《10月28日_多组学分析发现轻度和中度COVID-19之间的急剧变化》

  • 来源专题:COVID-19科研动态监测
  • 编译者: zhangmin
  • 发布时间:2020-11-17
  • 美国系统生物学研究所、华盛顿大学和斯坦福大学等机构的研究人员10月28日在期刊Cell上在线发表题为“Multi-omics resolves a sharp disease-state shift between mild and moderate COVID-19”的文章。
    研究人员收集了139名COVID-19患者的血液样本,通过对其临床测量、免疫细胞和血浆多组学进行综合分析,发现了COVID-19疾病从轻度到中度的一个主要转变,即炎症信号升高伴随着特定种类代谢产物和代谢过程的丢失。在COVID-19中度患者的血浆环境中,多种不寻常的免疫细胞表型出现,并且随着疾病严重程度的增加而放大。研究人员将超过12万个免疫特征集中到一个单一的轴上,以捕获不同免疫细胞类别如何协调响应SARS-CoV-2。这一免疫反应轴与患者的主要血浆成分变化、临床凝血指标以及从轻度到中度疾病的急剧转变相一致。这项研究表明,对COVID-19中度患者进行治疗干预可能是最有效的
    原文链接:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)31444-6#%20

  • 原文来源:https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)31444-6#%20
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    • 编译者:huangcui
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    • 新型冠状病毒SARS-CoV-2导致2019年冠状病毒病(COVID-19),如今正在全球肆虐。SARS-CoV-2病毒表面装饰着多个拷贝的刺突蛋白(也称为S蛋白)。S蛋白在这种病毒感染中起着至关重要的作用。S蛋白与人体细胞表面上的ACE2受体结合,使得这种病毒能够进入宿主细胞并开始复制,从而造成广泛的损害。 在此之前已有6种冠状病毒可以感染人类,它们主要引起人类的呼吸道感染:两种高度致命性的冠状病毒,即严重急性呼吸道综合征(SARS)冠状病毒(SARS-CoV)和中东呼吸综合征(MERS)冠状病毒(MERS-CoV);4种可导致温 和的上呼吸道疾病的冠状病毒,即HCoV-OC43、HCoV-229E、HCoV-NL63和HCoV-HKU1。 SARS-CoV-2与另外两种密切相关的高致病性病毒SARS-CoV和 MERS-CoV同属冠状病毒科β冠状病毒属。SARS-CoV-2有一个大小为30kb的正义、单链RNA基因组。它的核衣壳蛋白(N)和由膜蛋白(M)、包膜蛋白(E)以及刺突蛋白(S)组成的外膜包覆着它的基因组。 在一项新的研究中,来自美国拉根研究所、麻省理工学院、哈佛医学院和麻省总医院的研究人员对139名不同疾病严重程度的COVID-19患者的临床测量结果、免疫细胞和血浆多组学(plasma multi-omics)数据进行了综合分析,这些患者是在确诊后的第一周期间接受连续采血。相关研究结果近期发表在Cell期刊上,论文标题为“Multi-omics resolves a sharp disease-state shift between mild and moderate COVID-19”。 这些研究人员鉴定出轻度COVID-19和中度COVID-19之间的一个主要转变,在这个转变点,炎症信号的升高伴随着特定类代谢物和代谢过程的丧失。在中度COVID-19患者的这种应激的血浆环境中,出现了多种不同寻常的免疫细胞表型,并这些表型随着疾病严重程度的增加而放大。 这些研究人员将120000多种免疫特征浓缩成一个轴,以捕捉不同免疫细胞类型如何协调对SARS-CoV-2感染作出反应。这个免疫反应轴(immune-response axis)独立地与主要血浆成分变化、临床凝血指标以及从轻度COVID-19到中度COVID-19的急剧转变相一致。这项研究表明,中度COVID-19可能为治疗干预提供最有效的环境。
  • 《4月28日_中国科学院武汉病毒所等研究发现与COVID-19相关的血浆代谢组学和脂质组学异常》

    • 来源专题:COVID-19科研动态监测
    • 编译者:zhangmin
    • 发布时间:2020-04-30
    • 1.时间:2020年4月28日 2.机构或团队:中国科学院武汉病毒所生物安全大科学研究中心、武汉市金银潭医院、华中科技大学同济医学院附属协和医院、华中科技大学同济医学院附属同济医院、武汉迈特维尔生物科技有限公司、厦门大学、中国科学院大学 3.事件概要: National Science Review 于4月28日出版了中国科学院武汉病毒所生物安全大科学研究中心等机构的文章“Plasma Metabolomic and Lipidomic Alterations Associated with COVID-19”。 文章指出,与COVID-19相关的生理变化还鲜为人知。在这项研究中,研究人员对一群经历了不同症状的COVID-19患者进行了血浆靶向代谢组学和脂质组学分析。发现这些COVID-19患者的代谢物和血脂变化与疾病进程具有明显的相关性,表明COVID-19的发展影响了患者的全身代谢。特别是,TCA循环(三羧酸循环)的苹果酸和尿素循环的氨甲基磷酸分别揭示了能量代谢和肝功能障碍的改变。文章表示,应当指出的是,与轻度患者相比,生命垂危患者的氨甲基磷酸被显着下调。更重要的是,不仅由鸟苷酸(GMP)合酶而且由CD39和CD73介导的鸟苷酸在健康受试者和COVID-19患者之间以及轻度和生命垂危组之间都发生了显著变化。另外,在COVID-19患者中观察到脂代谢异常。总体而言,已发现代谢紊乱的模式与COVID-19的进展和严重程度一致。文章表示,这项工作提供了与COVID-19相关的血浆生物标志物和潜在治疗靶点的宝贵知识,以及进一步研究COVID-19发病机理的重要资源。 4.附件: 原文链接:https://academic.oup.com/nsr/advance-article/doi/10.1093/nsr/nwaa086/5826189?searchresult=1#