2024年7月18日，华盛顿大学西雅图分校的研究人员在Science发表题为Binding and sensing diverse small molecules using shape-complementary pseudocycles的文章。
该研究介绍了一种设计高亲和力小分子结合蛋白以实现下游传感的方法。研究人员使用深度学习生成的假环，其重复结构单元围绕着中心结合口袋，口袋的形状千差万别，取决于重复单元的几何形状和数量。研究人员将感兴趣的小分子与这些伪循环中形状最互补的部分对接，设计出具有高结合亲和力的相互作用表面，并通过实验筛选出具有最高亲和力的设计。
该研究获得了四种不同分子的结合剂，包括极性灵活的甲氨蝶呤和甲状腺素。利用模块化重复结构和中心结合口袋的优势，研究人员构建了化学诱导二聚化系统和低噪声纳米孔传感器，方法是将设计分割成在添加配体后可重新组装的结构域。
