北京基因组所合作开发的犬科动物数据库iDog正式上线。该项研究成果以“iDog：an integrated resource for domestic dogs and wild animals”为题在国际学术期刊Nucleic Acids Research在线发表。 　　家犬毫无争议是人类最好的朋友之一，同时也是许多人类遗传病的基础研究模型。iDog 是第一个家犬与野生犬科动物整合性资源数据库，它不仅提供了丰富的组学数据，基因组拼接数据，基因表达谱数据，犬类疾病及相关表型信息，同时，iDog 数据库还整合了序列比对工具用于线上数据分析，以及基因组浏览器用于数据可视化。iDog的建立不仅有利于全球范围内犬科动物的研究，同时还为大量的爱狗人士提供了一个用户友好的界面查找相关宠物狗信息。 　　iDog具有良好的可拓展性和持续性等特点，其包含的主要模块有基于127个家犬样本基因组重测序数据产生的变异信息数据库、含有32220个基因的犬科动物基因数据库、基于RNA-Seq测序数据的基因表达数据库、犬科动物相关疾病的文献数据库、人-狗疾病同源信息数据库、犬科动物基因组拼接数据库等。iDog计划后续整合更多的组学数据，在Dog10K项目的背景下，持续更新高质量的数据集，逐步转化成犬科动物基础研究的信息知识宝库。 　　中国科学院昆明动物研究所王国栋研究员和北京基因组研究所赵文明正高级工程师为共同通讯作者。该项目得到了中国科学院战略性先导科技专项、国家自然科学基金、国家重点研发计划、中国科学院国际伙伴计划、中国科学院“十三五”信息化专项、中国科学院关键技术人才项目、中国科学院青年创新促进会等基金资助。
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