新型冠状病毒已经破坏了医疗卫生设施，在全球造成约5%的死亡。由于对这种病毒的基因组特征缺乏更好的了解，所有使用抑制药物或疫苗来控制发病机制的努力在很大程度上仍然是徒劳的。在本研究中，我们将2019-nCoV与其他冠状病毒进行了比较，这表明蝙蝠- sars样冠状病毒可能是新型冠状病毒的祖先。穿山甲- hcov和bat-hCoV与人类冠状病毒的蛋白序列相似度高于其核苷酸相似度，说明在基因组中出现了更多的同义突变。从I组到V组的591个不同分支的冠状病毒的系统发育和排列分析显示了几个突变和伴随的氨基酸变化。详细的核苷酸取代研究发现，编码区有100个取代，其中同义类有43个，非同义类有57个。结果发现，引起57个氨基酸变化的非同义替换分布在不同的hCoV蛋白上，其中穗蛋白的变化最大。在ORF9蛋白中观察到RG向KR的重要双氨基酸变化。此外，新的冠状病毒基因组的几个有趣的特征已经在其他各种人类感染病毒方面得到了强调，这可能解释了极端的致病性、传染性以及抗病毒治疗失败的原因。本研究对SARS-CoV2分离株进行了全面的系统发育分析，以了解患者样本之间发生的离散突变。这一分析将为不同抑制药物治疗效果的差异提供解释，并为基于病毒基因组突变类型的组合治疗治疗提供未来的方向。
