《用单细胞图谱描绘小鼠一生和糖尿病中β细胞的身份》

  • 来源专题:重大疾病防治
  • 编译者: 蒋君
  • 发布时间:2023-09-15
  • 尽管已经生成了多个胰岛单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据集,但对胰腺细胞在发育、稳态和糖尿病中的状态以及临床前动物模型的价值缺乏共识。在这里,我们提出了一个scRNA-seq交叉条件小鼠胰岛图谱(MIA),这是一个用于交互式探索和计算查询的精选资源。我们整合了来自9个scRNA-seq数据集的300000多个细胞,这些数据集由56个样本组成,年龄、性别和糖尿病模型各不相同,包括自身免疫性1型糖尿病模型(NOD)、糖毒性/脂毒性2型糖尿病模型(db/db)和化学链脲佐菌素β细胞消融模型。MIA的β细胞景观揭示了疾病进展过程中的新细胞状态以及先前提出的标记基因之间的交叉发表差异。我们发现链脲佐菌素模型中的β细胞在转录上与人类2型糖尿病和小鼠db/db模型中的细胞相关,但与人类1型糖尿病和鼠NODβ细胞不太相似。我们还报道了在未成熟、老年和糖尿病模型中β细胞之间共享的途径。MIA能够全面分析β细胞对不同应激源的反应,为理解β细胞的可塑性、补偿和死亡提供路线图。
  • 原文来源:https://www.nature.com/articles/s42255-023-00876-x?error=cookies_not_supported&code=2ec62f11-4e25-4f36-b61f-796fc320c83c
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  • 《重编程人类α和γ胰岛细胞可缓解小鼠糖尿病》

    • 来源专题:生物安全网络监测与评估
    • 编译者:yanyf@mail.las.ac.cn
    • 发布时间:2019-02-28
    • 2019年2月14日,瑞士日内瓦大学的Pedro L. Herrera教授及其同事证明来自糖尿病和非糖尿病供体的人类胰岛α和γ细胞在经过重编程之后可以产生响应葡萄糖的胰岛素。该研究结果以Diabetes relief in mice by glucosesensing insulin-secreting humanα-cells为题以长文形式发表在Nature杂志上。 研究者发现人胰岛α细胞和分泌胰腺多肽(ppy)γ细胞在Pdx1与Mafa过表达时,α细胞和γ细胞可重编程为分泌胰岛素的β细胞。该研究证明了在体外,胰岛中非β细胞可以重编程为β细胞。研究者将重编程的细胞移植入糖尿病小鼠的肾脏中,发现小鼠的糖尿病得以缓解,在移植六个月后,这些细胞仍具有分泌胰岛素的功能。利用转录组和蛋白质组深度分析,研究者确认了重编程后α细胞仍然具有α细胞的标记,虽不同于β细胞,但却具有β细胞的功能。这项研究有助于理解胰岛原位细胞分化可塑性的分子机制,为治疗糖尿病和其它退行性疾病提供了新的策略。 ——文章发布于2019-02-20
  • 《研究重点: 人类细胞图谱》

    • 来源专题:人类遗传资源和特殊生物资源流失
    • 编译者:yanyf@mail.las.ac.cn
    • 发布时间:2019-10-30
    • 人类细胞图集项目汇集了生物学家,临床医生,技术人员,物理学家,计算科学家,软件工程师和数学家组成的国际社区。 这个由不同专业知识的科学家组成的社区拥有共同的目标,即创建所有人类细胞的全面参考图谱,作为了解人类健康以及诊断,监测和治疗疾病的基础。 如果没有不同细胞类型的图谱,它们在体内的位置以及它们表达的基因,我们将无法描述所有的细胞活动并无法理解指导它们的生物学网络。 最近,诸如单细胞基因组学之类的新工具首次使这一目标得以实现。 全面的细胞图谱将使对人体中所有类型甚至亚型的细胞进行分类,识别它们在体内的位置,甚至区分不同的分化阶段和细胞状态(例如免疫细胞激活)成为可能。地图集还使研究人员可以绘制细胞谱系图,例如从骨髓中追溯到红血球直至其干细胞起源。 细胞图谱具有将我们的生物医学方法转变的潜力。这将有助于识别不同疾病的标记和特征,发现用于治疗干预的新靶标,并提供体内人类生物学的直接视图,从而消除了细胞培养的失真方面。 广泛的新闻发布和新闻报道 国际人类细胞图集计划正在进行中 本周在伦敦举行的一次国际会议上,正在讨论一项雄心勃勃的全球倡议,以创建人类细胞图集-将人体中的每个细胞描述为参考图,以加快生物医学科学的发展。最终,《人类细胞图谱》将彻底改变医生和研究人员如何理解,诊断和治疗疾病。 国际人类细胞图谱发布了战略蓝图;宣布前一百万个细胞的数据 蓝图描述了对人体中每个细胞进行分类的途径。细胞数据发布,可供研究社区使用。 Human Cell Atlas迈出了了解人类早期发育的第一步 从一系列人类组织中测序出的前250,000个发育细胞。 研究人员在“人类细胞图集”在线门户网站上发布了半百万个人类免疫细胞的遗传图谱 在发布之前,研究人员可以在Data Coordination Platform的预览版上编译原始数据并使其公开访问。 研究人员发现新型肺细胞,对囊性纤维化的重要见解 在人体组织中经过验证的对小鼠气道细胞的全面单细胞分析显示了对理解肺部疾病至关重要的分子细节。 单细胞图谱揭示了溃疡性结肠炎的潜在基础 成千上万的结肠细胞为炎症性肠病出了什么问题以及为什么某些患者对药物没有反应的原因提供了新的线索。