《Nature | 锌通过转录因子丝状化介导固氮控制》

  • 来源专题:战略生物资源
  • 编译者: 李康音
  • 发布时间:2024-06-29
  • 2024年6月26日,澳大利亚拉筹伯大学、西班牙植物生物技术和基因中心等机构的研究人员在Nature发表题为Zinc mediates control of nitrogen fixation via transcription factor filamentation的文章。

    植物通过调整新陈代谢和基因表达来适应不断变化的环境条件,从而保持健康。在豆科植物中,氮平衡是通过平衡从土壤资源中获取的氮和根瘤中共生细菌的固氮作用来维持的。

    该研究发现锌是植物必需的微量营养元素,它是细胞内的第二信使,将环境变化与根瘤中代谢活动的转录因子控制联系起来。研究人员发现了一种转录调节因子--硝酸下固定(FUN),它起着传感器的作用,锌控制着非活性丝状结构与活性转录调节因子之间的转换。该研究表明,当土壤硝酸盐含量较高时,结核中的锌浓度较低,会使丝状体解离并激活 FUN。然后,FUN 直接以多种途径为目标,启动结核的分解。

    因此,锌依赖性丝状化机制建立了一个浓度读数,使结核功能适应环境氮条件。从更广阔的角度来看,这些结果对于理解金属离子在环境信号与植物发育的整合中的作用以及优化豆科作物固定氮的输送具有重要意义。

  • 原文来源:https://www.nature.com/articles/s41586-024-07607-6
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    •     近日,中国科学院微生物研究所郑艳宁研究团队在Cell Reports发表题为“Formation of NifA-PII complex represses ammonium-sensitive nitrogen fixation in diazotrophic proteobacteria lacking NifL”的研究论文,该研究揭示了氮调控蛋白PII对固氮酶转录活化子NifA在转录和翻译后水平的调控机制,进一步加深了对固氮微生物如何响应环境中的氮水平并调控微生物固氮过程的理解,有助于发展更加高效的微生物固氮技术,推动化肥减施与绿色农业的可持续发展。      微生物固氮过程是由固氮酶催化完成的,作为地球上最复杂的金属酶之一,固氮酶的表达和分子成熟过程受到环境氮水平的严格调控,限制了微生物固氮过程的持续高效进行。NifA是固氮酶基因簇的转录活化子,但其自身转录和翻译后调控机制尚不清楚。     研究团队通过多组学分析,蛋白结构解析与模拟,以及体内遗传和体外生化功能验证等手段,发现在具有固氮功能但缺乏NifL蛋白的变形菌中,不同的PII蛋白通过尿苷酰(UMP)化修饰来介导其与NifA的相互作用。在高铵培养条件下的沼泽红假单胞菌中,未UMP化的PII蛋白GlnK1结合NifA,形成无活性的NifA-GlnK1复合物,进而抑制固氮酶的表达。而在低铵或固氮条件下,UMP化修饰的PII蛋白GlnK2UMP由于空间位阻无法与NifA进行结合,进而使NifA能够形成有活性的六聚体,同时GlnK2UMP显著促进了NifA的表达,从而进一步提升了固氮酶的表达水平和微生物固氮速率。