《Nature | 古代疟原虫基因组揭示了人类疟疾的历史》

  • 编译者: 李康音
  • 发布时间:2024-06-14
  • 2024年6月12日,哈佛大学等机构的研究人员在 Nature 期刊发表了题为Ancient Plasmodium genomes shed light on the history of human malaria的文章。

    疟原虫属的致疟原生动物对人类基因组产生了最强大的选择压力,抗药性等位基因提供了生物分子足迹,勾勒出这些物种的历史影响范围。尽管如此,关于疟原虫何时以及如何成为人类病原体并在全球传播的争论依然存在。

    为了解决这些问题,研究人员从 16 个国家的恶性疟原虫、间日疟原虫和疟疾疟原虫中获得了高覆盖率的古代线粒体和核基因组数据,这些数据跨越了约 5500 年的人类历史。早在公元前四千年和公元前一千年,研究人员就分别在欧亚大陆地理位置不同的地区发现了恶性疟原虫和间日疟原虫;对于间日疟原虫,这些证据比文字记载早了几千年。 基因组分析支持恶性疟原虫和间日疟原虫不同的疾病历史。恶性疟原虫和间日疟原虫在美洲的不同疾病史:现已灭绝的欧洲菌株和接触前南美洲菌株之间的相似性表明,欧洲殖民者是美洲间日疟原虫的来源,而跨大西洋奴隶贸易很可能将恶性疟原虫引入美洲。该研究的数据强调了跨文化接触在疟疾传播中的作用,为今后研究疟原虫对人类历史的影响奠定了生物分子基础。

    最后,研究人员在喜马拉雅山高海拔地区意外发现恶性疟原虫,这提供了一个罕见的案例研究,可以从感染状况推断出个体的流动性,增加了我们对近三千年前该地区跨文化联系的了解。

相关报告
  • 《Nature | 古代基因组揭示了奇琴伊察的仪式生活》

    • 编译者:李康音
    • 发布时间:2024-06-15
    • 2024年6月12日,马克斯-普朗克进化人类学研究所等机构的研究人员在 Nature 期刊发表了题为Ancient genomes reveal insights into ritual life at Chichén Itzá的文章。 位于墨西哥尤卡坦半岛的奇琴伊察古城是古典晚期和古典末期(公元600-1000年)最大和最有影响力的玛雅人定居点之一,它仍然是中美洲研究最深入的考古遗址之一。然而,关于其仪式空间的社会和文化用途,以及其人口与其他中美洲群体的遗传联系,许多问题仍未得到解答。 该研究展示了从64个亚成年个体中获得的全基因组数据,这些个体可追溯到公元500-900年左右,这些个体是在奇琴伊察仪式中心的神圣天然井(天坑)附近的一个地下集体埋葬中发现的。遗传分析表明,所分析的个体均为雄性,有几个个体亲缘关系密切,包括两对同卵双胞胎。双胞胎在玛雅和更广泛的中美洲神话中占有重要地位,他们体现了神和英雄之间的二元性(5),但直到现在,他们还没有在古玛雅的殡葬背景中被确认。与该地区现代人的遗传比较表明,除了与人类免疫有关的某些遗传位点,包括人类白细胞抗原复合物,与奇琴伊察古代居民的遗传具有连续性外,这表明由于殖民时期传入该地区的传染病而产生的适应信号。
  • 《Nature | 家族水平基因组揭示了鸟类演化的复杂性》

    • 来源专题:战略生物资源
    • 编译者:李康音
    • 发布时间:2024-04-10
    • 2024年4月2日,浙江大学生命演化研究中心张国捷教授组织的国际万种鸟类基因组研究计划在在Nature 在线发表题为Complexity of avian evolution revealed by family-level genomes的研究论文。 该研究覆盖了92%的现生鸟科代表物种,利用全基因组数据重新构建了现生鸟类系统发育树,建立了一套新的鸟类分类划分方案,改变了过去对鸟类演化历史的认识。 该研究利用基因间区数据集重构鸟类系统发育关系,将包含了约95%现生鸟类物种的新鸟类被重新梳理为四个主要的演化分支,分别是奇迹鸟类(火烈鸟总目)、鸽鸨类、陆鸟类和元素鸟类。其中 “元素鸟类”是本研究中新确定的类群,包含了麝雉目、夜鹰目、鹤形目等类群。新的鸟类生命之树解决了主要代表鸟类类群一直悬而未决的演化地位问题。研究对鸟类系统发育树进行了更精准的推断,也为新鸟类在白垩纪末大灭绝事件之后发生物种大爆发的假说提供证据支持。