迫切需要了解导致疾病COVID-19的严重急性呼吸系统综合症冠状病毒进化枝2（SARS-CoV-2）的发病机理。 SARS-CoV-2穗蛋白（S）与血管紧张素转换酶2（ACE2）结合，并与宿主蛋白酶（主要是跨膜丝氨酸蛋白酶2（TMPRSS2））协同作用，促进细胞进入。宿主组织中SARS-CoV-2靶向的细胞亚群以及调节ACE2表达的因子仍然未知。在这里，我们利用人类，非人类的灵长类动物和小鼠单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集遍及健康和疾病，以发现组织驻留细胞亚群中SARS-CoV-2的假定靶标。我们确定ACE2和TMPRSS2共表达肺II型肺细胞，回肠吸收性肠上皮细胞和鼻杯状分泌细胞内的细胞。令人惊讶的是，我们发现ACE2是在体外使用气道上皮细胞的人干扰素刺激基因（ISG），并将我们的发现扩展到体内病毒感染。我们的数据表明，SARS-CoV-2可以利用物种特异性干扰素驱动的ACE2上调来增强感染，ACE2是肺损伤期间的一种组织保护介体。
