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《柳叶刀--对2019年起源于中国武汉的新型冠状病毒爆发的潜在国内和国际传播进行临近预报和预测：建模研究》

  • 来源专题：新发突发疾病（新型冠状病毒肺炎）
  • 编译者： 蒋君
  • 发布时间：2020-02-08

  • 根据目前搜集得来的数据测算感染人数和未来发展的预期。使用的数据来自中国疾病预防控制中心（Case definition of the Chinese Center for Disease Control and Prevention (CDC)）提供的2019年12月31日至2020年1月28日之间的感染人数，使用的预测模型是susceptible-exposed-infectious-recovered (SEIR) 。根据这个模型来计算，该医学院科研团认为截止至1月25日，大武汉地区感染人数为75815人，而这个模型预测数据是大大超过目前的实际通报数字的。这篇早期估计强调，政府需要迅速扩大公共卫生控制措施，以防止武汉外的地区发生大规模疫情。进一步的分析表明，如果2019-nCoV的传播能力可以降低，那么全国所有城市的地方疫情的增长速度和规模都可以降低。

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  • 《中国武汉的2019-nCoV爆发的潜在国内和国际传播预测：一项模型研究》
    • 来源专题：新发突发疾病（新型冠状病毒肺炎）
    • 编译者：蒋君
    • 发布时间：2020-02-02
    • 自2019年12月31日以来，中国武汉市报告了由2019年新型冠状病毒（2019-nCoV）引起的肺炎暴发。病毒已传播到中国其他城市以及国际上，有可能引发全球性疾病爆发。在此，研究人员根据从武汉输出到其他中国大陆城市的病例数来估算武汉市的流行病规模，并预测流行病在国内和全球范围内的公共卫生风险（包括社会和非公共卫生风险） -药物预防干预措施。 研究人员使用2019年12月31日至2020年1月28日从武汉输出到其他地方的病例数（已知症状发生日为2019年12月25日至2020年1月19日）来推断武汉市2019年12月1日到2020年1月25日的感染人数，然后对国内的病例进行估计。研究人员预测了2019-nCoV在全国和全球范围内的传播，并考虑到了从2020年1月23日至24日实施的武汉及周边城市隔离的影响。研究者使用了《官方航空指南》和腾讯数据库在中国大陆300多个地级市的人口流动数据。确诊病例的数据来自中国疾病预防控制中心发布的报告。连续时间间隔的估计是基于先前对严重急性呼吸系统综合症冠状病毒（SARS-CoV）的研究得出的。采用易感暴露的传染恢复集合种群模型模拟了我国各大城市的疫情。使用马尔可夫链蒙特卡罗方法估算基本生殖数，并使用所得的后验均值和95％可信区间（CrI）表示。 在基线方案中，研究人员估计2019-nCoV的基本生殖数量为2.68（95％CrI 2.47-2.86），并且已经感染了75,815人（95％CrI 37,304–130,330）。截至2020年1月25日，武汉的流行倍增时间为6.4天（95％的CrI 5.8-7.1）。在基线情况下，重庆，北京，上海，广州和深圳分别从武汉输入病例461例（95％CrI 227-805），113例（57-193），98例（49-168），111例（56-191）和80例（40–139）。如果2019-nCoV的可传播性在国内各地以及随着时间的推移都相似，则我们可以推断，中国多个主要城市的疫情已经呈指数增长，滞后于武汉爆发约1-2周。 鉴于2019-nCoV已不限于在武汉范围内传播，其他中国主要城市可能仍在继续局部爆发疫情。除非与人口和个人层面都实施实质性公共卫生干预措施，否则与中国有着紧密交通联系的海外大城市也可能成为爆发中心。由于大量的症状前病例输出和缺乏大规模公共卫生干预措施，全球主要城市的独立自我维持爆发可能不可避免。备灾计划和缓解措施应做好准备，以便在全球范围内快速部署。
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  • 《一项家庭聚类的研究表明2019年新型冠状病毒肺炎存在人与人之间的传播》
    • 来源专题：新发突发疾病（新型冠状病毒肺炎）
    • 编译者：肖宇锋
    • 发布时间：2020-01-30
    • LANCET柳叶刀1月24日在线发表来自中国香港大学研究者的论文，关于中国湖北省武汉市正在爆发的新型冠状病毒有关的肺炎。受影响的患者在地理上与当地的潜在市场联系在一起，成为潜在的来源。 在这项研究中，报告了一个家庭聚类中的五名患者的流行病学，临床，实验室，放射学和微生物学发现，他们在回访武汉后回到中国广东省深圳市后又出现了不明原因的肺炎，另外一个家庭成员没有去武汉。对这些患者的遗传序列进行了系统进化分析。从2020年1月10日开始，我们招募了一个在2019年12月29日至2020年1月4日期间从深圳前往武汉的6名患者家庭。在前往武汉的6名家庭成员中，有5名被确定感染了新型冠状病毒。此外，一名未到武汉的家庭成员在与四名家庭成员接触几天后被该病毒感染。尽管有两个人去过武汉的一家医院，但他们的家人都没有与武汉的市场或动物接触。暴露后3-6天，有5名家庭成员（年龄在36-66岁之间）出现发烧，上呼吸道或下呼吸道症状或腹泻，或出现这两种情况的组合。他们在症状发作后6-10天就诊到研究者所在的医院（香港大学深圳医院，深圳）。他们和一名无症状的儿童（10岁）有放射性玻璃底肺混浊。年龄较大的患者（年龄> 60岁）具有更多的全身症状，广泛的放射学玻璃样肺改变，淋巴细胞减少，血小板减少症以及C反应蛋白和乳酸脱氢酶水平升高。通过即时点多重RT-PCR，这6例患者的鼻咽或咽拭子对已知的呼吸道细菌呈阴性，但是5例（4个成年人和1个孩子）对编码内部RNA依赖性RNA的基因呈RT-PCR阳性Sanger测序证实了这种新型冠状病毒的聚合酶和表面穗蛋白。通过下一代测序对这五位患者的RT-PCR扩增子和两个完整基因组进行的系统进化分析表明，这是一种新型冠状病毒，与在中国马蹄蝠中发现的与蝙蝠严重急性呼吸综合征（SARS）相关的冠状病毒最接近。
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