《微生物所等在天然产物药物研发中取得进展》

  • 来源专题:生物科技领域知识集成服务
  • 编译者: 陈方
  • 发布时间:2020-09-10
  • 微生物次级代谢产物,一般也称为微生物天然产物,是抗菌和抗肿瘤药物的重要来源。通常情况下,如何提高活性是天然产物进入到新药研发流程首要解决的问题。目前采用的常规方法是构建天然产物的衍生物库,筛选活性显著提高的化合物进入后续研发流程。多种药物分子都是通过类似的方法得到的。但建库筛选费时、费力,大大增加了研发成本。
    中国科学院微生物研究所陈义华课题组提出基于构效关系和次级代谢多样性,通过理性设计和组合生物合成快速获得活性显著提升的天然产物的思路。他们以自主知识产权的环六肽类抗生素白黄菌素作为出发材料,基于白黄菌素类似物的构效关系研究,理性设计活性更优的二聚化的白黄菌素衍生物,并通过组合生物合成技术让微生物直接生产二聚化的白黄菌素,将白黄菌素类化合物的抗菌和抗肿瘤活性提高了10-100倍以上(达到纳摩尔级),大大推进了白黄菌素类天然产物药物的研发速度。相关研究成果于2018年12月5日在线发表于《美国化学会志》。
    吴晓燕 摘编自http://www.cas.cn/syky/201812/t20181227_4675180.shtmll
    原文标题:微生物所等在天然产物药物研发中取得进展

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    • 来源专题:中国科学院文献情报系统—海洋科技情报网
    • 编译者:liguiju
    • 发布时间:2020-07-03
    • 礁栖海藻是珊瑚礁生物群落的重要组成部分。海藻共附生微生物与宿主相互依存,通过产生活性代谢产物构建化学防御体系,帮助宿主海藻抵抗捕食者和致病微生物,维护珊瑚礁生态系统平衡。这些微生物代谢产物往往结构新颖、活性独特,是新型药物先导化合物的宝贵来源。中国科学院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室和广东省海洋药物重点实验室刘永宏学科组长期从事海洋微生物活性天然产物研究,学科组周雪峰研究员对我国南海永兴岛附近低潮带珊瑚礁来源的腔节藻进行了多年的共附生微生物代谢产物研究,近期在新颖天然产物和药物先导物发现方面取得了重要进展。 学科组通过抗菌、杀虫和细胞毒活性筛选,结合LC-MS化学排重策略,从腔节藻共附生真菌中筛选出4株代谢产物丰富、具有潜在化学防御功能的活性菌株。对其中赭曲霉Jcma1F17进行优化发酵,在先前发现罕见的硝基苯酯倍半萜化合物基础上(MedChemComm 2014, 5, 701),进一步挖掘获得6个硝基苯酯倍半萜,并发现其具有肿瘤细胞增殖抑制和NF-κB抑制活性(J. Nat. Prod. 2018, 81, 92)[1]。该类化合物发表后,北京大学深圳研究生院杨震教授团队对其进行了化学全合成(Org. Lett. 2018, 20, 4298)。学科组通过微生物发酵大量制备硝基苯酯倍半萜,并与南方医科大学合作进行深入的抗炎免疫活性研究。通过体内外模型筛选发现其中NS4可显著抑制RANKL诱导的破骨细胞生成以及骨吸收功能,并阐明作用机制,揭示其在治疗骨质疏松和骨破坏疾病中的药用价值。成果于2020年6月30日在线发表于国际药理学权威期刊《英国药理学杂志》(IF 7.73)(Brit. J. Pharmacol. doi:10.1111/bph.15179)[2]。 从旋孢腔菌SCSIO41401无海盐发酵物中分离发现多个新颖的艾里莫芬烷型倍半萜,其中含有罕见肟基的小树孢菌素J,可选择性抑制肾癌ACHN细胞增殖和诱导凋亡(J. Nat. Prod. 2018, 81, 1406)[3]。在含海盐培养基中,该菌新产生4个螺环γ内酰胺类化合物,筛选发现新化合物螺圆孢菌素X对多种甲型流感病毒具有显著抑制活性,包括对“达菲”耐药株H274Y(抑制率IC50 1.2 μM)。机制研究表明螺圆孢菌素X作用于病毒感染早期,作用靶标为不易产生耐药的RNA聚合酶PB2-cap结合域。论文在《天然产物杂志》发表后被评为当月“Most Read Articles”(J. Nat. Prod. 2018, 81, 2722)[4]。 在LC-MS导向下,从青霉菌SCSIO41402发酵物中快速定向分离获得两个骨架新颖的sorbicillinoid类化合物,其中sorbicillfuran B为自然界首例桔霉素骈合sorbicillinoid骨架,具有抑制HL-60细胞增殖活性。成果以封面文章形式发表于《有机与生物分子化学》(Org. Biomol. Chem. 2019, 17: 8721)[5]。Sorbicillfuran B被国际权威杂志《天然产物报告》Hot off the Press栏目选为“热点化合物”(Nat. Prod. Rep. 2019, 36, 1614)。 从拟盘多毛孢菌SCSIO41403中分离鉴定26个次生代谢产物,其中新化合物17个,包括具有COX-2抑制活性的二苯甲酮类新化合物(J. Antibiot. doi:10.1038/s41429-020-0308-3)[6]和7个烯炔对苯二酚类新化合物。活性筛选发现其中新颖的烯炔对苯二酚糖苷pestalotioquinoside C对肝X受体α具有较好的激活作用,在高胆固醇血症、动脉粥样硬化等代谢类疾病中具有潜在药用价值。这类海藻微生物来源“稀缺”药源分子被《天然产物杂志》作为2020年4月刊的内页封面图片形式展示(J. Nat. Prod. 2020, 83,1258)[7]。 刘永宏学科组从礁栖腔节藻来源的4株共附生真菌中分离鉴定56个天然产物,其中新化合物29个,合作筛选发现多个具有抗肿瘤、抗流感、激活肝X受体α和抗炎免疫抑制活性的先导化合物,为研究礁栖海藻化学防御物质和珊瑚礁生态系统中的化学功能物质增加了新的维度,为海洋生物资源的深度开发利用和海洋创新药物研发奠定基础。 本研究中腔节藻由学科组杨斌副研究员采集,共附生真菌由林秀萍副研究员分离鉴定,真菌代谢产物的分离鉴定工作由硕士生王健娇(论文3-7)和南方医科大学博士生谭艳辉(论文1,2)在周雪峰研究员指导下完成,活性筛选和机制研究由南方医科大学药学院(论文1,2,4,6,7)合作完成。本研究得到了国家自然科学基金、广东省海洋经济发展专项基金和广东省自然科学基金杰出青年项目的资助。
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    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2020-09-10
    • 新型冠状病毒主蛋白酶是新型冠状病毒基因组编码的最重要的蛋白之一,它负责新型冠状病毒多聚蛋白的切割,在新型冠状病毒生命周期发挥重要作用,因此,新型冠状病毒主蛋白酶是抗病毒药物的理想靶点。此外,以病毒蛋白酶为靶点的抗病毒药物在抗HIV和HCV领域取得巨大的成功,如利托那韦、达芦那韦、特拉匹韦等。   齐建勋课题组2020年9月4在Nature Communications在线发表题为Both Boceprevir and GC376 efficaciously inhibit SARS-CoV-2 by targeting its main protease的研究论文。该论文建立了主蛋白酶的高通量药物筛选体系,并对已上市和在研的蛋白酶抑制剂化合物库进行筛选。结果发现已上市丙肝药物博赛泼维(Boceprevir)和在研药物GC376具有较好的主蛋白酶抑制活性。博赛泼维(Boceprevir)是由美国先灵葆雅(Schering-Plough)公司(该公司于2009年11月与美国默克药厂合并)研发的一种靶向HCV丝氨酸蛋白酶的共价抑制剂。2011年5月13日美国食品药品管理局(FDA)批准该药上市,用于某些成人患者慢性丙型肝炎的治疗。GC376是由堪萨斯大学和威奇塔州立大学共同研制的蛋白酶抑制剂。前期的研究结果显示该化合物在体外对杯状病毒、冠状病毒、小核糖核酸病毒均有较好的抑制活性。目前该化合物仍然处于临床前研究阶段。进一步的抗病毒实验结果显示,博赛泼维(Boceprevir)在Vero细胞水平上对新型冠状病毒的半数抑制浓度EC50为15.57μM,GC376对新型冠状病毒的半数抑制浓度EC50为0.70μM。此外,噬斑实验结果表明联合GC376和瑞德西韦可以显著增加抗新型冠状病毒效果。另外一方面,为了明确这2个药物的抗病毒机制,该论文分别解析了博赛泼维(Boceprevir)和GC376与主蛋白酶的复合物结构。晶体结构显示,博赛泼维(Boceprevir)和GC376均占据了主蛋白酶的酶活中心位点,从而阻止了主蛋白酶水解其底物。这些研究为发现抗新型冠状病毒药物提供了基础。   中国科学院微生物研究所的傅立峰、冯永和中国疾控中心病毒病所的叶飞为论文第一作者,中国科学院微生物所高福院士、齐建勋研究员、李学兵研究员和中国疾控中心病毒病所谭文杰研究员为论文通讯作者。该研究得到中国科学院战略性先导科技专项(B类)、国家重点研究计划和国家自然科学基金等项目的资助。