2023年11月29日，美国 Illumina公司等机构在Nature上发表了题为Identification of constrained sequence elements across 239 primate genomes的文章。
非编码DNA对于我们理解人类基因调控和复杂疾病至关重要，测量进化序列约束可以确定人类基因组中推定的调控元件的功能相关性。与蛋白质编码DNA相比，非编码DNA的进化更快，分离灵长类动物物种的时间相对较短，以及以前全基因组测序的可用性有限，阻碍了鉴定在灵长类动物中特异性受到限制的基因组元件。
该研究构建了239个物种的全基因组比对，代表了灵长类动物中所有现存物种的近一半。使用该资源，研究人员以5% 的错误发现率鉴定了在灵长类动物和其他哺乳动物中处于选择性约束下的人类调控元件。研究人员检测到111318个DNase I超敏性位点和267410个转录因子结合位点，这些位点在灵长类动物中特异性受到限制，但在其他胎盘哺乳动物中不受限制，并验证了它们对基因表达的顺式调控作用。这些调控元件富含影响基因表达和复杂性状和疾病的人类遗传变体。该研究结果强调了近期进化在将包括人类在内的灵长类动物与其他胎盘哺乳动物区分开来的调控序列元件中的重要作用。
