《美国埃默里大学等关于迅速变化的COVID-19流行病的综述》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2020-03-04
  • 2月28日,JAMA发表了来自美国埃默里大学、密歇根大学的研究团队的题为“COVID-19—New Insights on a Rapidly Changing Epidemic”的观点性文章,该文章从病毒、流行病学、临床特征、病死率等方面综述了近期与冠状病毒相关研究的现状和研究趋势。
    一、病毒
    新型冠状病毒被WHO命名为2019-nCoV,被国际病毒分类委员会命名为SARS-CoV-2;病毒很可能起源于菊花蝙蝠,通过S刺突蛋白进入宿主细胞,与人类ACE2酶受体结合。但是,针对SARS-CoV受体结合域的单克隆抗体与SARS-CoV-2的结合并不多,这说明它是一种新型病毒。ACE2酶在II型肺泡细胞中表达,而亚洲男性的肺中有大量ACE2表达细胞,这可以部分解释COVID-19患者男性居多的现象。但是,其他因素比如中国男性吸烟率较高,也可以解释该疾病性别分布的差异。蝙蝠与人类之间可能存在中间宿主,初步数据表明可能是穿山甲。
    二、流行病学
    目前的潜伏期估计为1到14天,中位数为5到6天;但是最近的病例报告显示潜伏期可能长达24天。该病毒主要通过飞沫传播,但也已在粪便和血液中发现。如果确认该病毒可以通过粪便传播,则可能需要采取不同的预防措施。尽管处于初期,SARS-CoV-2 的生殖数(R0)估计为2到3之间,这表明大流行的可能性比SARS高。从无症状载体出现传输是可能的。一个上未解决问题是,中国境内境外还有多少未被统计的感染者。一项使用航空旅行数据的研究估计,从中国大陆离境的COVID-19病例中约有三分之二仍未被发现。
    三、临床特征
    已发表的有关住院患者的研究表明,患者年龄中位数为50岁,以男性为主。约25%的患者病情严重,需要重症监护,约10%的患者需要机械通气。临床表现通常包括发烧(83%至98%的患者)、干咳(76%至82%)和疲劳或肌痛(11%至44%)。研究还报告了其他症状例如头痛,喉咙痛,腹痛和腹泻。实验室检查结果显示异常的指标包括淋巴细胞减少症(70%),凝血酶原时间延长(58%)和乳酸脱氢酶升高(40%)。胸部X光片的特征是双侧斑片状浸润和胸部CT扫描显示毛玻璃浸润。
    四、病死率
    早期报告表明,湖北省感染老年人的感染率可能高达8%至15%。在患有严重呼吸道症状的合并症患者中,病死率升高。有限的数据表明湖北以外的病死率却低得多,可能不超过1%至2%。
    五、筛查与诊断
    WHO和CDC均建议对有湖北接触史、密切接触者、有发烧等不良反应等相关人员进行筛查,目前,测试能力仍然有限。
    在疾病筛查方面,建议RT-PCR测试的标本应是鼻咽而不是咽拭子,最好是下呼吸道标本,例如诱导痰或支气管肺泡灌洗液。可以使用医院实验室中的普遍预防措施来进行其他检查,血清样本检测也是可行的,不建议进行病毒培养。
    六、临床护理与治疗
    在护理方面,主要包括基础护理和及时补充氧气。不推荐使用糖皮质激素。在治疗方面,雷姆昔韦、洛匹那韦/利托那韦、favilavir等药物有可能有用。总体而言,目前正在进行100多项临床试验,以测试寻找特效药。
    七、预防和感染控制
    当前没有针对SARS-CoV-2的疫苗。目前已有11种以上的候选疫苗正在开发,NIH开发的mRNA疫苗的第一阶段研究预计将于2020年3月开始。感染防控是关键,CDC建议医护人员使用个人防护设备(PPE)并执行标准,接触和空中预防措施。全球的疫情的迅速发展引发了关于隔离区是否有效的争论。一方面,中国采取的严格措施并没有阻止SARS-CoV-2在全球的传播。另一方面,钻石公主号的隔离措施增加了传播。

  • 原文来源:https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2762510?resultClick=1
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    • 2月28日_美国埃默里大学等关于迅速变化的COVID-19流行病的综述 1.时间:2020年2月28日 2.机构或团队:美国埃默里大学、密歇根大学 3.事件概要: 2月28日,JAMA发表了来自美国埃默里大学、密歇根大学的研究团队的题为“COVID-19—New Insights on a Rapidly Changing Epidemic”的观点性文章,该文章从病毒、流行病学、临床特征、病死率等方面综述了近期与冠状病毒相关研究的现状和研究趋势。 一、病毒 新型冠状病毒被WHO命名为2019-nCoV,被国际病毒分类委员会命名为SARS-CoV-2;病毒很可能起源于菊花蝙蝠,通过S刺突蛋白进入宿主细胞,与人类ACE2酶受体结合。但是,针对SARS-CoV受体结合域的单克隆抗体与SARS-CoV-2的结合并不多,这说明它是一种新型病毒。ACE2酶在II型肺泡细胞中表达,而亚洲男性的肺中有大量ACE2表达细胞,这可以部分解释COVID-19患者男性居多的现象。但是,其他因素比如中国男性吸烟率较高,也可以解释该疾病性别分布的差异。蝙蝠与人类之间可能存在中间宿主,初步数据表明可能是穿山甲。 二、流行病学 目前的潜伏期估计为1到14天,中位数为5到6天;但是最近的病例报告显示潜伏期可能长达24天。该病毒主要通过飞沫传播,但也已在粪便和血液中发现。如果确认该病毒可以通过粪便传播,则可能需要采取不同的预防措施。尽管处于初期,SARS-CoV-2 的生殖数(R0)估计为2到3之间,这表明大流行的可能性比SARS高。从无症状载体出现传输是可能的。一个上未解决问题是,中国境内境外还有多少未被统计的感染者。一项使用航空旅行数据的研究估计,从中国大陆离境的COVID-19病例中约有三分之二仍未被发现。 三、临床特征 已发表的有关住院患者的研究表明,患者年龄中位数为50岁,以男性为主。约25%的患者病情严重,需要重症监护,约10%的患者需要机械通气。临床表现通常包括发烧(83%至98%的患者)、干咳(76%至82%)和疲劳或肌痛(11%至44%)。研究还报告了其他症状例如头痛,喉咙痛,腹痛和腹泻。实验室检查结果显示异常的指标包括淋巴细胞减少症(70%),凝血酶原时间延长(58%)和乳酸脱氢酶升高(40%)。胸部X光片的特征是双侧斑片状浸润和胸部CT扫描显示毛玻璃浸润。 四、病死率 早期报告表明,湖北省感染老年人的感染率可能高达8%至15%。在患有严重呼吸道症状的合并症患者中,病死率升高。有限的数据表明湖北以外的病死率却低得多,可能不超过1%至2%。 五、筛查与诊断 WHO和CDC均建议对有湖北接触史、密切接触者、有发烧等不良反应等相关人员进行筛查,目前,测试能力仍然有限。 在疾病筛查方面,建议RT-PCR测试的标本应是鼻咽而不是咽拭子,最好是下呼吸道标本,例如诱导痰或支气管肺泡灌洗液。可以使用医院实验室中的普遍预防措施来进行其他检查,血清样本检测也是可行的,不建议进行病毒培养。 六、临床护理与治疗 在护理方面,主要包括基础护理和及时补充氧气。不推荐使用糖皮质激素。在治疗方面,雷姆昔韦、洛匹那韦/利托那韦、favilavir等药物有可能有用。总体而言,目前正在进行100多项临床试验,以测试寻找特效药。 七、预防和感染控制 当前没有针对SARS-CoV-2的疫苗。目前已有11种以上的候选疫苗正在开发,NIH开发的mRNA疫苗的第一阶段研究预计将于2020年3月开始。感染防控是关键,CDC建议医护人员使用个人防护设备(PPE)并执行标准,接触和空中预防措施。全球的疫情的迅速发展引发了关于隔离区是否有效的争论。一方面,中国采取的严格措施并没有阻止SARS-CoV-2在全球的传播。另一方面,钻石公主号的隔离措施增加了传播。 4.附件: 原文链接https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2762510?resultClick=1
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    • 编译者:yanyf@mail.las.ac.cn
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    • COVID-19如何劫持宿主细胞 德国海德堡大学(Heidelberg University)的研究人员进行了详细的成像分析,以确定导致COVID-19的SARS-CoV-2病毒是如何对感染细胞进行重组的。这只需要24到48小时。他们的图像显示“感染细胞的内膜系统发生了明显而巨大的变化。”“这些系统允许细胞定义不同的隔间和位置。病毒引起膜的变化,所以它可以产生自己的复制细胞器,放大病毒基因组。研究人员将其描述为“大量气泡的聚集:两层膜形成一个大气球。”气球形成了一个屏蔽隔间,病毒基因组在这里繁殖和释放,合并成新的病毒颗粒。 海德堡大学(Heidelberg)传染病分子病毒学系教授拉尔夫·布拉滕施拉格(Ralf Bratenschlager)说:“到目前为止,我们可以预计冠状病毒将变得具有季节性。”“因此,迫切需要开发和实施针对该病毒的预防和治疗策略。” 这些变化是在感染后几小时内观察到的。因为他们相信这可能是新疗法的关键,他们表示希望3D结构信息和他们收集的其他数据能让每个人都能使用。 “我相信,我们正在与科学界共享我们产生的所有数据,这是一个先例,”海德堡电子显微镜核心设备的负责人、团队负责人Yannick Schwab说。“通过这种方式,我们可以支持研究SARS-CoV-2如何与其宿主相互作用的全球努力。” COVID-19和嗅觉 COVID-19的一个特殊特征是丧失嗅觉和味觉,影响约80%的患者。为什么,怎么做,为什么?早期有人担心它会影响中枢神经系统,但越来越多的数据表明它影响了鼻上皮。嗅觉神经元没有ACE2受体,这是SARS-CoV-2病毒感染细胞的主要方式,但支持嗅觉神经元的支撑细胞有。这些细胞参与了粘液中盐离子的平衡,神经元需要这些盐离子向大脑发送信号。当干扰时,它会关闭神经元信号和嗅觉。在最近对携带SARS-CoV-2的金色叙利亚仓鼠的实验中,支持细胞被迅速感染,但嗅觉神经元没有。但是嗅觉上皮完全脱落,影响了具有嗅觉感受器和探测气味的纤毛。目前还不清楚这种破坏是由病毒本身引起的,还是由免疫细胞对病毒的反应引起的。病毒是如何影响味觉的就更不清楚了。味觉感受器细胞也没有ACE2感受器,但舌头上的支持细胞有。 分子碘漱口水对COVID-19有效 犹他州立大学抗病毒研究所的研究人员比较了四种漱口水的抗病毒功效。美国牙科协会推荐两种,1.5%的过氧化氢和0.2%的聚维酮碘。另一种是0.12%的洗必泰葡萄糖酸盐(chlorhexidgluconate),获得了美国药学会的认可。第四种是碘国际公司(ioTech International)开发的分子碘口腔漂洗剂,也接受了测试。测试是由大学研究人员在一个3级生物控制实验室进行的。含碘分子100ppm的漱口水在30秒内完全有效。另一组即使在60秒后仍然部分有效。两种碘溶液都不具有细胞毒性。过氧化氢和洗必定葡萄糖酸洗液显示出毒性。 MMR疫苗可能对COVID-19提供保护 世界组织在佐治亚州沃特金斯维尔进行的一项新研究提供了支持证据,表明麻疹-腮腺炎-风疹(MMR)疫苗可能提供对COVID-19的保护。他们证明,在以前接种过MMR II疫苗的新冠肺炎患者中,腮腺炎IgG滴度与严重程度呈负相关。MMR II疫苗由默克公司生产,含有麻疹的Edmonston毒株、流行性腮腺炎的Jeryl Lynn (b级)毒株和风疹的Wistar RA 27/3毒株。 “在42岁以下接种过MMR II疫苗的人群中,我们发现流行性腮腺炎滴度水平与COVID-19严重程度之间具有统计上显著的负相关关系,”该研究的第一作者、世界组织主席Jeffrey E. Gold说。这进一步证明了MMR疫苗可能对COVID-19具有保护作用。这也可以解释为什么儿童的COVID-19病例率比成年人低得多,死亡率也低得多。大多数儿童在12到15个月左右接种第一次MMR疫苗,第二次接种是在4到6岁。” 解码端粒动力学 端粒是染色体的末端,由长而重复的DNA序列和结合蛋白组成。如果端粒功能失常,就不能保持染色体的稳定性,从而导致癌症等疾病。端粒缩短也与细胞死亡有关。京都大学的研究人员使用一种新的合成探针来可视化活细胞中的染色体尖端。与其他用于分析端粒的探针不同,这些探针使用了一种合成吡啶咪唑聚酰胺(PIP)探针,可以用于活细胞,不那么耗时,也不会用刺激性化学物质使DNA变性。 减少COVID-19传播的最有效战略 西蒙弗雷泽大学的研究人员开发了一个模型,以评估减少COVID-19传播的各种方法的有效性。这些包括身体距离、面具或社交泡沫。他们发现,物理距离是最普遍有效的。社会泡沫和面具更依赖于情况。这项研究创造了“R事件”的概念,即在一个事件中由一个人感染COVID-19的预期人数。这些因素包括传播强度、接触时间、个体距离和混合程度等。然后,他们从各种事件(如聚会、餐饮、夜总会、公共交通和餐馆)的爆发报告中提取数据。他们发现,被感染的可能性很大程度上取决于传播率和在特定环境中所花费的时间。高传输设置包括酒吧、夜总会和过度拥挤的工作场所;低传输设置包括带口罩的公共交通、在餐馆和户外活动时保持距离。他们还指出,在聚会、唱诗班、餐厅厨房、拥挤的办公室、夜总会和酒吧等饱和、高传播率的环境中,口罩和其他屏障可能没有那么有效。 频繁、快速的检测是造成COVID-19瘫痪的关键 科罗拉多大学博尔德分校的一项研究发现,在抗击COVID-19方面,测试频率和测试周转时间比测试灵敏度更重要。也就是说,易于获取的快速检测比高灵敏度的实验室检测更有价值,后者可能需要几天才能得到反应(或需要几天才能完成)。他们认为,每周对半数人口进行廉价、快速好转的COVID-19检测,可以在数周内几乎消灭病毒,即使它们的敏感性明显低于黄金标准的PCR检测。从本质上说,更快的数据让人们更早地自我隔离。 该研究的主要作者、科罗拉多大学博尔德分校计算机科学助理教授丹尼尔·拉尔莫尔(Daniel Larremore)说:“我们的重大发现是,当涉及到公共卫生问题时,最好是今天做一个有结果的不那么敏感的测试,而不是明天做一个有结果的敏感测试。”“与其让所有人呆在家里,这样你就可以确保一个病人不会传播病毒,我们可以让只有那些有传染性的人待在家里,让所有人都可以继续生活。”