《突破:科学家证实人类细胞内存在全新的DNA结构》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2018-04-26
  • 科学家首次发现活细胞中从未出现过新的DNA结构。在活细胞中被描述为DNA“扭曲的结”证实了我们复杂的遗传密码是用比双螺旋结构更复杂的对称设计的,这些分子变异的形成影响了我们的生物学功能。

    澳大利亚加文医学研究所的研究员表示:“当我们大多数人想到DNA时,我们想到的是双螺旋,这项新的研究提醒我们,完全不同的DNA结构存在,而且很可能对我们的细胞很重要。”

    研究小组发现的全新DNA组件被称为i-motif结构,该结构最初是由研究人员在上世纪90年代发现的,但此前一直在试管中发现,不是在活细胞中。通过此次研究我们知道在人类细胞中,i-motif是自然发生的,这意味着结构对细胞生物学的重要性,需要研究者们新的关注。

    人们通常对DNA最熟悉的结构就是双螺旋螺旋结构,但是i-motif是DNA的四个链结,它与双螺旋结构非常不同。

    根据研究人员的说法,i-motif只是众多DNA结构中的一个,它没有采用双螺旋形式,这也可能存在于我们的细胞中。在这项新研究中,研究人员开发了一种抗体片段,称为iMab,可以明确识别并绑定到i-motifs。在这样做的过程中,它用免疫荧光法突出了它们在细胞中的位置。

    “最让我们兴奋的是,我们可以看到这些绿色的斑点,随着时间的推移而出现和消失,所以我们知道它们正在形成、溶解,再形成。虽然关于i-motif结构的功能还有很多东西需要了解,但研究结果表明,在细胞的“生命周期”中,短暂的i-motif通常形成于晚期, “i-motifs”也倾向于出现在所谓的“启动子”区域,即控制基因是否开启或关闭的DNA区域,以及端粒,与衰老相关的遗传标记。”

    因此,这些结构的形成可能对细胞正常运作至关重要。而且,这些结构中的任何畸变都可能有病理结果。研究发现发表在《自然化学》杂志上。

  • 原文来源:http://news.bioon.com/article/6721213.html
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    • 科学界最慷慨的奖项——突破奖公布了2019年获奖者名单。生命科学、基础物理学(包括一项特别奖)、数学三个大奖的共7个奖项、2100万美金,授予了对治疗由基因原因引发的婴儿死亡、超高分辨率成像、新型的电子材料、发现脉冲星做出重大成就的9位科学家,其中华人科学家庄小威、陈志坚与其他三位科学家分享生命科学奖。 弗兰克·本内特(Frank Bennett)和阿德里安·克赖纳(Adrian Krainer),安吉丽卡·阿蒙(Angelika Amon), 庄小威, 以及陈志坚获得2019年突破奖生命科学奖。 查尔斯·凯恩(Charles Kane)与尤金·米尔(Eugene Mele)2019年突破奖基础物理学奖,乔斯琳·贝尔·伯内尔(Jocelyn Bell Burnell)获得基础物理学奖特别奖。 2019年突破奖数学奖被授予文森特·拉福格(Vincent Lafforgue)。 还有6位在物理学和数学领域处于事业早期阶段的杰出青年科学家获得了总计60万美元的“新视野”奖,其中包括中国数学家许晨阳。 所有的获奖者,包括前不久公布的基础物理特别突破奖得主乔斯琳·贝尔·伯内尔都将参加11月4号周日举行的全网直播颁奖典礼。 生命科学奖 C·弗兰克·本内特(C. Frank Bennett),来自 Ionis制药公司(Ionis Pharmaceuticals);阿德里安·R·克赖纳(Adrian R. Krainer),来自冷泉港实验室(Cold Spring Harbor Laboratory)。 获奖理由:开发出一种有效的反义寡核苷酸疗法,用于治疗患有神经退行性疾病脊髓性肌萎缩症(spinal muscular atrophy,SMA)的儿童。 脊髓性肌萎缩症是一种罕见但具有破坏性的疾病,是导致婴儿死亡的主要遗传病因。许多患有脊髓性肌萎缩症的孩子会在两岁前死去。现在,患上脊髓性肌萎缩症已不再意味着死亡。药理学家C·弗兰克·本内特和生物化学家阿德里安·R·克赖纳基于他们对反义技术和RNA剪接的自然过程的发现,研发出第一种治疗脊髓性肌萎缩症的药物——Nusinersen(商品名为Spinraza,由Biogen经销)。此种药物于2016年获得FDA批准,是目前正在研发中的首批针对家族性自主神经功能障碍(FD)、胶质母细胞瘤和肝癌的新型反义疗法之一。这项工作也为使用基因沉默新疗法治疗亨廷顿氏症、肌萎缩侧索硬化症、脊髓小脑性共济失调、帕金森病和阿尔茨海默病创造了可能。本内特的家人在美国新墨西哥州阿兹台克经营酒店,他在那里长大;但在辅导员的鼓励下,他转而追求药理学研究事业,致力于寻找治愈严重疾病的方法。 克赖纳是东欧后裔,在乌拉圭蒙得维的亚长大;他崇敬孟德尔的科研工作,在高中时期就对遗传学产生了兴趣。 2004年开始联手研究脊髓性肌萎缩症之前,本内特和克赖纳就已经熟悉了彼此的工作,目前他们继续着合作关系。 安吉丽卡·阿蒙(Angelika Amon),来自麻省理工学院和霍华德·休斯医学研究所。 获奖理由:明确非整倍性(aneuploidy)的影响,这是一种染色体数目异常,由染色体分裂错误导致。 多出一条染色体可能引发极其严重的后果(如唐氏综合征、流产等)。实际上,在所有的癌症种类中,有80%存在染色体多余或缺失。出生于维也纳的分子生物学家安吉莉卡·阿蒙证明,不规则的染色体数目(即非整倍性)引发了一种应激反应,干扰了细胞的故障保险和错误修复系统——这反过来又导致基因突变快速累积。她希望对非整倍性的理解能让我们更好地了解癌症发展,并有助于识别新的癌症治疗靶点。阿蒙的行事准则被她自己称为“奶奶测试”——一个想法必须能够被简单地解释,才能引起她的兴趣。她提出简单的问题,得到了不起的答案。 庄小威(Xiaowei Zhuang),来自哈佛大学和霍华德·休斯医学研究所。 获奖理由: 开发极高分辨率成像技术,发现细胞隐藏的内在结构,这种方法超越了光学显微镜的空间分辨率限制。 庄小威是个神童。六岁的时候,她就能认识到施加在一杯水上的大气压,这令她在中国顶尖科技类大学担任空气动力学教授的父亲印象深刻。多年后,在显微成像技术黄金时期的黎明,在斯坦福大学做博士后的她将对物理学的兴趣转向了生物成像和对生物系统的探索。在哈佛大学庄小威自己的实验室里,她发明了一种超高分辨率成像方法(即随机光学重构显微术,STORM),利用状态可切换的荧光分子打破了传统显微镜的衍射限制。实验得到了分子和细胞结构的超高分辨率图像,这些细胞和分子的大小只有人类头发直径的万分之一。借助STORM技术,她的实验室发现了原本未知的细胞结构,例如大脑中的神经元内部周期性的膜骨架。 陈志坚(Zhijian “James” Chen),来自得克萨斯大学西南医学中心和霍华德·休斯医学研究所。 获奖理由:阐明了DNA通过DNA感受酶cGAS从细胞内部触发免疫及自身免疫反应的机制。 T细胞和其他类型的白细胞是免疫系统的一线“斗士”。陈志坚的研究为我们揭开了一种基础性先天免疫系统的面纱——这一系统能够将我们身体中的每个细胞调动或者重启,从而去对抗来自病毒、应激、辐射或其他方面的损害。陈志坚的实验室证明:由入侵者携带进来的(或从细胞核渗透出的)DNA会被一种特定蛋白识别,最终激活T细胞和白细胞。他目前正在研究将这种强大力量化为己用的方法,以期阻止疾病(例如癌症)的发展;同时他也希望能够在这种力量走上“弯路”导致自身免疫疾病(例如关节炎和红斑狼疮)发生时,找到控制它的途径。陈志坚在中国福建省一个偏远的山村中长大,在童年时代就表现出了对大自然的天生好奇心,并受到父母的鼓励从事科学研究。他后来移民美国并在纽约州立大学布法罗分校获得博士学位。他认为科学没有国界,疾病是我们共同的敌人。 “生命科学突破奖的获奖者向我们展示了他们的杰出工作,”评委会主席柯里·巴格曼(Cori Bargmann)说。 “他们用创造、革新、坚持和技艺,给世界带来了以往难以想象的进步。” 基础物理学奖 查尔斯·凯恩(Charles Kane)和尤金·米尔(Eugene Mele),均来自宾夕法尼亚大学。 获奖理由:提出了物理学中关于拓扑学和对称性的新观点,并预测出一类表面导电、内部绝缘的新材料。 在本·富兰克林之后,我们一直根据物质能否导电,将其划分为导体和绝缘体。现在,凯恩和米尔的研究颠覆了这一观念。他们预测了一类新的物质——拓扑绝缘体(topological insulator)。这类物质内部是绝缘体,而表面却是良好的导体。拓扑绝缘体的发现对量子计算领域的“军备竞赛”有着重要意义,在此基础上,有可能研制出计算能源效率极高的新一代电子设备。拓扑绝缘体展现出与基本物理粒子(如电子、光子)类似的激发态,而且在实验室中的操控性也优于后者。因此,拓扑绝缘体为我们更深入地理解物质与能量的基本性质打开了一扇新窗口。这一联系也为我们提供了全新的概念框架,帮助我们控制不同物质状态中电荷、光甚至是机械波的流动。 此外,预期之外的应用同样值得期待。正如1947年晶体管刚刚诞生时,没有人能预料到,它引领了几十年后的信息技术革命,使得用小小的芯片存储太字节的数据成为现实。 “凯恩和米尔为量子物理中的拓扑学提出了新思路,”评委会主席爱德华·威滕说,“当故事展现在人们面前时,我们才意识到它有多么优美。” 数学奖 文森特·拉福格(Vincent Lafforgue),法国国家科学研究院,格勒诺布尔大学。 获奖理由:他在数学几个领域内的开创性工作,特别是函数域中对朗兰兹纲领的贡献。 一直以来,法国都盛产伟大的数学家。从笛卡尔、费马、帕斯卡到庞家莱,不一而足。到了近代,韦伊、塞尔、格罗滕迪克的工作为代数几何奠定了新基础,并从中诞生了算数几何。拉福格是算数几何领域的领袖,是密码学和信息安全技术新发现的核心人物。拉福格的学术研究在位于格勒诺布尔的法国国家科学研究院(CNRS)开展,这里是欧洲最大的基础科学研究机构。作为CNRS的终身教职拥有者,他能够自由地探索那些看似不可能的问题。出于对生态危机的深深担忧,现在拉福格的研究重点是将算子几何与量子力学结合,以及设计清洁能源的新材料。 “文森特·拉福格在函数域中发现了一个优美而直接的证明,”评委会主席理查德·泰勒说,“看到他的解释后,你会问自己,为什么这么久以来,所有人都与它擦肩而过。最终,你可以看到朗兰兹对应为什么必须存在,它不再只是复杂计算的动机不明的结论。” 科学突破特别奖——基础物理学奖 乔斯琳·贝尔·伯内尔(Jocelyn Bell Burnell),来自邓迪大学、牛津大学。 获奖理由:她对发现脉冲星做出了基础贡献,一生都是科学界鼓舞人心的领袖。 此外,还有6位在物理学和数学领域处于事业早期阶段的杰出青年科学家获得了总计60万美元的“新视野”奖,其中包括中国数学家许晨阳。 物理新视野奖 布赖恩·梅茨赫尔(Brian Metzger)-哥伦比亚大学。 获奖理由:他对中子星合并的电磁信号做出了开创性预测,领导了新兴的多信使天文学领域的发展。 拉娜·阿迪卡里(Rana Adhikari)-加州理工学院;莉萨·巴尔索蒂(Lisa Barsotti)-麻省理工学院;马修·埃文斯(Matthew Evans)-麻省理工学院。 获奖理由:为研究当前和未来的地面引力波探测器做出贡献。 丹尼尔·哈洛(Daniel Harlow)-麻省理工学院;丹尼尔·L·贾弗里斯(Daniel L. Jafferis)-哈佛大学;阿龙·沃尔(Aron Wall)-斯坦佛大学。 获奖理由:对于量子信息、量子场论和引力的基本理论做出贡献。 数学新视野奖 许晨阳 -麻省理工学院、北京国际数学研究中心。 获奖理由:为最小模型程序(minimal model program)和代数簇的模( moduli of algebraic varieties)的应用的研究进展做出主要贡献。 卡里姆·阿迪普拉斯托(Karim Adiprasito)-耶路撒冷希伯来大学;琼·于(June Huh)-高等研究院。 获奖理由:他们与埃里克·卡茨(Eric Katz)合作发展了组合霍奇理论(combinatorial Hodge theory),罗塔猜测(conjecture of Rota)的对数凹因此得以解出。 凯萨·马托玛奇(Kaisa Matomäki)-图尔库大学;马克瑟姆·拉齐维尔(Maksym Radziwill)-加州理工学院。 获奖理由:他们在理解积性函数值的局部相关性上做出了基本突破。 关于科学突破奖 科学突破奖用以表彰全世界最杰出的科学家,这是科学突破奖颁发的第七个年头。科学突破奖分为生命科学奖(每年最多四个奖项)、基础物理奖(每年一个奖项)以及数学奖(每年一个奖项),每个奖项的奖金为三百万美元。此外,每年还会有不超过三个物理新视野奖以及不超过三个数学新视野奖,用以表彰年轻的科研工作者。获奖者将参加全程直播的颁奖典礼用以表彰他们的杰出成就同时启发下一代科学家。做为典礼的一部分,获奖者也会参加主办方组织的讲座以及论坛。 科学突破奖的奖金由谷歌公司创始人之一谢尔盖·布林、Facebook创始人马克·扎克伯格及其妻子,腾讯创始人马化腾, 互联网投资公司DST GLobal创始人尤里·米尔纳及茱莉亚·米尔纳,23andMe创始人安妮·沃希斯基共同赞助。其评审委员会由之前在各个领域的获奖者组成。 2019年突破奖和新视野奖的获奖人将在第七届突破奖年度颁奖典礼上被授予奖项。突破奖颁奖典礼被誉为“科学界的奥斯卡”,今年将由著名演员、制片人和慈善家皮尔斯布·鲁斯南主持。颁奖典礼将于11月4日,在加利福利亚山景城的NASA埃姆斯研究中心举行, 国家地理频道将进行直播。 突破奖被誉为全世界最慷慨的科学奖,单奖为三百万美金。 该奖项已举办第七个年头,旨在表彰生命科学,基础物理和数学方面的成就,这些学科提出最终极的问题,并寻求最深刻的答案。
  • 《我国科学家在环形染色体重排研究方面取得突破进展》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2018-10-09
    • 近日,《自然·通讯》(Nature Communications)杂志在线发表了我国科学家的研究论文 “Ring Synthetic Chromosome V SCRaMbLE”,证实了人工合成环形染色体在基因型和表型上的连续进化能力,显示与天然线性染色体相比,人工环形染色体具有更复杂的重排变化规律。该研究是在国家科技计划支持基础上,由天津大学元英进牵头的团队取得最新突破性进展。 染色体结构变异对生物表型多样性具有重要的影响。该研究以含有环形5号染色体的单倍体酿酒酵母菌株为模型,利用合成型酵母染色体特有SCRaMbLE系统研究基因组结构变异和进化,揭示了环形染色体可以连续产生复杂的基因组变异和表型优化。 (PDV)的生物合成途径作为基因组重排的筛选标记,通过诱导环形染色体的基因组重排获得了非整倍体酵母菌株,PDV产量提升约7倍,并且检测到1、3、6、12、13和环形5号染色体的非整倍体加倍。 与线性染色体的结构变异相比,环形染色体发生基因组重排后产生了更多的结构变异,包括DNA片段的重复、插入、易位和反转。该研究检测到29种非天然存在的新型结构变异,其中有11种和PDV的生物合成提升相关联;同时,发现未表征基因YER182W的缺失与PDV的产量提升有关(见下图)。 本研究基于前期人工构建的酿酒酵母环形染色体,利用SCRaMbLE重排进化系统开展环形染色体结构变异与功能分析研究,证实环形染色体的结构变异可以改变染色体数目、结构和组织形式以推动基因组的进化。他们建立的DNA基因型与生物表型关系的研究新模型,有望用于染色体重排、微生物细胞工厂性能提升、生命快速进化和人类染色体异常疾病等研究。