严重的急性呼吸系统综合症冠状病毒2(SARS-CoV-2)引起的正在进行中的2019年冠状病毒病(COVID-19)大流行导致了前所未有的公共卫生危机,促使全球努力快速开发出有效的针对COVID-的新治疗策略人单克隆抗体(mAbs)是有前途的治疗分子,可用于预防或治疗病毒感染性疾病,包括COVID-19。
基于此,为进一步揭示三抗体及四抗体鸡尾酒协同效应的分子基础,中国科学院生物物理所王祥喜研究员、四川大学华西医院李为民教授、浙江省疾病预防控制中心张严峻研究员合作在《Cell Research》上发表文章 “Structure-based development of three- and four-antibody cocktails against SARS-CoV-2 via multiple mechanisms ”,分别对SARS-CoV-2 S三聚体与两组多抗体鸡尾酒(FC05-H014-P17;FC05-H014-P17-HB27)复合物的冷冻电镜结构进行解析。
为了探索配制包含三个或四个NAb的混合物的可能性并测试其对SARS-CoV-2的有效性,该研究团队首先研究了通过竞争性表面等离子体激元共振(SPR)将三个靶向RBD的NAb与S三聚体同时结合的方法。 。标记为SARS-CoV-2 S三聚体的CM5传感器被一种抗体完全饱和,并在流通物中被另外两种抗体淹没。发现HB27完全饱和,从而阻止了P17与SARS-CoV-2 S三聚体的结合,反之亦然。有趣的是,HB27的完全占用阻止了H014与SARS-CoV-2 S三聚体的结合,而在H014过多的情况下HB27仍可以附着于S三聚体,这与H014与S三聚体的0–3结合的结构观察相符。相反,已证明H014和P17同时与SARS-CoV-2 S三聚体结合。不出所料,靶向NTD的FC05的结合不会影响三个RBD特异性NAb中的任何一个与SARS-CoV-2 S三聚体之间的相互作用。毫不奇怪,竞争性结合测定法验证了由同时靶向三个不同区域的FC05,H014和P17组成的合理的三抗体混合物
接下来,在三抗体混合物的冷冻-EM结构中,总共有九个拷贝的Fab结合到一个S三聚体上,其中三个FC05 Fab结合在每个NTD的侧面,而三个H014和三个P17 Fab结合在一个NTD的侧面。每个RBD的顶部和顶部分别屏蔽了完整的S1,从而完全阻断了与受体和细胞表面蛋白酶的任何可能接触。有趣的是,九个拷贝的Fab分子紧密排列在S三聚体的三角形外部,紧密连接所有三个S1亚基并抑制其构象转变,这是病毒膜融合的前提。在H014绑定时,所有三个RBD都以开放配置站立,为S2顶部的三角形内部留出了空间。
最后,在B.1.1.7和501Y.V2中HB27的表位上已经出现了一个点突变。尽管如此,SARS-CoV-2的S三聚体及其两个变体显示出与HB27相当的结合能力。如预期的那样,由于B.1.1.7中的RBD突变均不位于P17表位之内,因此P17与SARS-CoV-2一样有效地与变异B.1.1.7结合。然而,由于在表位中出现点突变E484K,该抗体与变体501Y.V2的结合大大降低。同样,B.1.1.7和501Y.V2中FC05表位的残基141缺失和新R246I突变的存在,极大地降低了FC05对这两个变异体的结合亲和力。这些结果表明在鸡尾酒中结合不同抗体的中和活性以对抗当前变种所构成的免疫逃逸威胁是有用的,强调了多种基于NAb的鸡尾酒作为抗SARS-CoV-2感染的治疗剂的突出优势。
综上所述,这项工作剖析了在鸡尾酒中混合在一起时展现出对S三聚体的三个或四个表位具有不同特异性的抗体之间所观察到的协作相互作用的性质,并揭示了抗体与S三聚体协同结合的分子基础,具有协同作用。通过多种机制进行中和和保护。此处揭示的抗体-抗原相互作用的原理也可能有助于合理设计针对其他病毒的治疗性鸡尾酒。