《10月24日_研究人员鉴定SARS-CoV-2感染人类细胞所需的宿主因子》

  • 来源专题:COVID-19科研动态监测
  • 编译者: zhangmin
  • 发布时间:2020-11-17
  • 10月24日,西奈山伊坎医学院和哥伦比亚大学的研究人员在Cell期刊上发表题为“Identification of required host factors for SARS-CoV-2 infection in human cells”的文章。
    为了更好地理解病毒和宿主之间的遗传依赖关系,并找到COVID-19的潜在治疗靶标,研究人员进行了全基因组规模的CRISPR功能丧失筛查,以鉴定人类肺泡上皮细胞感染SARS-CoV-2病毒所需的宿主因子。排名靠前的基因聚集成不同的通路,包括液泡ATPase酶质子泵、逆转录酶和指挥复合物(Commander Complexes)。研究人员使用几种正交方法验证了这些基因靶标,例如CRISPR敲除、RNA干扰敲除和小分子抑制剂。通过使用单细胞RNA测序,研究人员确定了失去排名靠前的基因时胆固醇生物合成的共享转录变化。此外,鉴于ACE2受体在病毒进入的早期阶段起关键作用,研究人员证明了RAB7A的缺失通过将ACE2受体隔离在细胞内来减少病毒进入。总的来说,这项研究为每个宿主基因的丧失对病毒感染的适应性/反应的影响提供了一个基因组规模的定量资源。
    来源:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)31394-5#%20

  • 原文来源:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)31394-5#%20
相关报告
  • 《10月20日_全基因组CRISPR筛查揭示了对SARS-CoV-2感染至关重要的宿主因子》

    • 来源专题:COVID-19科研动态监测
    • 编译者:zhangmin
    • 发布时间:2020-11-16
    • cell期刊10月20日发布了美国耶鲁大学医学院Jin Wei等人发表的文章“Genome-wide CRISPR screens reveal host factors critical for SARS-CoV-2 infection”,通过全基因组CRISPR筛查,揭示了对SARS-CoV-2感染至关重要的宿主因子。 文章称,鉴定对SARS-CoV-2感染至关重要的宿主基因可能揭示新的治疗靶点,并有助于了解COVID-19的发病机理。在该研究中,该团队在表达SARS-CoV-1刺突的SARS-CoV-2、MERS-CoV、蝙蝠冠状病毒HKU5以及表达SARS-CoV-2刺突的水泡性口炎病毒(VSV)感染的Vero-E6细胞中进行了全基因组CRISPR筛选。该团队鉴定了已知的SARS-CoV-2宿主因子,包括受体血管紧张素转化酶2(ACE2)和蛋白水解酶组织蛋白酶L。该团队还发现了包括SARS谱系和泛冠状病毒特异性的高迁移率族蛋白B1(HMGB1)和SWI/SNF染色质重塑复合物的前病毒基因和途径。该研究显示HMGB1调节ACE2表达,对于SARS-CoV-2、SARS-CoV-1和NL63的病毒入侵至关重要。该研究还显示,已鉴定的基因产物的小分子拮抗剂抑制了猴子和人类细胞中的SARS-CoV-2感染,从而证明了这些基因突变在物种间的保守作用。文章称,这些结果共同确定了SARS-CoV-2的可能的治疗靶标,并揭示了SARS谱系和泛冠状病毒特异性宿主因子,这些因子可调节对高致病性冠状病毒的敏感性。 原文链接:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)31392-1
  • 《12月9日_SARS-CoV-2和反冠状病毒宿主因子网络的全基因组鉴定》

    • 来源专题:COVID-19科研动态监测
    • 编译者:zhangmin
    • 发布时间:2020-12-23
    • 洛克菲勒大学的研究人员12月9日在期刊Celll上在线发表了题为“Genome-scale identification of SARS-CoV-2 and pan-coronavirus host factor networks”的文章。研究人员对SARS-CoV-2和其他冠状病毒生命周期中的细胞宿主因子和途径仍然不清楚。为了解决问题,研究人员对SARS-CoV-2和三种季节性冠状病毒(HCoV-OC43,HCoV-NL63和HCoV-229E)进行了基因组规模的CRISPR基因敲除筛选。这些筛选发现了具有泛冠状病毒和病毒特异性功能作用的宿主因素和途径,包括对糖胺聚糖生物合成、SREBP信号传导、BMP信号传导和糖基磷脂酰肌醇生物合成以及对几种特征不太明显的蛋白质的需求。研究人员确定了SARS-CoV-2和三种季节性冠状病毒感染对含有VTT结构域的蛋白TMEM41B十分需要。文章称,这种人类冠状病毒宿主因子网络为针对急性COVID-19和未来可能发生的冠状病毒大流行制定新的治疗策略提供了丰富的资源。 原文链接:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)31676-7#%20