《2型糖尿病和白细胞DNA甲基化: 在超过1500名老年人的表观基因组范围内的关联研究》

  • 来源专题:重大新药创制—内分泌代谢
  • 编译者: 李永洁2
  • 发布时间:2015-12-07
  • 2型糖尿病的发展取决于环境和遗传因素的影响。我们调查了糖尿病与外周血中表观基因组范围DNA甲基化(DNAM)的关联。DNA甲基化和2型糖尿病流行性之间的关联被建立,其中对年龄,体重指数,吸烟行为,细胞成分和批量361922 CpG位点都进行了调整性中位数回归分析。结果有45%的患者糖尿病控制不佳。经过多重数据校正后,第一组队列分析中发现,39 CpGs的DNA甲基化与糖尿病的流行性显著相关。第二组队列分析中发现,在cg19693031位点的CpG岛的DNA甲基化与空腹血糖和糖化血红蛋白浓度也呈现相关关系。结果表明,Cg19693031,位于TXNIP的3'-非翻译区之内,可能在2型糖尿病中发挥病理生理学作用。这一结果的出现是合理的,因为已证实硫氧还蛋白相互作用蛋白在糖尿病动物和人类中会过量表达。此外,3'-非翻译区在基因表达中发挥的作用是众所周知的。

相关报告
  • 《胰腺外分泌PNLIPRP1甲基化与二型糖尿病和胆固醇代谢相关》

    • 编译者:黄雅兰
    • 发布时间:2024-11-21
    • 我们假设二型糖尿病(T2D)通过(epi)遗传机制使患者易患胰腺外分泌疾病。我们研究了141名供体外分泌胰腺的甲基化组(使用甲基化基因芯片),评估了T2D的影响。T2D的一项表观基因组关联研究发现,胰腺脂肪酶相关蛋白1 (PNLIPRP1)基因增强子的高甲基化与PNLIPRP1表达降低相关。PNLIPRP1无效变异体(在英国生物银行的191,000名参与者中发现)与高血糖和低密度脂蛋白胆固醇相关。在111名供体中使用2.5M SNP Omni阵列的孟德尔随机化揭示了T2D是PNLIPRP1超甲基化的原因,而pnliprp 1超甲基化又是低密度脂蛋白胆固醇的原因。额外的AR42J大鼠外分泌细胞分析表明,Pnliprp1敲除诱导腺泡-导管化生(一种已知的胰腺前癌症状态)和胆固醇水平升高,可被他汀类药物逆转。这项(epi)遗传学研究表明PNLIPRP1在人类代谢和胰腺外分泌功能中的作用,对胰腺疾病具有潜在的意义。 文章亮点 我们进行了这项研究,以确定胰腺二型糖尿病(T2D)的表观遗传变化。 这项研究解决了T2D是否诱导表观遗传变化,这可以解释为什么T2D患者更容易患胰腺疾病。 我们发现PNLIPRP1基因甲基化与T2D相关,并确定了该基因在胆固醇代谢中的作用。 这项研究对胰腺疾病的预防有重要意义,因为它们的分子机制仍不清楚。
  • 《非洲2型糖尿病的全基因组关联研究》

    • 来源专题:重大新药创制—内分泌代谢
    • 编译者:李永洁2
    • 发布时间:2019-05-09
    • 宗旨/假设 2型糖尿病的全基因组关联研究(GWAS)已发现> 400个风险位点,主要是在欧洲和亚洲血统的人群中。在这里,我们旨在通过在非洲人群中进行遗传分析来发现其他2型糖尿病风险基因座(包括非洲特异性变异体)和精细图谱关联信号。 方法 我们对来自南非,尼日利亚,加纳和肯尼亚的4347名非洲人进行了两项2型糖尿病全基因组关联研究,并对这两项研究进行了荟萃分析。使用精细映射方法识别可能的因果变体。 结果 最显着相关的变体定位于TCF7L2附近广泛复制的2型糖尿病风险基因座(p = 5.3×10-13)。 TCF7L2基因座的精细定位表明欧洲人和非洲人之间共享一种2型糖尿病协会信号(由rs7903146索引)和非洲特异性信号(由rs17746147索引)。我们还在AGMO附近检测到一个新信号rs73284431(p = 5.2×10-9,次要等位基因频率[MAF] = 0.095;在大多数非非洲人群中是单态的),不同于该地区先前报道的信号。在针对100个已发表的2型糖尿病风险基因座的分析中,我们确定21个在非洲和非非洲人群中具有共同的因果变异。 结论/解释 这些结果证明了在非洲人中进行GWAS的价值,为更大的财团提供了进一步发现和精细定位的资源,并表明非洲的其他大规模努力有必要进一步了解2型糖尿病的遗传结构。