瓜德罗普(GUA)的克里奥尔牛很好地适应了热带环境。它的混合基因组可能在这种适应中发挥了重要作用。在这里,我们试图检测GUA基因组中选择的基因组特征。为此,我们对23个GUA个体进行了测序,并将我们的数据与来自欧洲、非洲和印度的99只代表性动物的测序基因组相结合。我们在GUA基因组中检测到17,228,983个单核苷酸多态性(SNPs),为该品种的遗传变异模式提供了迄今为止最详细的探索。我们证实,与欧洲祖先相比,非洲和印度祖先的水平更高,我们强调了GUA基因组中印度祖先的非洲起源。我们确定了五个强有力的候选区域,显示了过量的指示祖先,并在不同的检测方法中得到一致的支持。这些区域包含与免疫、耐热性和身体活动相关的适应性作用的基因。我们证实了先前发现的角相关基因RXFP2在GUA种群中可能由于人类驱动的(社会文化)压力而受到强烈的选择压力。这项研究的发现为了解与牲畜适应力性状相关的遗传机制提供了见解。