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《2017年阿尔及利亚的一种外来病毒血清型A谱系(A/AFRICA/G‐IV)引发的手足口病爆发》

  • 来源专题：新发突发疾病防治
  • 编译者： 张玢
  • 发布时间：2018-09-20

  • 本文描述了2017年在阿尔及利亚发生的手足口病（FMD）爆发期间收集的血清型A病毒的遗传特征。这是自1977年以来该国血清型引起的临床病例的首次报告。 产生基因组序列（包含8119个核苷酸）和三个另外的近完整基因组序列。 系统发育分析表明，这些病毒属于A/AFRICA/G‐IV谱系，与2009年至2015年间在尼日利亚流行的病毒关系最为密切。这些意外结果促使进一步研究确定了该病毒谱系引入北非的确切途径，以了解未来疾病侵入该地区的风险。

    本文已被接受发布并经过完整的同行评审，但尚未通过编辑，排版，分页和校对过程。引用本文为doi：10.1111 / tbed.13017

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  • 《2000-2022年引起泰国手足口病的肠道病毒A71、柯萨奇病毒A16和柯萨奇病毒A6的分子进化动力学》
    • 来源专题：新发突发传染病
    • 编译者：张玢
    • 发布时间：2023-10-16
    • 手足口病（HFMD）是全球，尤其是亚太地区的一种公共卫生威胁。肠道病毒 A71（EV-A71）、柯萨奇病毒 A16（CVA16）和 CVA6 是导致包括泰国在内的多个国家爆发手足口病的主要病原体。检索了 2000 年至 2022 年期间存入数据库的 385 个 VP1 核苷酸序列，其中包括 228 个 EV-A71、33 个 CVA16 和 124 个 CVA6，并使用贝叶斯系统发生法进行了分子进化鉴定。鉴定出的所有 EV-A71 均属于基因型 B、亚基因型 B4 和 B5，以及基因型 C、亚基因型 C1、C2、C4a、C4b 和 C5。分析表明，在过去二十年中，这些病毒共同流行，亚基因型也发生了变化。CVA16 被归入基因型 B1（主要是亚基因型 B1a），CVA6 被归入亚基因型 D3（1-4 支系）。EV-A71 基因型 B 和 C、CVA16 基因型 B1 和 CVA6 基因型 D3 的 tMRCA 分别为 1993.79、1982.62、1995.86 和 2007.31，这表明这些病毒很可能在手足口病病例被发现之前就已传入泰国并在泰国秘密流行。研究证实这些病毒在二十年观察期间的波动和周期性模式。这项研究深入揭示了分子流行病学的进化动态，为当前基因型匹配疫苗的选择、疫苗开发和实施提供了支持。
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    • 来源专题：农业生物安全
    • 编译者：刘小燕
    • 发布时间：2024-09-03
    • H5 进化枝 2.3.4.4 高致病性禽流感 (HPAI) 病毒在全球传播，威胁着家禽和公众健康。这些病毒的持续传播导致其基因和抗原性发生显著进化，形成了八个亚进化枝 (2.3.4.4a-h)。在这里，我们检查了决定两种 H5 疫苗株 H5-Re8 (进化枝 2.3.4.4g) 和 H5-Re11 (进化枝 2.3.4.4h) 之间抗原差异的抗原位点。表位图谱数据显示，所有八个已识别的抗原位点都位于两个经典抗原区域内，其中五个位点位于区域 A (位置 115、120、124、126 和 140)，三个位于区域 B (位置 151、156 和 185)。通过对具有不同替换数量的突变体进行抗原制图分析，我们确认这八个位点的突变组合可将 H5-Re11 的抗原性反转为 H5-Re8 的抗原性，反之亦然。更重要的是，我们的分析确定 H5-Re11_Q115L/R120S/A156T (H5-Re11 + 3) 是一种有希望的广谱疫苗候选物，位于抗原图的中心位置，并可能对进化枝 2.3.4.4 内的所有变体提供普遍保护。H5-Re11 + 3 血清的交叉反应性优于其他 2.3.4.4 疫苗产生的血清，H5-Re11 + 3 疫苗可为鸡提供 100% 的保护，以抵御来自各种 2.3.4.4 抗原组的抗原漂移 H5 病毒。我们的研究结果表明抗原区域 A 和 B 在H5 病毒中占免疫优势，并且抗原制图引导的疫苗设计是选择广谱疫苗的一种有前途的策略。
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