2024年7月9日,卡尔加里大学等机构的研究人员在 Cell 期刊上发表了一篇题为TULIPs decorate the three-dimensional genome of PFA ependymoma的文章。
后窝 A 组(PFA)外胚瘤是一种致命的脑癌,多见于婴幼儿。PFA线性基因组中缺乏驱动事件,这促使我们寻找其三维基因组的特征。
该研究重建了来自不同儿童肿瘤类型的三维基因组,发现了PFA的全局拓扑结构,它与多种人体组织中的干细胞和祖细胞高度相似。PFA中独有的一个显著特点是PFA中的B型超远距离相互作用(TULIPs),这些区域沿着线性基因组相隔很远,但在三维核空间中却以惊人的强度相互影响。TULIPs 出现在所有 PFA 样本中,并在可预测的基因组坐标上重复出现,其形成是由 EZHIP 的表达诱导的。TULIPs 在 PFA 样本中的普遍性表明,其分子原理是一致的,可以在治疗上加以利用。