胚胎和胚胎外组织之间的相互作用在自然小鼠胚胎发生中至关重要。在这里,为了在体外实现这种相互作用,我们描述了一种使用小鼠胚胎干细胞组装完整的小鼠胚胎模型的方案,并诱导胚胎干细胞表达Cdx2(或滋养层干细胞)和Gata4,以分别重建外胚层、胚胎外胚层和内脏内胚层谱系。由此产生的完整胚胎模型概括了胚胎第5.0天至第8.5天的发育过程,产生了晚期胚胎和胚胎外组织,这些组织通过原肠胚形成来启动器官发生,形成头部和跳动的心脏结构以及卵黄囊和绒毛膜。一旦所需的干细胞系在培养中稳定维持,该方案需要1天来组装完整的胚胎模型,再培养8天直到头折叠阶段,尽管可以根据需要在早期发育阶段收集结构。具有小鼠干细胞培养经验的研究人员可以很容易地执行该方案,尽管他们将受益于植入后早期对自然小鼠胚胎的了解。