《武汉植物园水环境耐药基因研究获进展》

  • 来源专题:转基因生物新品种培育
  • 编译者: 王晶静
  • 发布时间:2020-11-28
  • 细菌的耐药基因是自然环境中新出现的一种潜在威胁。细菌获得耐药基因,将损坏抗生素治疗的效果。同时,耐药基因可通过水平基因转移(HGT)从一种细菌转移到另一种细菌。但是,目前水环境中耐药基因与细菌之间的相关关系尚不清楚。中国科学院武汉植物园水生植物与流域生态重点实验室环境基因组学学科组张卫红等在研究员杨玉义的指导下,通过相关性分析调查水环境中耐药基因与细菌之间的相关关系。研究发现,aadA、tetM、mphA和tetA是水环境中主要的耐药基因。厚壁菌门(Firmicutes)可能是耐药基因的主要潜在宿主。此外,一些耐药性抗性基因在不同细菌之间可能通过遗传元件(MGEs)进行传递或交换。相关研究成果以Large-scale pattern of resistance genes and bacterial community in the tap water along the middle and low reaches of the Yangtze River为题,发表在Ecotoxicology and Environmental Safety上。研究工作得到中国科学院水生植物与流域生态重点实验室启动研究基金的支持。论文链接:http://www.cas.cn/syky/202010/t20201029_4764667.shtml

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    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
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    •  细菌的耐药基因是自然环境中新出现的一种潜在威胁。一旦细菌获得耐药基因,用于治疗的抗生素可能就没有了相应效果。此外,耐药基因可以通过水平基因转移(HGT)从一种细菌转移到另一种细菌。但目前水环境中耐药基因与细菌之间的相关关系还缺乏清晰认识。   中国科学院水生植物与流域生态重点实验室环境基因组学学科组的张卫红等科研人员在杨玉义研究员指导下,通过相关性分析调查了水环境中耐药基因与细菌之间的相关关系。研究结果发现 aadA、tetM、mphA和tetA 是水环境中主要的耐药基因。厚壁菌门(Firmicutes)可能是耐药基因的主要潜在宿主。此外一些耐药性抗性基因在不同细菌之间可能会通过遗传元件(MGEs)进行传递或交换。   研究成果以Large-scale pattern of resistance genes and bacterial community in the tap water along the middle and low reaches of the Yangtze River为题,发表于国际学术期刊Ecotoxicology and Environmental Safety。研究得到了中国科学院水生植物与流域生态重点实验室启动研究基金(Y9519802)支持。
  • 《武汉植物园在湖泊沉积物耐药基因组的研究中取得新进展》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2020-12-31
    • 在水环境中,抗生素抗性基因(ARG)的日益流行引起了人们极大的关注,因为它们可能对公共健康构成威胁。一旦细菌获得耐药基因,用于治疗的抗生素可能就没有了相应效果。此外,耐药基因可以通过水平基因转移(HGT)从一种细菌转移到另一种细菌。但目前水环境耐药基因组的环境风险及控制ARG群落的驱动力机制还需要进一步研究。   北京师范大学陈海洋教授与中国科学院水生植物与流域生态重点实验室、武汉植物园环境基因组学学科组杨玉义研究员等开展合作,研发了一个框架,该框架结合了高通量测序(HTS)分析,基于零模型和机器学习分类工具的方法,以理解环境沉积物中抗生素耐药基因组的环境风险和控制沉积物ARG群落的生态过程。研究以中国太湖和白洋淀为例。基于HTS的宏基因组学分析揭示了两个湖泊中存在丰富而多样的耐药基因组,包括一些新兴的ARG,例如粘菌素和碳青霉烯类抗生素类型。β-多样性差异指数的比较表明,ARG多样性表现出明显的距离衰减模式。使用基于零模型的结果表明,在驱动的ARGs群落的生态过程中,随机过程比确定性过程贡献更大。该发现揭示了水生环境中抗生素耐药组的传播风险和驱动因素,这可能有助于制定有效的管理策略来控制ARGs的污染。   研究成果以Environmental risk characterization and ecological process determination of bacterial antibiotic resistome in lake sediments为题,发表于国际学术期刊Environment International。