RNA修饰N6-甲基腺苷(m6A)调节mRNA命运,因此影响许多生物学过程。我们分析了登革热病毒(DENV),寨卡病毒(ZIKV),西尼罗河病毒(WNV)和丙型肝炎病毒(HCV)感染后转录组中的m6A。我们发现黄病毒科中这些病毒的感染改变了包括RIOK3和CIRBP在内的特定细胞转录本的m6A修饰。在病毒感染期间,在RIOK3中添加m6A会促进其翻译,而CIRBP中m6A的缺失会促进其他剪接。重要的是,先天性免疫感应或内质网(ER)应激反应的病毒激活分别导致RIOK3或CIRBP中m6A的变化。此外,具有感染改变的m6A谱的几个转录物,包括RIOK3和CIRBP,编码影响DENV,ZIKV和HCV感染的蛋白质。总的来说,这项工作揭示了病毒感染过程中激活的细胞信号通路导致宿主mRNA的m6A修饰改变,从而调节感染。