《中国科学院深圳先进院马英新团队开发新冠S蛋白检测的比率荧光免疫新方法》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心—领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2022-07-14
  • 近日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所马英新课题组在国际学术期刊 Sensors and Actuators B: Chemical 上发表了题为:Construction of ratiometric Si-Mn:ZnSe nanoparticles for the immunoassay of SARS-CoV-2 spike protein 的研究论文。

    该研究开发了一种比率型荧光探针(Si-Mn:ZnSe NPs),通过结合酶联免疫反应(ELISA)模型,建立了一种新冠病毒(SARS-CoV-2)刺突蛋白(S蛋白)的免疫荧光检测方法。

    以SARS-CoV-2假病毒和VSV-G假病毒作为实际样本考察该方法的传感性能,结果显示该方法对SARS-CoV-2假病毒响应特异性良好,具有与商品化试剂盒相当的检测灵敏度,为诊断SARS-CoV-2感染提供了一种可靠的潜在思路。

    S蛋白是新冠病毒侵染过程中的关键成分,具有识别目标细胞和促进膜融合的作用。因此,快速检测S蛋白对新冠疫情的防控至关重要。

    目前,新冠感染早期诊断的主流方法有三种,包括分子检测(检测病毒RNA)、抗体检测(检测IgG和IgM抗体)和抗原检测(检测病毒蛋白)。相比其他两种方法,抗原检测特异性好且反应时间短,在大批量SARS-CoV-2阳性筛查中,已得到广泛应用。当下市场上的抗原自测试剂盒多数依托胶体金免疫测流层析技术,灵敏度低限制了其应用场景。

    量子点(QDs)具有吸收光谱宽、斯托克斯位移大、荧光强度高和生物毒性低的优势,是一类理想的荧光探针,在生化分析领域得到广泛应用。据研究,荧光法的灵敏度是比色法的10~100倍,荧光免疫分析有望提升病毒抗原检测的灵敏度。本研究构建的比率荧光法采用Si-Mn:ZnSe NPs双发射探针,相当于在检测系统中添加了一项内标校准,解决了单发射探针强度受环境变化、探针浓度变化和仪器波动的影响较大的局限性,具有灵敏度高、稳定性好的优点。

    根据上述原理图,该团队通过Si dots和Mn:ZnSe QDs的自组装作用制备了Si-Mn:ZnSe NPs探针。首先考察了Si-Mn:ZnSe NPs的荧光强度对H2O2浓度的响应。随着H2O2浓度从0μmol/L增加到50μmol/L, Si-Mn:ZnSe NPs在610nm处的荧光被明显猝灭,而440nm处的荧光没有明显变化。这证明通过比率荧光的方法检测体系中的H2O2浓度是可行的(图3)。过氧化氢酶(CAT)可以催化H2O2分解,因此,CAT介导的ELISA可以用于S蛋白的免疫分析。

    在最优反应条件下,S蛋白浓度与Si-Mn:ZnSe NPs的荧光强度比呈线性关系。如图4A和4B所示,随着S蛋白浓度从0.05ng/mL增加到300ng/mL, Si-Mn:ZnSe NPs在610nm处的荧光发射强度逐渐增强。如图4C所示,lg(S)与荧光信号比(F610/F440)在0.05~10ng/mL范围内呈良好线性关系(y = 0.2318x + 0.3378, R2 = 0.9904)。图4D显示,S蛋白浓度与荧光信号比(F610/F440)在5~50ng/mL范围内呈良好线性关系(y = 0.0116x + 0.4479, R2 = 0.9987)。本方法对S蛋白检出限为0.032ng/mL。

    前期工作中,该团队将SARS-CoV-2 S蛋白整合到HIV假病毒合成系统中,构建SARS-CoV-2 S蛋白假病毒(ACS Appl. Mater. Interfaces, 2021, 13, 21, 24477-24486.)。

    本研究以上述SARS-CoV-2 S蛋白假病毒作为实际样本模型考察了本方法的准确性与重现性,并与商品化试剂盒检测结果进行对比(图5)。结果显示,所建比率荧光ELISA法测定的S蛋白浓度与商品化试剂盒相似,表明该方法具有较高准确性。构建VSV-G假病毒作为阴性对照,采用比率荧光ELISA法检测SARS-CoV-2假病毒和VSV-G假病毒中的S蛋白,结果如图6所示,10组SARS-CoV-2假病毒均有检出,而10组VSV-G假病毒均无检出,表明该方法对SARS-CoV-2 S蛋白检测具有较高的特异性。

    本研究以水热法制备了Si dots,水浴法制备了Mn:ZnSe QDs,通过二者静电相互作用自组装合成具有良好pH稳定性和光稳定性的Si-Mn:ZnSe NPs。H2O2可以特异性猝灭探针位于610nm处的荧光而对440 nm处的荧光无影响。在ELISA体系中,通过固定化CAT免疫复合物巧妙地将检测S蛋白浓度转化为检测体系内H2O2浓度。结果显示,在0.05~10ng/mL和5~50ng/mL浓度范围内,S蛋白浓度与荧光信号比(F610/F440)呈良好线性关系,检出限为0.032ng/mL。构建SARS-CoV-2假病毒作为实际样本模型,所构建方法的检测结果与商品化试剂盒相当。综上,所构建的比率荧光ELISA方法对SARS-CoV-2 S蛋白具有较高准确性和特异性,可作为一种新型诊断方法协助病毒感染筛查。

  • 原文来源:https://news.bioon.com/article/2345e323379d.html
相关报告
  • 《中国科学院动物所开发出快速精准的核酸检测技术》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2019-07-08
    • 高效精准的核酸检测技术在传染病原检测、食品安全检疫和致病基因筛查等许多方面具有重要的应用。基于CRISPR的基因组编辑技术极大地革新了生物医学研究。有趣的是,除了能够通过对基因组精准操控来进行功能基因组学研究,最近一些研究发现CRISPR系统的某些效应蛋白,例如Cas12a,在切割靶DNA后会受激获得切割非靶向单链DNA(ssDNA)的活性,从而能够用于快速简便地进行核酸检测,在传统的PCR和测序技术之外建立了一种新的核酸检测技术。 CRISPR-Cas12b/C2c1系统大多来自嗜热菌,由于其嗜高温的特性研究相对较少。中国科学院动物研究所李伟团队在2018年首次成功地改造Cas12b系统用于哺乳动物基因组编辑,建立了Cas9和Cas12a之后的第三个CRISPR基因编辑工具。在此基础上,研究团队发现Cas12b蛋白在激活之后同样具有任意切割ssDNA的特性,并开发出 CDetection(Cas12b-mediated DNA detection)检测系统,可以用于微量DNA的简便快速检测。CDetection是集Cas12b蛋白、向导RNA、ssDNA荧光报告分子和 RPA(recombinase polymerase amplification)等温扩增于一体的DNA快速检测系统。Cas12b蛋白在靶向切割RPA扩增目标DNA后激活ssDNA切割活性,任意切割ssDNA荧光报告分子,从而发出荧光信号(如图)。基于团队前期研究发现的Cas12b能够适应较广温度(25~60℃)和pH(1~8)的稳定性,CDetection系统相较Cas12a-DETECTR系统具有更高的灵敏度,可以实现亚aM(10-19 M)的灵敏DNA检测;同时,通过tgRNA(tuned gRNA)的引入,CDetection可以实现单碱基的区分。利用CDetection系统,能够快速地实现细胞、血液、尿液以及动植物中的细菌和病毒感染、基因分型以及SNP突变检测(如图)。 相关成果于7月2日在国际学术期刊Genome Biology 发表。该研究工作由动物所和中国科学院干细胞与再生医学创新研究院完成。动物所研究员李伟和周琪为论文的通讯作者;博士生滕飞、郭璐为共同第一作者。该研究受到中国科学院战略科技先导专项及科技部、基金委等的资助。
  • 《马英新团队开发RPA-CRISPR/Cas12a系统,用于快速灵敏检测非洲猪瘟》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心—领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2023-05-16
    • 非洲猪瘟是由非洲猪瘟病毒引起的一种急性、出血性、高传染性的猪疾病。迄今为止,仍然没有广泛有效的疫苗和治疗方式用于应对非洲猪瘟,通常依靠快速诊断和扑杀感染猪等手段对疫情进行有效控制。 目前,对于非洲猪瘟的诊断主要依赖于PCR技术,该技术依赖于仪器设备和专业操作人员,只能在实验室中进行,无法满足现场诊断的需求。等温扩增技术,如重组酶聚合酶扩增(RPA)、滚环扩增(RCA)等,具有高效、简便易行等优势,但其灵敏度有限,难以单独用于分子诊断。通过与CRISPR-Cas系统联用,灵敏度显著提高,可增加分子诊断的准确性。然而,目前常用的单模式荧光检测法或比色检测法易受到环境干扰,造成检测结果的不准确。 2023年5月11日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所马英新课题组与湖北大学印文博士合作,在 Analytical Chemistry 期刊上发表了题为:Fluorescence and Colorimetric Analysis of African Swine Fever VirusBased on RPA-Assisted CRISPR/Cas12a Strategy 的补充封面论文。 该论文首次构建了基于RPA-CRISPR/Cas12a系统的非洲猪瘟病毒(ASFV)比色-荧光双模式检测策略,通过构建新型磁珠-酶报告系统,结合RPA-CRISPR/Cas12a技术,实现了对ASFV基因的比色-荧光双模式精准检测。 该方法能实现对单拷贝病毒基因组检测,可用于便携式可视化诊断,且在临床样本应用中展现了良好的检测性能,为病毒感染的快速、精准诊断提供了有力工具。 本研究开发了一种结合RPA、CRISPR/Cas12a和磁珠-酶新型报告系统,用于ASFV基因的快速精准诊断的方法。如图1所示,biotin-ssDNA-azide与DBCO修饰的碱性磷酸酶(ALP)通过点击化学反应合成biotin-ssDNA-ALP,biotin-ssDNA-ALP与链霉亲和素修饰的磁珠(SA-MB)结合获得MB-ssDNA-ALP报告系统。用RPA扩增ASFV基因序列,获得扩增子,扩增子与Cas12a-crRNA复合物结合,激活Cas12a反式切割活性,切割MB-ssDNA-ALP上的ssDNA,释放ALP;ALP催化pNPP水解生成pNP,引起比色信号变化,再加入量子点作为荧光报告子,实现比色和荧光的双模式信号输出。 在该研究中,团队首先合成、表征了biotin-ssDNA-ALP,并验证了biotin-ssDNA-N3与DBCO修饰ALP的偶联以及MB-ssDNA-ALP探针的合成。然后,考察了RPA扩增ASFV基因的能力。以高度保守的ASFV B646L基因为靶标,设计了三对RPA引物,通过琼脂糖凝胶电泳实验验证了三对引物都可高效扩增ASFV基因。接着,验证了CRISPR-Cas12a靶向剪切ASFV基因的能力。设计靶向三个RPA扩增子序列的crRNA,利用琼脂糖凝胶电泳验证了Cas12a被激活并切割RPA扩增子。最后,结合合成的MB-ssDNA-ALP探针、RPA-CRISPR/Cas12a系统以及蓝色CdZnSe QDs,实现了对ASFV基因的比色-荧光双模式精准检测,灵敏度达20 copies/mL,可视化检测104 copies/mL(图 2A-2D)。 磁分离技术的使用可有效降低背景信号,实现高信噪比检测。对比发现本研究开发的检测方法灵敏度高于qPCR,且具有良好的特异性,探针不与其它猪疾病相关病毒产生交叉反应。同时,还探究了该方法在实际样本中的检测能力,对12份猪血真实样本进行了分析,结果显示该检测方法具有100%的准确度(图2E和2F)。本方法结合荧光法的高灵敏度和比色法的易读性,具有良好的灵敏度、便携性和特异性,为病毒感染的快速、精准诊断提供了有效工具。 中国科学院深圳先进院合成生物学研究所的毛国斌副研究员和中国科学院深圳先进院与华中农业大学联合培养硕士研究生罗杏为论文并列第一作者。中国科学院深圳先进院合成生物学研究所的马英新研究员、毛国斌副研究员和湖北大学印文博士为论文共同通讯作者。华中农业大学何进教授、王璕副教授参与了该研究,复旦大学孔继烈教授提供了样本支持。该项目得到国家自然科学基金、科技部、中国科学院、广东省、深圳市及深圳合成生物学创新研究院等多个项目的支持。