《真核无参转录组测序》

  • 来源专题:广东省科技情报动态监测服务平台
  • 编译者: 林兴浩
  • 发布时间:2017-05-16
  • 出色完成每一个项目环节.

    至2015年12月,诺禾致源已经成功对樱桃、蚊子、草莓、牡蛎、鲫鱼、 夜蛾等300多个无参考基因组物种进行了转录组测序分析, 助力研究者在Plant biotechnology journal、Scientific Reports 、 BMC Genomics等著名期刊发表高水平文章。 “科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”, 确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。.

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  • 《Science | 短串联重复序列结合转录因子调节真核生物基因表达》

    • 来源专题:战略生物资源
    • 编译者:李康音
    • 发布时间:2023-09-26
    • 2023年9月22日,斯坦福大学的科研人员在Science发表了题为Short tandem repeats bind transcription factors to tune eukaryotic gene expression的论文,该研究讲述了短串联重复序列在调控基因表达中的重要作用。 STRs广泛存在于真核生物基因组的调控元件中,STRs长度的变化往往与转录水平的改变相关。但是STRs调控基因表达的具体机制一直不明。Horton等在研究中发现,许多转录因子可以直接与STRs结合,而这种结合无需类似已知的结合位点,可以用简单的加性模型解释和预测,即重复的低亲和力结合位点之和产生较大作用。结果表明,STRs提供了一种调节转录因子结合和下游基因表达水平的调控机制。STRs约占人类基因组的5%,而编码蛋白的基因仅占1.5%,STRs长度变异与许多疾病相关。STRs可以看作一种调节本地转录因子浓度和结合反应的调节器,在疾病、发育和稳态中调节基因表达。 本文内容转载自“PaperRSS”微信公众号。 原文链接: https://mp.weixin.qq.com/s/X2Eb-9MIejzUQU77hNl-6g
  • 《利用单分子长读取测序揭示玉米转录组的复杂性》

    • 来源专题:转基因生物新品种培育
    • 编译者:丁倩
    • 发布时间:2016-07-04
    • 玉米是阐明转录网络的重要遗传模型。mRNA转录的完整结构的不确定性限制了对该系统的研究进展。本研究利用单分子测序技术,在6个组织中产生111151个转录,这些组织能获取约70%的玉米RefGen_v3基因组注释基因。很大比例的转录(57%)代表新型的,有时组织特异性,已知基因的亚型和3%对应于新基因位点。在其他情况下,确定的转录会改进现有的基因模型。平均在六个组织中,90%的剪接点由匹配组织的短读取维持。此外,我们确定了大量新型的长非编码RNA和融合转录,并发现DNA甲基化对产生不同亚型起重要作用。研究结果表明,玉米B73转录组的特性描述研究还远远没有完成,玉米的基因表达远比以前认为的更复杂。