SARS-CoV-2 JN.1 变体 (BA.2.86.1.1) 源自 BA.2.86.1 和刺突蛋白取代 Leu455Ser,到 2024 年初已经超过了以前占主导地位的 XBB 谱系。1随后,JN.1亚变体,包括KP.2(JN.1.11.1.2)和KP.3(JN.1.11.1.3),它们获得了额外的刺突蛋白取代(例如,Arg346Thr、Phe456Leu和Gln493Glu),同时出现(附录 PP 12-13).2此外,截至 2024 年 6 月,除了上述替换外,LB.1 (JN.1.9.2.1) 和 KP.2.3 (JN.1.11.1.2·3) 等 JN.1 亚变体在 S (Ser31del) 的第 31 位趋同缺失,已经出现并传播(附录 PP 12-13).2024年5月,我们报告了KP.2的病毒学特征;2在本通信中,我们研究了 KP.3、LB.1 和 KP.2.3 的病毒学特性。
研究人员估计了相对有效繁殖数(R和)的 KP.3、LB.1 和 KP.2.3 使用贝叶斯多项式逻辑模型3基于加拿大、英国和美国的基因组监测数据,截至 2024 年 5 月,这些变异株已在这些国家传播(附录第9-13页).The R和在这些国家,KP.3 比 JN.1 高出 1·2 倍以上,高于或接近 KP.2 (附录 PP 12-13).值得注意的是,R和LB.1和KP.2.3的值高于KP.2和KP.3(附录 PP 12-13).这些结果表明,除了KP.2之外,我们研究的三种变体还将在世界范围内传播。2
研究人员对假病毒进行了病毒学和免疫学实验。KP.2和KP.3在人HOS-ACE2/TMPRSS2细胞中的假病毒感染性显著低于JN.1(附录 PP 12-13).相反,LB.1 和 KP.2.3 的假病毒传染性与 JN.1 相似 (附录 PP 12-13).对突破性感染XBB.1.5或EG.5后的恢复期血清样本、HK.3或JN.1感染后的疫苗接种状态未知血清样本以及单价XBB.1.5疫苗接种后的血清样本进行中和试验。在所有四组恢复期血清样本中,LB.1 和 KP.2.3 的 50% 中和滴度显著低于 JN.1 的 50% 中和滴度(2.2 倍至 3.3 倍和 2.0 倍至 2.9 倍),甚至低于 KP.2 的中和滴度(1.6 倍至 1.9 倍和 1.4 倍至 1.7 倍;附录 PP 12-13).尽管KP.3对所有测试的恢复期血清样本显示出比JN.1更高的中和抵抗力(1·6倍至2·2倍),但KP.3和KP.2之间没有显著差异(附录 PP 12-13).在未感染XBB.1.5疫苗血清样本中,JN.1亚变体的50%中和滴度值非常低(附录 PP 12-13).对于自然感染XBB后的XBB.1.5疫苗血清样本,对KP.3、LB.1和KP.2.3的50%中和滴度值显著低于JN.1(2·1倍至2·8倍),甚至低于感染后的KP.2(1·4倍至2·0倍;附录 PP 12-13).
总体而言,JN.1 亚变体,包括 KP.2 和 KP.3,表现出免疫逃避和 R和与亲本JN.1相比。此外,LB.1 和 KP.2.3 与 Ser31del 相比,显示出更高的假病毒感染性和更强的免疫抵抗力。这些数据表明,Ser31del对于增加传染性、增强免疫逃避和增加R至关重要和.使用Ser31del持续监测变异体并评估这种缺失对各种变异蛋白的影响对于未来的研究是必要的。