《有关 SARS-CoV-2“感兴趣的变体”JN.1 的信息》

  • 来源专题:新发突发传染病
  • 编译者: 张玢
  • 发布时间:2024-01-17
  • "BA.2.86的子型JN.1已成为美国主要的SARS-CoV-2变种,而其母变种从未达到过这一地位。幸运的是,尽管COVID-19病例激增,但从这种疾病导致的住院和死亡人数仍远远低于一年前的同期。

    当BA.2.86在去年夏天加入SARS-CoV-2 Omicron家族时,它吸引了流行病追踪者的注意,因为它与其前体BA.2有很大不同。与BA.2相比,BA.2.86的尖刺蛋白携带了30多个突变,这表明它可能比其前体更容易传播。

    但即使具有这些新的突变,BA.2.86也未能成为其他亚型的主导者。根据美国疾病控制和预防中心(CDC)的现场估计,截至今年1月初,BA.2.86在美国流行的SARS-CoV-2亚型中所占份额从未超过3%。

    全球范围内,根据世界卫生组织(WHO)的数据,到2023年11月初,BA.2.86在可用的SARS-CoV-2序列中占比8.9%,WHO于11月20日将BA.2.86及其亚系列归类为关注变种。在2023年11月初,BA.2.86在全球范围内占据了8.9%的SARS-CoV-2序列。在一篇于1月4日发表的观点文章中,斯克里普斯研究所分子医学教授埃里克·托普尔(Eric Topol,MD)提出,BA.2.86与以前的Omicron亚型有着如此大的不同,以至于WHO应该将其定为关注变种,并赋予其不同的希腊字母名称。

    在将整个不断增长的BA.2.86家族归类为关注变种四周后,WHO也将JN.1单独归类为关注变种,因为它的传播速度迅速增加。根据CDC的现场估计,到今年1月初,JN.1在美国流行的变种中所占份额估计已飙升至61.6%,而仅仅两周前这一比例为38.8%。"


  • 原文来源:https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2814112
相关报告
  • 《 美国国立卫生研究院对 SARS-CoV-2 变体的优先级划分》

    • 来源专题:新发突发传染病
    • 编译者:张玢
    • 发布时间:2023-04-17
    • 作为美国国立卫生研究院 (NIH) 国家过敏和传染病研究所 (NIAID) SARS-CoV-2 病毒进化评估 (SAVE) 抗击 SARS-CoV-2 大流行工作的一部分,NIH NIAID Save 早期检测小组定期优先考虑 SARS-CoV-2 变体。优先级划分的主要目标是通过整合最新的流行病学、结构和遗传信息,确定NIH SAVE网络中实验组进行表型测试的相关谱系。实际上,这个过程涉及在每周的会议上与实验组定期接触,并继续考虑小组进行的实验工作类型,其中包括复制适应性,致病性和抗原逃逸的特征。SAVE早期检测小组并不试图概括全球众多公共卫生组织为指定关注的变体和感兴趣的变体所做的努力(1-3)。该小组旨在对变体和替代品进行水平扫描;它侧重于根据流行病学和估计表型构成公共卫生威胁的谱系和替代的早期信号,并通过提供有关SARS-CoV-2生物学相关方面的信息为此类谱系的出现做好准备,以便更快地评估未来的谱系。该小组每月发布世系优先级,供实验合作者使用。确定相关谱系并确定其优先级是困难的,该小组利用了9个组成亚组的专业知识。这些子组采用不同的方法来确定变体的优先级,从中汇总结果以形成公开可用的共识排名。自 2021 年 4 月以来,该小组已制定了 21 个优先事项。
  • 《SARS-CoV-2 BA.2·86在严重免疫压力下快速进化为JN.1》

    • 来源专题:新发突发传染病
    • 编译者:张玢
    • 发布时间:2024-01-03
    • SARS-CoV-2突变变种BA.2.86在出现后迅速被指定为监测变种,引起了全球的关注。尽管BA.2.86与目前的显性变异体EG.5.1和HK.3相比没有显示出显著的体液免疫逃逸和生长优势,但它表现出非常高的ACE2结合亲和力1、2、3、4、5。这种增强的结合亲和力加上其独特的抗原性,可以使BA.2.86在低水平的种群传播过程中积累免疫逃避突变,类似于先前从BA.2.75到CH.1.1和XBB.6、7、8、9的进化,与其前身BA.2.86相比只增加了一个受体结合域突变(L455S)。JN.1变种迅速在法国占据主导地位(图A;附录1第12页),超过了BA.2.86和所谓的Flip(L455F+F456L)菌株。彻底调查JN.1的免疫逃避能力,特别是考虑到它的几个额外突变,是当务之急。