《健康动物中假单胞菌的耐药和毒性:对ExIA exolysin检测的关注》

  • 来源专题:外来生物入侵
  • 编译者: 刘小燕
  • 发布时间:2020-07-31
  • 假单胞菌是一种普遍存在的属,会引起人类、动物和植物疾病。大多数研究集中在人类的临床铜绿假单胞菌菌株上,很少对动物菌株进行研究。本研究旨在了解健康动物粪便标本中假单胞菌的发生情况,并分析其耐药性和致病性。在分析的704种动物粪便样本中,有133种假单胞菌属;从46个样本(6.5%)中回收了分离物(23种),并分为75种不同的PFGE模式。研究发现较低的抗菌素耐药性水平,对氨曲南最高(50.3%)。在9株铜绿假单胞菌菌株中观察到5种序列型(ST1648、ST1711、ST2096、ST2194、ST2252),2种血清型(O:3, O:6)和3种病毒型(分析15种毒性和群体感应基因)。在6株O:3血清型菌株中,3型分泌系统基因缺失,但与PAO1对照菌株相比,其细胞毒性更高,生物膜生物量、吩嗪色素和活性更高。在这6株菌株中,通过全基因组测序检测到除PA7外的ex1AB基因座和其他毒性基因型(比如RGP69致病岛)。这是对健康动物铜绿假单胞菌中ExIA exolysin存在的首次描述,突出了其病理学上的重要性。

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  • 《抗生素耐药性快速检测技术取得突破》

    • 来源专题:农业科技前沿与政策咨询快报
    • 编译者:乌吉斯古楞
    • 发布时间:2017-11-28
    • 西澳大利亚大学(The University of Western Australia)的一个科学家小组开发出了一个能够快速确认抗生素疗效的筛选实验,该方法将确保出现在处方里的抗生素是最有效的。该解决方案被名为FAST(Flow cytometer-assisted Antimicrobial Susceptibility Testing,流式细胞仪辅助抗菌敏感性检测)。它可以准确测量细菌抗药性,速度比国际标准快21小时,可在短短30分钟内测试出可靠的定性结果。 抗生素耐药性因可能增加常见传染病治疗失败的风险而得到全球关注。美国疾病控制和预防中心(US Centers for Disease Control and Prevention)称,美国每年至少有二百万人因产生抗生素耐药性而感染,导致至少有23,000人死于这些感染。西澳大学病理学与实验医学院(School of Pathology and Laboratory Medicine)的蒂姆·恩格利斯博士(Dr Tim Inglis)表示,治疗重度感染病的难度越来越大。恩格利斯博士说:“我们因抗生素而延长的20年预期寿命,正在被耐药性细菌吞食。不幸的是,抗生素敏感性测试的标准方法需要48至72小时,这无疑增加了抗生素治疗决策难度。医生不得不根据自身的经验进行猜测,但这可能进一步增加了抗生素耐药性,并增加治疗失败的风险。而FAST方法提供了更快捷的抗菌药敏测试方法,这是一大进步。” 此项研究主要由比尔与美琳达·盖茨基金会(Bill&Melinda Gates Foundation)“大挑战奖”(Grand Challenges Award)和西澳大利亚卫生部项目(Health Department of Western Australia)联合资助。恩格利斯博士和他的团队在研究中证明,由抗生素作用引起的细菌大小和形状的早期变化可以用于准确预测细菌的抗生敏感性特征。 国际公认的对照实验室的科学家们正前往珀斯(Perth)学习FAST方法,并在为实验室配备器材,以便在当地提供测试服务。恩格利斯博士说:“比尔与美琳达·盖茨基金会的最终目标是开发一系列适合护理点(急诊部、临床实验室和对照实验室)的抗微生物敏感性快速检测方法”。从FAST快速测试法到FIRST(第一)耐药性筛选试验的开发工作主要由盖茨基金会“大挑战奖”(OPP 1150984)资助。 (编译 乌吉斯古楞)
  • 《Xpert MTB/RIF检测结核分枝杆菌和利福平耐药性的应用研究》

    • 来源专题:结核病防治
    • 编译者:李阳
    • 发布时间:2016-10-12
    • 结核病的诊断主要依靠痰涂片抗酸染色和结核杆菌(Mtb)培养,但痰涂片敏感度较低而Mtb培养和药敏试验耗时较长,且易延误诊断或漏诊。随着分子生物学诊断技术的不断发展,利福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测技术(Xpert Mtb/RIF)可以在2 h内直接从临床样品中检测到结核杆菌复合物(MTBC)与利福平(RIF)耐药性,在多个国家的评估性研究中显示出高度敏感性和特异性,并得到WHO的认可和推荐。基于此,来自浙江省衢州市人民医院的6名研究人员通过对2014年10月至2015年3月在该院就诊的疑似肺结核患者进行连续6个月监测,并对痰液样本同时进行抗酸染色镜检、液体MGIT培养和Xpert Mtb/RIF检测,评估了Xpert MTB/RIF在检测Mtb及其利福平耐药性中的应用效果,其相关成果发表于《中华临床感染病杂志》2016年第9卷第1期。 研究初期纳入疑似肺结核患者共713例,后因各种原因(Xpert MTB/RIF检测失败8例、液体培养污染39例、重复患者12例、诊断不明确2例)有61例患者未得到完整实验结果,故实际纳入统计分析的患者例数为652例。 结果显示: 1. 参照肺结核诊断标准(WS288-008)、临床表现、胸部影像学及实验室检查,399例确诊为肺结核(男性274例,女性125例,平均年龄为57.1岁)、11例非结核分枝杆菌、242例无结核;Xpert MTB/RIF检测阳性151例,其中诊断为肺结核149例、肺癌1例、肺部感染1例;Xpert MTB/RIF、痰涂片镜检和MGIT培养检测结核分枝杆菌的敏感度和特异度分别为37.3%(149/399)和99.2%(251/253)、17.0%(68/399)和98.8%(250/253)、37.8%(151/399)和95.6%(242/253)。其中,Xpert MTB/RIF检测的敏感度显著高于涂片镜检(χ2=50.9,P<0.01),但与MGIT培养相比,差异无统计学意义(χ2=0.5,P>0.05)。而三种方法的特异度比较,差异无统计学意义(P>0.05); 2. 按涂片镜检和培养结果进行分类,Xpert MTB/RIF检测的敏感度分别为98.6%(68/69)(涂阳培阳)、87.9%(73/83)(涂阴培阳)和3.2%%(8/247)(涂阴培阴)。此外,8份Xpert MTB/RIF检测阳性但培养和涂片均为阴性样本的平均ct值为28.1; 3. 对Xpert MTB/RIF检测和MGIT培养均为阳性的141例进行利福平耐药性检测,其中Xpert MTB/RIF检出利福平耐药12例。以液体药敏法为金标准,Xpert MTB/RIF检测利福平耐药敏感性为100%(9/9)、特异性为97.3%(129/132)。 综上所述,Xpert MTB/RIF检测痰液中结核分枝杆菌具有较高的敏感性和特异性,操作简单,生物危害度小,虽然在检测利福平耐药性方面与参考方法存在一定差异,但其2h就可预测利福平耐药性的特点,相对于需要漫长时间等待Mtb培养和药敏结果来说,对于临床快速诊断和治疗肺结核具有重要意义。