《人类谱系中神经回路的分子和细胞重组》

  • 来源专题:结核病防治
  • 编译者: 张玢
  • 发布时间:2017-12-04
  • 为了更好地了解人类和非人类灵长类大脑组织中的分子和细胞差异,我们对成年人、黑猩猩和猕猴大脑的16个区域进行了转录组测序。结合人类单细胞转录组数据揭示了不同物种类全脑、区域和细胞类型特异性上的表达差异,并通过组织学和功能学进一步分析验证。我们对生成的数据进行综合分析,揭示了人类大脑在多个层次上的系统发育重组的不同分子和细胞特征,与脑功能和疾病相关。

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  • 《Cell | 人类谱系中线粒体DNA突变的速率和性质》

    • 编译者:李康音
    • 发布时间:2024-06-15
    • 2024年6月7日,安进(Amgen)旗下公司deCODE Genetics的科学家在国际顶尖学术期刊 Cell 上发表了题为The rate and nature of mitochondrial DNA mutations in human pedigrees 的研究论文。该研究发布了迄今为止规模最大的有关人类种系线粒体DNA(mtDNA)突变情况及其在116663对母子中如何传递的研究,揭示了mtDNA突变的突变率、性质及母系遗传的特殊动态。 该研究记录了mtDNA中的某些位置具有惊人的超突变性,包括众所周知会导致MELAS综合征的3243位有害A>G突变。该突变在2548个母系系谱中发生了15次,但由于其会对携带者的健康产生严重影响,因此该突变通常会在几代后消失。 针对系谱中诸多此类短期有害线粒体DNA突变的选择,该研究发现了强有力的综合证据。deCODE团队还报告了影响线粒体的广泛早期负选择的证据,这称为种系选择,即在卵母细胞发育过程中抛弃功能不良的线粒体DNA分子。最后,他们通过大量的系谱mtDNA突变传递得出了可靠的评估结果——个体平均仅从母亲身上遗传大约3个单位的mtDNA,这个数字小于先前研究得出的数字。 论文共同通讯作者 Agnar Helgason 表示,值得注意的是,卵母细胞携带的数十万个mtDNA仅来自母亲最初携带的大约3种mtDNA分子。这种极端瓶颈决定了mtDNA种系中的新突变会在短短几代内快速消失或固定。这在一定程度上是因为在卵母细胞发育的选择过程中,具有有害突变的mtDNA分子从种系中被去除导致的。 deCODE首席执行官、论文共同通讯作者 Kári Stefánsson 表示,这项研究让我们进一步了解了mtDNA基因组中核苷酸突变率异常变异的基础,甚至是同一位置不同等位基因之间的变异。不幸的是,正是一些致病突变的高度突变性使其如此普遍,因此它们也更容易被发现。不过,这些研究结果表明,许多导致人类疾病的罕见致病性线粒体DNA突变仍有待发现。
  • 《Science | 维生素A决定细胞谱系可塑性以协调干细胞谱系的选择》

    • 来源专题:战略生物资源
    • 编译者:李康音
    • 发布时间:2024-03-13
    • 2024年3月8日,洛克菲勒大学Elaine Fuchs教授和Matthew T. Tierney博士后等人,在国际顶尖学术期刊Science上发表了题为Vitamin A resolves lineage plasticity to orchestrate stem cell lineage choices的研究论文。 细胞谱系可塑性是指新的和先前谱系的细胞标识转录因子的双重表达,并且是赋予干细胞命运灵活性的伤口诱导应激途径的典型特征。在健康组织中,干细胞最终要么返回其先前由环境定义的轨迹,要么在进入不同微环境时经历命运变化。了解细胞谱系可塑性是如何解决的很重要,因为使其持续的条件可能导致慢性伤口状态或肿瘤发生。 该研究发现,全反式维A酸(atRA)作为一种维生素A代谢物,对于恢复它们在培养中的生理身份至关重要。他们还发现atRA使培养的毛囊干细胞能够与WNT和BMP信号合作,有效地协调形成毛囊所需的不同谱系。此外,遗传、饮食和局部干预均证实了atRA在平衡干细胞对表皮修复和毛发再生中的贡献方面的功效。最重要的是,他们证明了atRA水平必须下降,毛囊干细胞才能参与伤口修复。这些研究结果提供了关于维持干细胞谱系特异性的机制的新见解,并为利用atRA平衡干细胞在表皮修复和毛发再生中的作用提供了潜在途径。 擦伤时,皮肤干细胞会紧急出击,生长新的表皮来覆盖伤口。但是,最终修复伤口的干细胞中只有一部分通常专门用于补充保护身体的表皮。其他的是前毛囊干细胞,通常促进毛发生长,但会响应更紧急的需求,将自己变成表皮干细胞,加强本地的修复工作。为了做到这一点,这些毛囊干细胞首先进入一种柔韧的状态,即谱系可塑性状态。在这种状态下,它们暂时表达了两种类型干细胞的转录因子,即毛发和表皮。为了更好地理解人体如何调节这一过程,Elaine Fuchs教授和她的团队在模拟创伤状态下,筛选小分子化合物,以确定它们解决培养小鼠毛囊干细胞谱系可塑性的能力。他们惊讶地发现,维生素A的生物活性形式——全反式维A酸(atRA)——对这些干细胞退出谱系可塑性,然后被引导分化为毛发细胞或表皮细胞在体外起到了至关重要的作用。atRA是维生素A代谢产物,对恢复小鼠毛囊干细胞在培养中的生理特性至关重要。这些相同的效应在小鼠皮肤内也得以重现,在那里atRA作为干细胞微环境的一个组成部分被局部产生,并且需要维持谱系特异性。通过将转录组和染色质组学数据与维A酸活化的核维A酸受体-DNA相互作用相结合,他们确定了影响这一结果的靶标。 有趣的是,维A酸并不是独自发挥作用的:atRA使培养的毛囊干细胞能够与WNT(Wingless相关整合位点)和BMP(骨形成蛋白)信号共同有效地编排形成毛囊所需的不同谱系。这种培养平台准确地模拟了干细胞特有的一系列行为,包括从静止到活跃的自我更新的转变,以及它们沿着有序路线定向到分化命运。最后,他们利用实验室小鼠作为模型系统研究atRA在伤口愈合过程中的影响,他们发现遗传、饮食和局部干预都证实了atRA在平衡干细胞对表皮修复和毛发再生的贡献中的作用。然而,事情并不止于此。他们还证明了atRA的可用性与谱系可塑性呈负相关,在修复早期短暂减少以允许干细胞在伤口床中进行“身份转换”,然后在屏障重新形成后恢复以促进毛发再生。