《SARS-CoV-2进入的穗状糖蛋白和宿主细胞决定因素及细胞病变效应》

  • 来源专题:新发突发疾病(新型冠状病毒肺炎)
  • 编译者: 蒋君
  • 发布时间:2021-03-01
  • SARS-CoV-2(一种冠状病毒)是导致COVID-19大流行的原因。SARS-CoV-2尖峰(S)糖蛋白三聚体介导病毒进入宿主细胞和细胞病变效应(合胞体形成)。我们研究了几种S糖蛋白特征对这些功能的贡献,重点研究了相关冠状病毒之间的差异。SARS-CoV-2 S糖蛋白获得弗林蛋白酶切割位点降低了病毒的稳定性和感染性,但极大地增强了合胞体形成能力。值得注意的是,在全球主要的SARS-CoV-2菌株中发现的D614G变化增加了传染性,对ACE2受体的反应性适度增强,对中和血清的敏感性增强,并且S1亚基与三聚体的结合更紧密。显然,SARS-CoV-2 S糖蛋白的这两个特征,弗林蛋白酶切割位点和D614G,已经发展以平衡病毒的感染性,稳定性,细胞病变性和抗体易感性。尽管病毒进入或合胞体形成并非绝对需要S2亚基的内结构域(胞质尾巴),但胞质尾巴中棕榈酰化半胱氨酸残基的改变降低了这些过程的效率。由于蛋白水解切割有助于SARS-CoV-2 S糖蛋白的激活,因此我们评估了蛋白酶抑制剂抑制S糖蛋白功能的能力。基质金属蛋白酶抑制剂可抑制S介导的细胞间融合,但不能抑制病毒进入。基质金属蛋白酶抑制剂与TMPRSS2之间的协同作用表明,两种宿主蛋白??酶都可以在合胞体形成过程中激活S糖蛋白。

    有效和持久的SARS-CoV-2疫苗的开发对于对抗日益增长的COVID-19大流行至关重要。SARS-CoV-2峰值(S)糖蛋白是中和病毒感染或疫苗接种后引发的抗体的主要靶标。了解尖峰糖蛋白的进化,功能以及与宿主因素的相互作用将有助于研究人员开发有效的疫苗免疫原和治疗方法。在这里,我们确定了峰值糖蛋白的关键特征,包括弗林蛋白酶切割位点和D614G自然突变,这些特征可调节病毒的细胞病变效应,感染性和抑制敏感性。我们还确定了宿主金属蛋白酶的两种抑制剂,它们能阻止S介导的细胞-细胞融合,该过程有助于破坏病毒感染的细胞。

相关报告
  • 《SARS-CoV-2通过两条关键的代谢途径在宿主细胞中快速复制》

    • 来源专题:人类遗传资源和特殊生物资源流失
    • 编译者:yanyf@mail.las.ac.cn
    • 发布时间:2021-03-20
    • 当导致COVID-19的SARS-CoV-2病毒感染人体细胞时,它会通过抓住细胞现有的代谢机制迅速开始复制。受感染的细胞大量生产病毒基因组和蛋白质,同时停止自身资源的生产。来自布里格姆妇女医院(BWH)、麻省总医院(MGH)、麻省理工学院布罗德研究所和哈佛大学的研究人员,在感染病毒后不久就研究了培养细胞,现在对病毒吸收的代谢途径有了更多的了解。该研究结果发表在《自然通讯》杂志上,强调了甲氨蝶呤等药物的潜在治疗益处,它可以抑制叶酸和被病毒占据的单碳代谢途径。 “我们缺乏这个流行的一件事是可以口服药物,预防剂,之前有人住院,甚至在他们感染之前,“说通讯作者本杰明•辛BWH的传染病专家和准成员的传染病和微生物项目广泛。“单克隆抗体有很多希望,但需要静脉注射。阻断病毒赖以复制的代谢途径可能是早期治疗患者的新策略。” 为了确定目标的代谢途径,研究人员获得了病毒样本,并在位于布罗德研究所(Broad Institute)的生物安全三级实验室(BSL-3 laboratory)高度保护设施中进行培养。然后,他们与该研究所成员、Broad代谢项目的联席主任、MGH分子生物学家、资深合著者Vamsi Mootha的实验室合作,应用质谱方法识别健康细胞和受感染细胞消耗和产生的资源。他们在感染八小时后的“月食点”研究了被感染的细胞,此时病毒已经开始制造RNA和蛋白质,但还没有对宿主细胞的生长和生存产生严重影响。 通过分析这些细胞产生的氨基酸和数千种化学代谢物,研究人员观察到,受感染的细胞耗尽了葡萄糖和叶酸的储存。他们证明,SARS-CoV-2病毒将葡萄糖生产的基本成分转移到嘌呤碱基的组装上,而嘌呤碱基是制造大量病毒RNA所必需的。此外,他们发现用于代谢叶酸的单碳通道异常活跃,从而为病毒提供了更多的碳基,用于制造DNA和RNA的碱基。 甲氨蝶呤等抑制叶酸代谢的药物通常用于治疗关节炎等自身免疫性疾病,可能是COVID-19的候选者。目前,甲氨蝶呤正在被评估为一种治疗COVID-19晚期感染所伴随的炎症的药物,但研究人员建议,它在早期也可能有益。他们的研究还发现,当它与抗病毒药物瑞德西韦一起使用时,可以产生协同效应。然而,甲氨蝶呤的免疫抑制特性可能使其作为预防用药具有挑战性。研究人员需要确定如何在不显著损害患者自然免疫反应的情况下最大化药物的抗病毒效果。 尽管如此,Gewurz指出,口服抗病毒药物是COVID-19疗法库的重要补充,既可作为感染的即时治疗手段,也可防御新型变种病毒和其他冠状病毒。 Gewurz说:“我们希望最终能够找到一种方法,阻止病毒利用细胞的代谢途径复制自己,因为这可能限制病毒进化耐药性的能力。”“我们开始看到新的病毒变种,我们希望我们能走在这一步之前——在病毒有机会复制自身并对抗体产生耐药性之前治疗患者。” 这项研究得到了国家过敏和传染病研究所、国家癌症研究所、国家普通医学科学研究所、EMBO、巴罗斯·惠康医学科学职业奖、霍华德·休斯医学研究所和MassCPR的支持。
  • 《Science | 靶向膜蛋白降解的细胞决定因素》

    • 来源专题:战略生物资源
    • 编译者:李康音
    • 发布时间:2023-10-23
    • 2023年10月20日,美国斯坦福大学化学系的Carolyn团队在杂志Science上发表了题为Elucidating the cellular determinants of targeted membrane protein degradation by lysosome-targeting chimeras的文章。该研究为下一代LYTACs的设计策略提供了信息,并阐明了细胞表面受体的占用和运输的各个方面。 该研究使用了全基因组CRISPR敲除方法来识别人类细胞中LYTAC介导的膜蛋白降解的调节因子。研究人员发现retromer基因通过减少LYTAC向质膜的循环来改善靶标降解。类泛素化的cullin-3促进LYTAC复合体溶酶体成熟,是LYTAC疗效的预测标志物。大量细胞表面CI-M6PR仍被内源性m6p修饰的糖蛋白占据。 总的来说,retromer复合物基因的破坏减少了CI-M6PR-LYTAC复合物从核内体到质膜的循环,并将溶酶体降解比率提高到90%以上。 本文内容转载自“自噬之路”微信公众号。 原文链接: https://mp.weixin.qq.com/s/4B_walIJDyatxiwJ9Mo7VA