《无细胞表达平台为iGEM和其他领域提供了新的可能性》

  • 来源专题:人类遗传资源和特殊生物资源流失
  • 编译者: yanyf@mail.las.ac.cn
  • 发布时间:2018-12-10
  • 是时候广泛采用iGEM的无细胞表达方法了。

    在今年的国际基因工程机器(iGEM)大赛之后,一支名为Paris Bettencourt的团队总结了他们在无细胞技术方面的经验。iGEM致力于推进合成生物学,促进开放、友好的合作,它将高中和大学的学生聚集在一起,组成跨学科的团队,“通过解决世界面临的日常问题,推动合成生物学的边界”。在一年一度的iGEM大会上,由近6000名学生组成的团队聚在一起展示他们的作品,并角逐多个奖项,包括类别特定的奖项以及本科生、本科生和高中生的大奖。今年,许多获奖团队利用无细胞系统的速度和易用性,可靠地生产了自然界的推动者和推动者:蛋白质。

    我们大多数人都没有意识到这一点,但是定制蛋白质在我们的日常生活中是必不可少的。它们存在于我们穿的衣服和吃的食物中,存在于许多人赖以维持健康的救命药物中。

    几十年来,我们一直在利用蛋白质的原始来源:细胞制造蛋白质。虽然生物学所选择的制造蛋白质的方法已经足够有效,但研究人员一直在研究将蛋白质生产机器从细胞中分离出来并在外部为其提供动力的方法。换句话说,我们现在可以从DNA到蛋白质而不用担心细胞的挑剔需求。这减少了时间和成本,并允许我们生产可能对细胞有毒或需要特殊条件才能正确折叠和发挥功能的蛋白质。

    Arbor Biosciences是一家领先的公司,致力于为所有人提供易于使用、成本效益高、特别是高效的无细胞表达试剂盒。他们myTXTL®胞外表达平台,最初由文森特•Noireaux博士,明尼苏达大学,是一个所有E。大肠杆菌转录(TX)和翻译(TL)系统提供了一个主混合在一个单一的,现成的管。该管包括蛋白质合成所需的一切-细胞提取物,能源,氨基酸,和辅助因子。你只要添加DNA——或者作为质粒或者合成的线性DNA——蛋白质就会在几分钟内形成。

    在今年的iGEM竞赛中,Arbor Biosciences资助了来自世界各地的七个团队的项目,将细胞无表达技术和技术支持结合起来。每个团队收到的myTXTL工具包被证明是iGEM竞赛的一个很好的工具,因为它快速的设计-构建-测试周期省去了转换、克隆和筛选所需的时间和精力——对于只有几个月时间来完成项目的团队来说,这是一个关键的节省时间的工具。

    那么,这些团队用这些无细胞系统能完成什么呢?

    工程噬菌体作为抗生素的替代品(慕尼黑团队)

    噬菌体疗法最近重新流行起来,作为一种有希望的方法来对抗动物和人类中出现的耐多药细菌感染,这是我们这个时代最大的公共卫生挑战之一。这是由于生物技术的进步,如开发高效的无细胞表达系统,使科学家能够产生生物工程或难以产生的噬菌体。慕尼黑团队利用myTXTL建立了一种简单、有效、快速、安全的噬菌体自组装方法Phactory。

    Phactory的无细胞方法使他们能够在不需要基因工程的情况下,仅仅通过在组装管中加入修饰过的蛋白质,就能构建出量身定做的噬菌体。为了验证这一概念,他们添加了一种含有eYFP的修饰衣壳蛋白,创造了一种荧光T4噬菌体,可以作为诊断或研究目的的成像平台。

    由于他们对噬菌体工程的体外研究方法,该团队在这个大型聚会上获得了研究生组的亚军,他们的几个项目正在申请专利。

    星形抗菌肽帮助法国养猪户对抗抗生素耐药性(Paris-Bettencourt团队)

    抗生素耐药性不仅是人类卫生保健中的一个问题,也是农业中的一个关键问题,对农作物和动物都有影响。为了帮助法国兽医、农民和决策者,来自法国的Paris-Bettencourt团队正在使用无细胞技术生产难以制造的星形抗菌肽(SNAPPs)。

    研究小组选择使用抗菌肽是因为细菌对其产生耐药性更加困难。将几种不同的天然和合成的amp融合到恒星核中,该团队已经能够用合成的生物融合蛋白取代化学合成的snapp。他们的SNAPPs获得了iGEM金奖,代表了一种低成本、低毒的解决方案,可以杀死法国养猪场的革兰氏阴性细菌,而不会进一步加剧抗生素耐药性问题。

    减少水污染,增加蛋白质生产,改善癌症检测

    虽然慕尼黑和巴黎-贝当古团队已经设计了突破性的、屡获殊荣的系统来解决抗生素耐药性问题,但其他由树支持的iGEM团队一直在为一系列广泛的问题提供解决方案。

    西北大学(Northwestern)和努斯杰姆大学(NUSGEM)的研究小组正在分别解决重金属和合成染料造成的水污染问题,而吉夫大学的研究小组则在寻求优化从环状RNA中提取的大规模无细胞蛋白质的生产。此外,EPFL团队正在开发无细胞癌症检测、患者特异性抗原表达和疫苗。每一个团队的成就和奉献是真正鼓舞人心的。

    Arbor Biosciences的Evelyn Eggenstein博士说:“我们认同所有参与项目的学生的辛勤工作、热情和用心。”“通过与培养下一代科学家和创新者的年轻专业人士联系起来,我们认识到他们致力于改善和发展科学世界。”

    Arbor Biosciences将在2019年继续支持iGEM团队,并将在大型聚会上再次展示,以提高人们对无细胞蛋白质合成能力的认识。“我们预计的数量团队使用系统,如游离myTXTL®?增加这项技术使他们能够实现更多的项目目标在同一时期。这一点在使用线性DNA模板(通常由IDT这样的赞助者作为基因块提供)进行无细胞表达时尤其正确,”Arbor Biosciences的Matthew Hymes解释说。

    在iGEM中,无细胞方法正开始产生真正的影响,但这只是冰山一角。无细胞技术不仅缩小了DNA和蛋白质技术之间的差距,而且扩大了我们对疟疾等疾病的认识,提高了我们发现新药和疫苗的机会。而且,无细胞技术正将合成生物学引入生命科学之外的行业。在未来,无细胞技术可能为世界上一些最棘手的问题提供可行、经济和可持续的解决方案。

    ——文章发布于2018年11月29日

相关报告
  • 《新的微流体平台分离细胞类型进行RNA分析》

    • 来源专题:人类遗传资源和特殊生物资源流失
    • 编译者:yanyf@mail.las.ac.cn
    • 发布时间:2019-02-22
    • 麻省理工学院布罗德研究所(Broad Institute)和麻省总医院(Massachusetts General Hospital)的科学家领导的一个团队开发了一种原型设备,利用微流体技术对从临床样本中提取的细胞类型进行分类,以进行RNA测序。 “这个平台允许我们在样本中分离特定的细胞亚群,因此我们可以进行RNA测序,并解决不同细胞类型的生物学问题,”第一作者Miguel Reyes解释道。“我们已经把这条复杂的管线浓缩成一个更容易使用的设备,有可能扩大规模,用于需要大量人群参与的研究——这是许多分析工具一直在努力解决的问题。” 领导的研究成果发表在科学进步,雷耶斯和高级作者保罗•Blainey核心成员广泛研究所和生物工程系副教授在麻省理工学院,和Nir Hacohen研究所成员广泛,中心主任癌症免疫疗法在马萨诸塞州综合医院和哈佛医学院的副教授。 这个团队开发了他们的平台来帮助研究人员以更高的分辨率分析细胞。对于血液和其他类型的临床样本,批量RNA测序是一种标准分析方法。然而,使用这种方法混合不同的细胞提供有限的信息,具体的细胞类型。 这个新平台有可能填补血液样本的批量RNA测序和高分辨率单细胞RNA测序之间的空白,这一过程对于大量样本来说仍然难以扩大规模。 研究人员表示,通过将细胞分类过程集成到单个设备中,该平台不再需要获取、编程和监控复杂的液体处理机器人,也不再需要将多个仪器集成到工作流程中。该团队将他们的系统与通常手工实现的用于细胞子集净化和RNA-seq库构建的标准方法进行了基准测试,发现在资源效率更高的情况下,该方法的性能同样好或更好。 作为试点分析,研究人员还对5名系统性红斑狼疮患者和布里格姆妇女医院的5名健康对照组的免疫细胞进行了排序。他们利用该平台分离了CD4+ T细胞、CD8+ T细胞、B细胞和CD14+细胞,确定了经典狼疮基因表达特征主要在B细胞中表达。 Hacohen说:“有数百万的血液样本仅仅是全血的形式,没有任何细胞的分离。只有这样的数据,很难对不同的细胞类型提出问题。”“该领域需要一种成本效益高的方法,将全血样本转化为能够独立分析的细胞子集。” 该团队设想了一种管道,其中单细胞分析可以作为一种无偏发现工具,首先用于首批样本。Blainey说:“一个团队可以使用这样的平台来分离他们想要研究的类型——在一个可扩展的水平上,潜在地在单细胞还不可行的大群体中。”“我们已经证明,这类工作的小型化和流程集成是可能的。” 这项研究的部分资金由国家过敏和传染病研究所(U24 AI118668)和Burroughs Wellcome基金提供。
  • 《Kite首席负责人加盟细胞治疗领域新玩家》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2018-08-08
    • 今天,细胞治疗领域的Cell Medica公司宣布任命Chris Nowers为首席执行官,以推动其CAR-NKT和TCR-T候选产品的临床开发和市场发展。 CAR-T和PD-1的成功商业运作 在加入Cell Medica之前,Chris Nowers是Gilead/Kite欧洲市场的首席负责人,他负责CAR-T细胞产品Yescarta(axicabtagene ciloleucel)的全面商业化。在Kite公司任职期间,Nowers从零起点开始建立公司在欧洲的组织,并在2017 Gilead(吉利德)120亿美元收购Kite后,负责在欧洲、中东和非洲等地区继续扩大Kite的组织。 现在,在领导Kite 22个月后,Nowers决定离开公司,也是因为Yescarta即将在欧洲上市(使命完成,转战下一场)。 在加入Kite之前,Nowers在生物制药行业的职业生涯已经超过了25年,曾担任多个高级领导职务,包括Avantogen Oncology的首席执行官,Amgen的综合管理职位,以及Bristol-Myers Squibb(BMS)的高级全球和区域商业领导职位。 而且在BMS期间,Nowers建立并领导了成功推出检查点抑制剂ipilimumab(Yervoy)和nivolumab(Opdivo)的团队。 那么继BMS、Kite之后,Chris Nowers为什么选择了Cell Medica? 坐拥3大细胞治疗研发平台 Cell Medica成立于2006年,其创始人Gregg Sando是细胞免疫治疗领域的先驱。目前,即将开展的研究CAR修饰细胞治疗产品的临床试验将标志着公司发展的重要新篇章。 近年来, Cell Medica已经筹集了超过1亿英镑(1.31亿美元)的资金,并且通过收购资产和技术以及与休斯敦贝勒医学院的合作,建立了公司的细胞治疗平台。其中包括一些即将步入临床的CAR-NKT和TCR资产。 CAR-NKT技术平台 自体细胞疗法:基于该技术平台,研发进展最快的是用于治疗神经母细胞瘤和小细胞肺癌的CMD-501(GD2-CAR NKT)。 这是一种自体细胞疗法,利用公司的天然杀伤T(NKT)细胞平台技术,结合基因工程嵌合抗原受体(CARs)和IL-15细胞因子的分泌,在免疫抑制肿瘤微环境下维持治疗细胞的活性。 目前,一项评估CMD-501在神经母细胞瘤儿科患者中的安全性和活性的第一阶段试验正在由位于休斯敦的德克萨斯儿童医院的贝勒医学院(BCM)进行。 同种异体细胞疗法:CMD-502是一种现成的(off the shelf)同种异体产品,目前正在开发用于治疗血液癌症(靶点未公开)。 这种同种异体的细胞疗法基于NKT细胞的独特特性。由于NKT细胞的T细胞受体是不变的并且不靶向人抗原,因此同种异体CAR修饰的NKT细胞可以最大限度的降低患者由于移植物抗宿主病而产生的毒性风险。 Dominant TCR技术平台 CMD-601:正在开发的CMD-601是一种靶向survivin癌抗原的自体细胞疗法,用于治疗胰腺癌,卵巢癌,胃癌和其他可能的癌症。CMD-601由经遗传修饰的免疫细胞组成,以表达识别来自survivin蛋白的肽的新型T细胞受体(TCR)。 其中Survivin是一种细胞内肿瘤相关抗原,可抑制细胞凋亡,在维持肿瘤细胞表型和功能方面发挥着至关重要的作用。Survivin在许多人类肿瘤和胎儿组织中高度表达,但在正常成人组织中几乎不存在,其仅在细胞分裂期间短暂表达。作为贝勒医学院合作项目的一部分,Gianpietro Dotti和Barbara Savoldo教授公开发表的研究表明,这种TCR能够在保护健康T细胞的同时,特异性的靶向肿瘤细胞。 CMD-602:此外,2017年6月,Cell Medica还收购了Catapult Therapy TCR和该公司的基因修饰WT1-TCR T细胞治疗候选药物。 WT1-TCR-T细胞疗法的开发应用将进一步结合Cell Medica从UCL Business获得的Dominant TCR技术平台,以催生出更有效的产品,或许将具备治疗实体瘤(如间皮瘤和卵巢癌)的潜力,Cell Medica将在2018年年底推出基于Dominant TCR技术的WT1-TCR-T细胞疗法(Dominant WT1-TCR-T)。 EBV技术平台 CMD-003:目前,公司进展最快的候选产品是与贝勒医学院(CAGT)的细胞基因治疗中心合作开发的CMD-003,这是一种改造患者T细胞并激活其特异性杀伤表达EBV抗原的肿瘤细胞的试验性疗法。 它从患者体内分离出T细胞和其它免疫细胞,并在体外用EB病毒特异性抗原激活T细胞,随后将激活的T细胞输回患者体内,以攻击携带EB病毒抗原的肿瘤细胞。CMD-003治疗主要针对4种EBV抗原表位,分别是:LMP1, LMP2, EBNA和BARF1。 2017年2月21日,Cell Medica宣布,CMD-003已经通过美国FDA快速通道资格认证,用于治疗由Epstein Barr病毒(EBV)引起的复发/难治性淋巴瘤和移植后淋巴组织增生性疾病。 建立细胞治疗生产中心 2017年,Cell Medica在宣布收购Cell and Gene Therapy Catapult (CGT Catapult)的一家子公司Catapult Therapy TCR Limited时,同时还与CGT Catapult开展了另一项合作,将在CGT Catapult位于英国斯蒂夫尼奇的GMP生产基地建设Cell Medica的细胞治疗生产中心。 Cell Medica与CGT Catapult将应用最先进的生产制备工艺应用于WT1-TCR-T细胞的大规模工业化生产。同时,Cell Medica也将评估这个生产中心制备旗下其他细胞治疗产品的可行性。 2018年4月23日,CGT Catapult的细胞和基因治疗制造中心正式启用。以斯蒂夫尼为基地的中心,按照临床产品制造的GMP标准运作,将为全球先进治疗行业提供基础设施,以开发大规模细胞和基因治疗临床研究的制造能力和系统,加速其商业化发展。 领导团队 Chris Nowers评论: Cell Medica拥有一系列令人兴奋的技术,将有助于开发针对血癌和实体肿瘤的个性化细胞免疫疗法的潜力。我期待着与公司优秀的管理人员和科学团队合作,通过临床开发将这些有前景的治疗方法带给患者 Gregg Sando评论: 创建Cell Medica并领导一支专注的同事和研究合作者团队是一次非常棒的经历,他们一直致力于通过基于细胞的免疫疗法改变癌症治疗方法。目前,公司处于一个令人振奋的未来的良好定位,现在是时候过渡到新的领导者,将我们的产品和技术通过临床开发推向商业化。