《全基因组测序揭示绵羊极端环境快速适应性》

  • 来源专题:转基因生物新品种培育
  • 编译者: 丁倩
  • 发布时间:2016-08-24
  • 全球气候变化对极端环境和物种生存都产生极大的影响。然而,家畜快速适应极端环境的全基因组模式鲜为人知。绵羊能适应多种农业生态区,包括某些极端环境(如高原和沙漠)。本文中,研究人员通过77只本地绵羊生成全基因组序列。比较对比环境中绵羊的基因组分析,即高海拔地区和低海拔地区、干旱沙漠地区和湿润地区,发现了一系列与高海拔缺氧反应和干旱环境水重吸收有关的新候选基因、通路和基因本体(GO)分类。此外,确定了与能量代谢和体型大小变化相关的候选基因和GO术语。本研究对绵羊和其他动物基因组对极端环境快速适应性提供了新的见解,也为未来应对气候变化的家畜育种研究提供了宝贵资源。

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  • 《全基因组测序揭示了克里奥尔牛适应性混合的信号》

    • 来源专题:农业生物安全
    • 编译者:任洁
    • 发布时间:2023-08-06
    • 瓜德罗普(GUA)的克里奥尔牛很好地适应了热带环境。它的混合基因组可能在这种适应中发挥了重要作用。在这里,我们试图检测GUA基因组中选择的基因组特征。为此,我们对23个GUA个体进行了测序,并将我们的数据与来自欧洲、非洲和印度的99只代表性动物的测序基因组相结合。我们在GUA基因组中检测到17,228,983个单核苷酸多态性(SNPs),为该品种的遗传变异模式提供了迄今为止最详细的探索。我们证实,与欧洲祖先相比,非洲和印度祖先的水平更高,我们强调了GUA基因组中印度祖先的非洲起源。我们确定了五个强有力的候选区域,显示了过量的指示祖先,并在不同的检测方法中得到一致的支持。这些区域包含与免疫、耐热性和身体活动相关的适应性作用的基因。我们证实了先前发现的角相关基因RXFP2在GUA种群中可能由于人类驱动的(社会文化)压力而受到强烈的选择压力。这项研究的发现为了解与牲畜适应力性状相关的遗传机制提供了见解。
  • 《尼日利亚本土鸡的基因组分析揭示了其遗传多样性和对热应激的适应性》

    • 来源专题:农业生物安全
    • 编译者:刘小燕
    • 发布时间:2024-03-24
    • 来自非洲的本土家禽品种可以在恶劣的热带环境中生存(如漫长的干旱季节、过多的雨水和湿度以及极端高温),并能抵御疾病的挑战,但与商业家禽相比,它们的生产力较低。它们的适应性特征是对自然选择或对在基因组中留下选择印记的生产性状的人工选择的反应。识别这些正选择的特征可以深入了解在本地家禽中观察到的热带适应的遗传基础,从而有助于为极端热带气候开发健壮和高性能的品种。在这里,我们对来自不同农业气候条件的尼日利亚本土鸡进行了首次大规模的全基因组测序分析,研究了它们的遗传多样性和对热带炎热气候(极端干旱和极端潮湿条件)的适应。该研究表明,现存的遗传多样性很大,但种群分化水平较低。使用不同的选择特征分析,检测到几个适应候选基因,特别是与耐热性和免疫反应相关的基因(例如,细胞色素 P450 2B4 样、TSHR、HSF1、CDC37、SFTPB、HIF3A、SLC44A2 和 ILF3 基因)。这些研究结果对保护宝贵的遗传资源和育种鸡的耐热性具有重要意义。