《澳研究人员使用滤纸采集eDNA来研究生物多样性》

  • 来源专题:中国科学院文献情报系统—海洋科技情报网
  • 编译者: liguiju
  • 发布时间:2021-03-01
  • 澳大利亚联邦科学与工业研究组织(CSIRO)在澳大利亚西海岸附近海域进行的一项新研究表明,在海水中漂浮一种特殊的滤纸可以揭示某个地区存在哪些物种。这项研究检测到了环境DNA(eDNA),这是水生环境中动植物脱落的DNA,保留了每个物种身上独特的痕迹。

    研究人员表示,这种新方法不再需要过滤海水来收集eDNA,节省了时间,并使这项技术能够在设备或电力有限的地方使用。到目前为止,收集eDNA非常耗时,需要水泵和其他设备来过滤海水样本。而这一新发现意味着,在海水中悬浮纤维素滤纸可能是一种可行的低技术手段,可以用来调查珊瑚礁上的鱼类物种,监测澳大利亚偏远海岸公园的生物多样性,或提供生物安全有害生物的早期预警。

    eDNA被认为是拖网捕鱼的人道主义替代品,更安全,还可以探测物种和评估生物多样性。使用滤纸进行被动式eDNA收集可以收集更多样品,从而扩大了eDNA可以解决的生态问题的范围。

    这项研究中将从热带Ashmore珊瑚礁和温带Daw岛等海域采集了eDNA样本并进行了对比,研究结果已发表在《通讯-生物》(Communications Biology)上。该小组目前正在开发一种简单的装置,用于在海洋和淡水中被动收集eDNA。(王琳 编译)

  • 原文来源:https://www.csiro.au/en/News/News-releases/2021/Filter-paper-can-reveal-species-under-the-sea
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    • 爱达荷大学自然资源学院助理教授Tara Hudiburg获得了75万美元用于研究生物燃料的可持续性。这项由能源部授予的拨款是一个1.04亿美元项目的一部分,该项目旨在创造新一代可持续的、具有成本效益的生物管道和生物能源。 Hudiburg是该项目的共同负责人,他将领导生物地球化学建模,作为项目可持续性倡议的一部分。生物地球化学模型包括对温室气体的评估、改进对未来作物产量的预测以及确定不同种植系统对土壤健康、生物多样性和水质的影响。 “这个项目将促进美国的能源安全,同时研究生物基础经济的经济可持续性和环境影响,”Hudiburg说。他说:“我们正在采取全面的措施,帮助改善美国的能源供应,减少对环境的影响。我很高兴能够代表爱达荷大学作为调查人员之一,成为如此庞大而有才华的多学科小组的一员。 该项目由伊利诺伊大学香槟分校(University of Illinois at Urbana-Champagne)牵头,该大学位于先进生物能源和生物制品创新中心(Center for Advanced Bioenergy and Bioproducts Innovation)。该项目有17个合作机构;赫蒂伯格是来自爱达荷州的唯一一名科学家。 ”这个项目的广度描绘了需要汇集专家从生命科学,自然科学,社会科学和工程学,”珍妮特·尼尔森说,负责研究和经济发展的副总裁U(即“塔拉代表我们,把她的知识这个跨学科的项目是非常宝贵的,扩大大学的研究投资组合的实际通过合作解决问题。” 在未来的五年里,研究小组将通过整合三个高度相互关联的DOE优先领域来开发燃料和产品:种植合适的作物,将植物转化为燃料,并确定这些燃料的环境和经济可持续性。 “作为美国寻求能源独立,我们需要看看最有效的方式增长,变换,生物燃料和市场,”埃文·h·DeLucia说,主任CABBI和威廉·g·阿伦兹伊利诺伊大学植物生物学教授和鲍姆的家人主任伊利诺斯州的可持续性研究所、能源和环境。“这笔资金将改变游戏规则,而CABBI将站在我们推动新的生物基础经济的前沿。”我们中心的整体方法将直接从生物量中产生新产品,减少我们国家对化石燃料的依赖,使我们更安全。 该项目名为“先进生物能源和生物管道创新中心”,由美国能源部资助。DE-SC0018420通过直通实体伊利诺伊大学第090634-16929号。该项目预期的联邦资金总额为759 072美元,相当于该项目总成本的100%。 ——文章发布于2018年6月11日
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    • 编译者:liguiju
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    • 一项新的研究证明了一种新方法的有效性,即利用海水样本中的DNA来确定在给定的深海区域存在哪些鱼类。eDNAtec公司、加拿大渔业和海洋局以及纪念大学研究人员在11月4日出版的Plos One期刊上发表了这项研究成果。 监测深海鱼类多样性的能力对于执行可持续管理措施和了解商业捕鱼和气候变化的影响是必要的。然而,现有的诸如诱饵相机捕捉、拖网捕捞和声学监测等方法检测能力有限,很难应用到大部分海洋研究中。 一种称为eDNA代谢编码的新方法通过分析环境DNA(eDNA)来揭示特定栖息地中存在哪些鱼类,eDNA是生物体在进行正常活动时释放到周围环境中的DNA。 为了评估eDNA代谢码检测深海鱼类的有效性,McClenaghan及其同事将其应用于从拉布拉多海采集的2500米深处的海水样本。在深海水样(水深1400米或以上)中,eDNA-metabarcoding鉴定出11科11属8种。研究人员将他们的eDNA代谢编码结果与传统方法得到的结果进行了比较,发现他们提供了更广泛的鱼类多样性和其他分类信息,同时大大减少了后勤工作。这些优点使得eDNA的大规模应用成为一个重要的技术进步。 研究小组还利用不同体积的深海海水样本和不同的DNA引物(用于eDNA实验室分析的短链DNA)来探索eDNA的代谢编码,以确定存在哪些物种。他们的研究结果表明,深海环境需要对在较浅水域使用的方法进行一些调整,例如使用更大体积的水和使用多重引物来最大限度地检测物种。 作者补充道:“基因组学和计算工具的进步正在迅速扩大我们研究和监测生物多样性的能力,这是面对迅速而巨大的环境变化所急需的任务。我们的研究证明了eDNA分析方法在深海鱼类物种监测这一具有挑战性的工作中的实用性,并为其他人员采用这种方法奠定了基础。” (张灿影 编译)