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《BioRxiv，3月12日，Rigidity, normal modes and flexible motion of a SARS-CoV-2 (COVID-19) protease structure.》

  • 来源专题：COVID-19科研动态监测
  • 编译者： zhangmin
  • 发布时间：2020-03-13

  • Rigidity, normal modes and flexible motion of a SARS-CoV-2 (COVID-19) protease structure.

    Stephen Anthony Wells

    doi: https://doi.org/10.1101/2020.03.10.986190

    Abstract

    The rigidity and flexibility of two recently reported crystal structures (PDB entries 6Y2E and 6LU7) of a protease from the SARS-CoV-2 virus, the infectious agent of the COVID-19 respiratory disease, has been investigated using pebble-game rigidity analysis, elastic network model normal mode analysis, and all-atom geometric simulations. This computational investigation of the viral protease follows protocols that have been effective in studying other homodimeric enzymes. The protease is predicted to display flexible motions in vivo which directly affect the geometry of a known inhibitor binding site and which open new potential binding sites elsewhere in the structure.

    *注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用.

  • 原文来源：https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.10.986190v1
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