中国科学院干细胞库成立于2007年1月。主管机构为中国科学院上海生命科学研究院。由中国科学院上海生命科学研究院和中国科学院上海生科院生物化学与细胞生物学研究所共同支持建立。依托中国科学院上海生科院生化细胞所，经过数年努力，已组建起一条从高级--中级--初级科研人员的完整的人才梯队，青年技术人才水平不断提高，具有自主研究和为国内外研究团队提供干细胞专项服务的能力。目前，中国科学院干细胞库已收集、保存了一百余种各类胚胎干细胞、iPS细胞、成体干细胞、间充质干细胞和其它细胞系，总库容超过一万株。该库每年向国内各个科研院所提供三百余株各类干细胞和饲养层等普通细胞，并常年提供免费的干细胞相关技术咨询。同时，该库在干细胞建系、保种、培养、鉴定、诱导分化等方面也积累了丰富的经验，尤其在胚胎干细胞基因操作上，已经能够熟练地进行同源重组、随机插入等基因操作，经设计制备的基因同源重组ES细胞株已经成功地得到基因敲除小鼠。此外，整个团队在研究干细胞全能性维持和诱导分化的机理方面，也具有较强的科研实力，积累了不少研究成果，发表了高质量的研究论文。
