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《有关 SARS-CoV-2“感兴趣的变体”JN.1 的信息》

  • 来源专题：新发突发传染病
  • 编译者： 张玢
  • 发布时间：2024-01-17

  • "BA.2.86的子型JN.1已成为美国主要的SARS-CoV-2变种，而其母变种从未达到过这一地位。幸运的是，尽管COVID-19病例激增，但从这种疾病导致的住院和死亡人数仍远远低于一年前的同期。

    当BA.2.86在去年夏天加入SARS-CoV-2 Omicron家族时，它吸引了流行病追踪者的注意，因为它与其前体BA.2有很大不同。与BA.2相比，BA.2.86的尖刺蛋白携带了30多个突变，这表明它可能比其前体更容易传播。

    但即使具有这些新的突变，BA.2.86也未能成为其他亚型的主导者。根据美国疾病控制和预防中心（CDC）的现场估计，截至今年1月初，BA.2.86在美国流行的SARS-CoV-2亚型中所占份额从未超过3%。

    全球范围内，根据世界卫生组织（WHO）的数据，到2023年11月初，BA.2.86在可用的SARS-CoV-2序列中占比8.9%，WHO于11月20日将BA.2.86及其亚系列归类为关注变种。在2023年11月初，BA.2.86在全球范围内占据了8.9%的SARS-CoV-2序列。在一篇于1月4日发表的观点文章中，斯克里普斯研究所分子医学教授埃里克·托普尔（Eric Topol，MD）提出，BA.2.86与以前的Omicron亚型有着如此大的不同，以至于WHO应该将其定为关注变种，并赋予其不同的希腊字母名称。

    在将整个不断增长的BA.2.86家族归类为关注变种四周后，WHO也将JN.1单独归类为关注变种，因为它的传播速度迅速增加。根据CDC的现场估计，到今年1月初，JN.1在美国流行的变种中所占份额估计已飙升至61.6%，而仅仅两周前这一比例为38.8%。"


  • 原文来源：https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2814112
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    • 作为美国国立卫生研究院 （NIH） 国家过敏和传染病研究所 （NIAID） SARS-CoV-2 病毒进化评估 （SAVE） 抗击 SARS-CoV-2 大流行工作的一部分，NIH NIAID Save 早期检测小组定期优先考虑 SARS-CoV-2 变体。优先级划分的主要目标是通过整合最新的流行病学、结构和遗传信息，确定NIH SAVE网络中实验组进行表型测试的相关谱系。实际上，这个过程涉及在每周的会议上与实验组定期接触，并继续考虑小组进行的实验工作类型，其中包括复制适应性，致病性和抗原逃逸的特征。SAVE早期检测小组并不试图概括全球众多公共卫生组织为指定关注的变体和感兴趣的变体所做的努力（1-3）。该小组旨在对变体和替代品进行水平扫描;它侧重于根据流行病学和估计表型构成公共卫生威胁的谱系和替代的早期信号，并通过提供有关SARS-CoV-2生物学相关方面的信息为此类谱系的出现做好准备，以便更快地评估未来的谱系。该小组每月发布世系优先级，供实验合作者使用。确定相关谱系并确定其优先级是困难的，该小组利用了9个组成亚组的专业知识。这些子组采用不同的方法来确定变体的优先级，从中汇总结果以形成公开可用的共识排名。自 2021 年 4 月以来，该小组已制定了 21 个优先事项。
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    • 根据美国疾病控制与预防中心（CDC）2023年12月9日 的最新消息，上周 Omicron亚变体JN.1检测的比例急剧上升，随着美国寒假周的临近，这可能会加剧COVID-19活动的增加。此外，2023年12月9日CDC报告说，由于美国全国呼吸道合胞病毒（RSV）活动仍然居高不感活动更加稳定地上升，特别是在东南部和中南部地区。 在本周早些时候在Twitter上发布的视频消息中，CDC主任Mandy Cohen，医学博士，公共卫生硕士表示，对于那些尚未接种三种呼吸道病毒疫苗的人来说，现在还为时不晚，她敦促人们采取额外措施，如避免病人，洗手，改善通风和戴口罩。 CDC 行追踪JN.1 被证明是 BA.2.86 家族中增长最快的成员，变体追踪器预测它可能会引发下一次 COVID 激增。欧洲的一些国家已经报告了JN.1的急剧峰值。在最新的变体比例更新中，CDC从BA.2.86的下挑选出JN.1，显示在过去两周内，JN.1水平从8.1%跃升至21.4%。此外，JN.1 现在是第二常检测到的变体，仅由 HV.1 主导，HV.1 是 XBB.1.9.2 谱系的一部分。在关于JN.1的单独更新中，CDC表示，JN.1的持续增长表明它要么更具传播性，要么更善于逃避免疫系统。然而，它补充说，没有证据表明与其他变体相比，它的风险增加。CDC表示，目前尚不清楚JN.1在多大程度上促成了12月的增长，但表示COVID活动可能会在下个月增加，实验室数据表明，更新后的COVID疫苗可以预防JN.1和其他变种。COVID-19疫情指标呈现增长势头与此同时，CDC针对新冠肺炎的两个严重性指标——住院人数和死亡人数——在过去一周均出现明显上升，与前一周相比，住院人数增加了17.6%，死亡人数增加了25%，但仍低于CDC在2022年11月的水平。对于住院人数，报告的人数适中，主要在中西部和大西洋中部地区，一些州的部分地区处于高水平，如蒙大拿州、南达科他州和西弗吉尼亚州。CDC在其每周呼吸道病毒快照中表示，COVID-19仍然是病毒性呼吸道死亡的主要驱动因素。CDC的早期指标也显示上升，检测阳性率上升了0.9%，急诊科就诊率上升了4%。中西部、西部山区和东北部的检测阳性率高于该国其他地区。在 COVID 急诊就诊中，婴儿和老年人的水平最高，幼儿的水平也更高。废水SARS-CoV-2跟踪是另一个早期指标，继续显示出高水平，特别是在中西部，流感继续扩大随着卫生系统为更多的COVID活动做准备，大多数地区的季节性流感活动继续上升，所有10个地区都达到或超过流感样疾病门诊就诊的基线，CDC在其每周流感更新中说。公共卫生实验室的病毒检测显示，甲型流感占阳性样本的80%，在亚型病毒中，2009年H1N1仍然占主导地位，占74.1%。流感住院率仍然很低，但正在上升，老年人的住院率最高，其次是 50 至 64 岁的成年人和 4 岁及以下的儿童。上周又报告了四例儿童流感死亡病例，使本季的总数增加到12例。所有这些都发生在11月，其中3例涉及H1N1,1例是由于B型流感，老年人的RSV住院率上升对于RSV，儿童的住院率仍然很高，但老年人的住院率正在上升，CDC在其每周呼吸道病毒快报中说。它指出，只有15.9%有资格接种RSV疫苗的成年人接种了疫苗。不过，总体而言，RSV住院人数有所下降，该病毒的检测阳性率也有所下降。
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