《科研人员研发出恶性疟原虫中进行基因编辑的新型遗传操作工具》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者: huangcui
  • 发布时间:2019-01-03
  • 12月24日,国际学术期刊《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了中国科学院上海巴斯德研究所江陆斌研究组题为Epigenetic editing by CRISPR/dCas9 in Plasmodium falciparum 的最新研究成果。

    疟疾与艾滋病、结核病一起被列为全球三大传染性疾病。疟原虫是引起疟疾的真核病原微生物,其中恶性疟原虫的感染致死率最高。分子水平的遗传操作是研究恶性疟原虫病理学以及抗药机制的重要工具。然而,疟原虫中通过同源重组机制进行基因修饰的效率极低,而且恶性疟原虫缺乏可运行RNAi机制的关键原件,因而对疟原虫的研究急需发展一种高效简便的基因编辑工具。

    Cas9的两个关键酶活位点被突变后的dCas9保留了结合DNA功能,但是失去了切割DNA的功能。将dCas9与一些表观遗传修饰因子相偶联,可以高效地对特定基因进行转录水平的调节。江陆斌研究团队利用CRISPR/dCas9系统,在恶性疟原虫中成功构建了基于表观遗传修饰的新型基因编辑工具。分别将dCas9与恶性疟原虫乙酰转移酶(PfGCN5)和去乙酰化酶 (PfSir2a)融合表达。在特异性sgRNA 的引导下,dCas9重组蛋白可以在靶基因的转录起始位点(TSS)附近特异性调节染色质组蛋白乙酰化修饰水平,从而控制该基因表达的沉默或激活。运用此新型CRISPR/dCas9技术,该团队分别对恶性疟原虫感染人体红细胞的两个关键基因PfRh4和PfEBA-175成功地进行了表达调控,并诱导出相应的感染表型的变化。在此基础上,该团队进一步鉴定出恶性疟原虫生长必需基因PfSET1参与调节恶性疟原虫红内期生长过程的分子基础。该研究成果为恶性疟原虫基因编辑提供了新的有效的遗传操作工具,为恶性疟原虫功能基因组学研究提供了强大的遗传操作系统。

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    • 近日,一项刊登在国际杂志Nature Communications上的研究报告中,来自新加坡A*STAR研究所等机构的科学家们通过研究开发了一种名为C-G碱基编辑器(CGBE, C-to-G Base Editor)的基于CRISPR的基因编辑器,其或能帮助纠正诱发人类遗传性疾病的突变。 世界上每17个人中就有1个人会患上某种类型的遗传性疾病,很有可能你身边的人(亲戚、朋友或同事)就是全球受影响的4.5亿人中的一员;诱发这些障碍的突变是由多种突变因素所引起的,比如从太阳光照射到细胞内的自发错误等;机制目前为止,最常见的突变是单一碱基的替代,即DNA中的一个碱基(比如G)被另一个碱基(比如C)所取代,全球无数的囊性纤维化患者机体中就表现为碱基C替代了G,从而就导致缺陷蛋白的产生进而引发遗传性疾病的发生;在另外一种情况下,在血红蛋白中利用T来替代A则会引发镰状细胞性贫血。 为了修复这些替换,研究人员开发了一种特殊的基于CRISRP的基因编辑器,其或能精准地将基因组中的缺陷碱基C修改为所需的碱基G,这种CGBE编辑器的开发或为科学家们开发新型疗法来应对与人类疾病相关的约40%的单碱基替代提供了一定的希望,这些疾病包括囊性纤维化、心血管疾病、肌肉骨骼疾病和神经系统疾病等。 CGBE编辑器推动了科学家们广泛采用CRISPR-Cas9技术来使得对人类基因组进行“分子手术”成为可能,CRISPR-Cas9技术目前能用来干扰靶向基因,但当需要对特定序列进行精确更改时,这种技术的效率就会降低;而CGBE编辑器能通过实现有效和精准的基因改变来解决科学家们所面临的问题;其主要由三部分组成:1)修饰后的CRISPR-Cas9能定位突变的基因并将整个编辑器聚焦于这一基因;2)一种能从化合物种移除氨基基团的脱氨酶能靶向缺失的碱基C,并将其进行替换;3)最后,蛋白质能够开启细胞机制来利用碱基G取代有缺陷的碱基C;这就能够帮助研究人员实现从C到G的直接转换,并能纠正突变从而治疗人类遗传性疾病。 研究者Chew Wei Leong指出,CGBE基因编辑器是一项突破性的发明,其首次将碱基C直接转化为碱基G,这很有可能为与单核苷酸突变相关的遗传性疾病疗法的开发提供了新的思路和希望。研究者表示,患者的安全是最重要的,我们正在努力确保CGBE和CRISPR-Cas9模式在疾病模型研究中是有效且安全的,随后我们才能进一步应用于临床研究中。 最后研究者Patrick Tan教授说道,诸如CGBE等新型基因编辑器正在扩展不断增长的精确基因组编辑工具的套件,包括胞苷碱基编辑器(CBEs)、腺嘌呤碱基编辑器(ABEs)、CGBEs和prime编辑器等,这些技术结合在一起能对DNA进行精准且有效的工程化修饰,以便未来能用于进行研究、疾病修正,从而引领新型基因医学的新时代。