《中国科学院海洋研究所首次研究发现氨基糖单体碳同位素可指示海洋有机质降解过程》

  • 来源专题:中国科学院文献情报系统—海洋科技情报网
  • 编译者: liguiju
  • 发布时间:2023-11-29
  • 近日,中国科学院海洋生态与环境科学重点实验室宋金明团队联合德国亥姆霍兹基尔海洋研究中心(GEOMAR),在地学领域TOP期刊Limnology and Oceanography发表最新研究成果,揭示了氨基糖单体碳同位素在异养细菌、浮游植物以及在有机质降解过程中的变化特征,并探讨了其对有机质异养转化的指示作用。

    海洋有机质是海洋中最大的还原性碳储库,其在全球碳循环中扮演着非常重要的角色。海洋有机质中有一小部分(<10%)可在短时间尺度内(小时到天)被微生物快速利用,称为活性有机质。尽管活性有机质占比很小,但其在支撑微食物网、驱动元素循环方面发挥着重要作用。此外,活性有机质的降解转化与大气二氧化碳紧密相连,因此探究海洋有机质的活性及周转过程对于理解海洋储碳及碳循环机制至关重要。传统上,通常基于有机分子(如氨基糖)丰度或构成评估有机质的生物活性。然而,此方法难以精细地刻画有机质的异养代谢过程。近年来单体同位素分析技术的发展为解决这一问题提供了有力工具。相比于总有机质(Bulk)同位素分析,单体同位素直接反映某一特定分子的同位素特征,从而能够避免选择性降解和多种化合物来源对bulk同位素值的影响。但到目前为止,对有机质重要组分氨基糖的单体同位素特征依然未知。

    本研究通过室内纯培养实验,测定了四种异养细菌以及四种浮游植物中的氨基糖单体碳同位素值。在此基础上,进一步通过模拟微生物降解实验,探究了在由活性有机质转变为惰性有机质的过程中,氨基糖单体碳同位素的变化机制。研究发现,异养细菌中葡萄糖胺(GlcN)和半乳糖胺(GalN)的碳同位素值较为接近,相差0.4‰到4‰,而浮游植物中两者则差异较大(4.3-16.6‰)。这一结果显示异养细菌可能具有相似的葡萄糖胺和半乳糖胺合成机制,而浮游植物对两者的合成可能通过不同的路径。相对葡萄糖胺和半乳糖胺,细菌在其特异性氨基糖胞壁酸(MurA)的合成中则优先利用轻的碳同位素(12C)。

    微生物降解实验结果显示,葡萄糖胺与半乳糖胺的碳同位素差值由降解初期的5.8‰降低到了降解末期的1‰。这一变化与藻类和菌类的纯培养结果相一致。在降解初期,细菌快速消耗活性有机质并将一部分活性有机质转化为细菌有机质。而在降解后期,由于活性碳源消耗殆尽,细菌可能通过再循环利用分子碎片以节省能量消耗。

    基于氨基糖单体碳同位素在细菌和藻类中的分布模式以及在有机质降解过程中的变化特征,本研究提出了一个新指标VAS,以反映氨基糖的细菌再合成。通过对外海颗粒物及沉积物样品的分析,发现这一指标相较于传统氨基糖降解指标GlcN/GalN能够更加精细地反映有机质的降解状态,从而为更加准确地探析海洋有机质细菌改造和转化提供了另一有力工具。

    论文第一作者为郭金强博士(目前在德国亥姆霍兹海洋研究中心从事博士后研究),宋金明、袁华茂研究员为论文共同通讯作者。该研究得到了国家自然科学基金、中国科学院A类先导专项、山东省自然科学基金等项目联合资助。

    相关论文及链接如下:

    Guo, J. Q., Achterberg, E. P., Shen, Y., Yuan, H. M. *, Song, J. M.*, Liu, J., Li, X. G., and Duan, L. Q. (2023). Stable carbon isotopic composition of amino sugars in heterotrophic bacteria and phytoplankton: Implications for assessment of marine organic matter degradation. Limnology and Oceanography.

    https://doi.org/10.1002/lno.12468.

  • 原文来源:https://qdio.cas.cn/2019Ver/News/kyjz/202311/t20231128_6938447.html
相关报告
  • 《中国科学院海洋研究所首次发现能在温和条件下高效降解PBAT塑料的海洋微生物酶》

    • 来源专题:中国科学院文献情报系统—海洋科技情报网
    • 编译者:熊萍
    • 发布时间:2024-10-21
    • 近日,国际学术期刊Journal of Hazardous Materials刊发了中国科学院海洋研究所孙超岷团队最新研究成果,首次报道了从海洋真菌Alternaria alternata FB1中发现的两种聚己二酸/对苯二甲酸丁二醇酯(PBAT)高效降解酶,为处理PBAT以及复杂塑料废物混合物提供了新的生物技术方案。 近年来,随着全球塑料污染问题日益严峻,开发有效的塑料降解技术成为学术界和工业界共同关注的焦点。PBAT作为一种生物可降解塑料,具有良好的机械性能和热稳定性,在包装材料和农用薄膜等领域被广泛应用。然而,PBAT含有较难降解的芳香族成分对苯二甲酸(是生产PET塑料的主要原料),使其自然降解效率较低,存在演变为微塑料的风险,进而影响各种生物的正常理化过程。尽管目前已有一些关于PBAT降解酶的研究,但均需在高温(如60-70度)条件下才能有效降解PBAT塑料,欲实现规模化处理需要额外提供大量热能,大大增加了企业的运行成本,不利于将来的工业化应用。因此,如何在较温和的条件下实现PBAT塑料的高效降解是亟待解决的科学和技术难题。 为解决这一挑战,孙超岷团队着眼于海洋微生物,自2016年开始即从青岛近海采集塑料垃圾,进行塑料降解菌的筛选工作。经过大量筛选,获得了一株海洋真菌Alternaria alternata FB1,该菌株不仅能降解传统聚烯烃塑料如聚乙烯(PE),还展现出高效降解PBAT塑料的潜力。在本研究中,研究人员进一步分离并表征了该菌株中两种具有PBAT降解能力的角质酶AaCut4和AaCut10,为开发工业应用的高效降解剂提供了新的可能。 该研究的亮点之一是AaCut10在温和反应温度下展现的优越性能:AaCut10能够在20-45°C下高效降解PBAT,其37°C下24小时PBAT解聚率达到82.14%,并在48小时内可实现PBAT的完全降解。在海水中,AaCut10保持了96%以上的催化活性,表明其具有良好的盐度和离子耐受性。相比之下,另一种已知最高效的PBAT水解酶TfCut-DM Q132Y的降解效率仅为AaCut10的44.8%(37°C下)和16.26%(23°C下),进一步证明了AaCut10在温和条件下的降解优势。此外,研究人员还通过定向突变和反应条件优化进一步提高了AaCut10的单体生成率,为未来的酶工程改造提供了新的思路,也为工业应用奠定了基础。除了PBAT,研究团队还对AaCut4和AaCut10的其他底物适应性进行了测试。结果表明,这两种酶不仅能够有效降解PBAT,还表现出对其他生物可降解塑料如聚(3-羟基丁酸)(PHB)和聚丁二酸丁二醇酯(PBS)的良好降解能力。广泛的降解底物范围使其在处理复合塑料或混合塑料废物中展现出巨大潜力。 AaCut10作为一种海洋真菌源水解酶,展现了在工业化塑料废弃物处理中的巨大应用潜力。其在温和条件下高效降解PBAT的能力以及水解产物相对单一、未出现产物抑制效应以及耐盐等特质,尤其适用于复杂海洋和陆地环境中的塑料废物管理,为可降解塑料的回收和再利用提供了一条新途径。目前,这项研究成果已申请了国家发明专利。2023年,全国PBAT生产总量已达139万吨,PBAT正逐渐成为传统聚烯烃塑料的重要替代品。然而,市场规模扩大背景下的PBAT末端处置水平亟待提高。利用基于AaCut10的生物酶解技术,PBAT废弃物的回收能够与绝大多数现有的PBAT制造工艺无缝衔接,通过高效的无溶剂方法将PBAT废料再生为塑料制品,从而避免额外的成本支出及潜在的环境污染风险。未来,AaCut10一方面可用于生活中PBAT废弃物的集中处理;另一方面,在山东、新疆等PBAT农业地膜大规模使用的省份,可与当地聚酯生产企业建立PBAT回收和再生产的产业基地,逐步实现真正意义上的闭环,即塑料的“生产-消费-回收-再造”。 中国科学院实验海洋生物学重点实验室博士研究生费凡为第一作者,孙超岷研究员为通讯作者。研究得到了崂山实验室科技创新项目、国际科学组织联盟重点合作研究项目、山东省自然科学基金和泰山学者计划等项目联合资助。 相关论文: Fan Fei, Zhenjie Su, Rui Liu, Rongrong Gao, Chaomin Sun*. Efficient biodegradation of poly(butylene adipate-co-terephthalate) in mild temperature by cutinases derived from a marine fungus. Journal of Hazardous Materials, 2024, 136008, DOI: 10.1016/j.jhazmat.2024.136008. 论文链接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0304389424025871
  • 《中国科学院海洋研究所研究发现河海连续体颗粒有机碳存在显著的细菌重塑过程》

    • 来源专题:中国科学院文献情报系统—海洋科技情报网
    • 编译者:熊萍
    • 发布时间:2025-02-18
    • 近日,中国科学院海洋研究所海洋生态与环境科学重点实验室宋金明、袁华茂团队联合德国亥姆霍兹基尔海洋研究中心(GEOMAR)在地学领域国际期刊Geochimica et Cosmochimica Acta发表了题为“Sources and fate of particulate organic matter along the river-estuary-coastal ocean continuum: Constraints from amino acid and amino sugar carbon isotopes”的研究成果。研究首次通过氨基酸和氨基糖单体碳同位素分析,揭示了河流-河口-近海连续体中颗粒有机质(POM)的多重来源及细菌重塑在其中扮演的重要角色。 作为全球碳循环枢纽的河口和近海区域,是陆源和海洋有机质交汇、相互作用复杂动态系统的发生地,准确追踪其有机质的来源、转化及归宿,对于理解陆海碳交换及全球碳收支至关重要。然而,河口及近海区域有机质来源及组成极其复杂,加之受到人为活动的影响,准确识别有机质的来源和转化仍面临诸多挑战。传统方法多依赖于总有机质参数,如总体稳定碳同位素(δ13C)和碳氮比值来追踪有机质来源,这些参数虽能初步区分陆源和海洋来源,但难以揭示有机质的具体组成及其动态变化。本研究基于单体同位素分析技术,结合颗粒有机碳(POC)及其组分分析,系统探究了长江口及邻近海域POM的来源、反应性及微生物转化过程。 研究发现,POC的总δ13C值主要反映了初级生产者的同位素信号,尤其在盐度较高的区域,初级生产者与溶解无机碳(DIC)之间的同位素分馏程度显著增大,导致高盐区POC的δ13C值明显偏低。这一现象表明,POM的同位素组成不仅受有机质来源的影响,还受到生物过程的调控。沿着盐度梯度,氨基酸和氨基糖的来源发生显著变化。陆源氨基酸主要来自细菌和维管植物,而海源氨基酸则以藻类为主;氨基糖在淡水端呈现混合来源,包括细菌、真菌和藻类,而在向海方向逐渐过渡为以细菌来源为主。低盐区的陆源POM呈现高度降解状态,并且大量(~19%)来源于细菌,而中高盐度区的POM则受浮游植物生产的影响,反应性显著提高。综合以上发现,并结合细菌生物标志物胞壁酸的同位素特征,本研究发现有机质在河流-河口-近海连续体中存在显著的细菌重塑过程,进一步证实了陆源有机质在河口区经历了快速移除过程。该研究揭示了河口系统中有机质的复杂动态变化和细菌在有机质转化中的关键作用,将有助于深化对陆海交汇区域碳循环过程的深入认识。 论文第一作者为海洋研究所郭金强博士,现在德国GEOMAR和法国海洋环境科学实验室(LEMAR)从事博士后研究,袁华茂研究员为论文通讯作者。研究得到了国家自然科学基金、崂山实验室和山东省自然科学基金等项目的联合支持。 论文信息: Guo,J.Q.,Achterberg,E.P.,Shen,Y.,Zhou,B.,Song,J.M.,Li,X.G.,Duan,L.Q.,Yuan,H.M*. 2025. Sources and fate of particulate organic matter along the river-estuary-coastal ocean continuum: Constraints from amino acid and amino sugar carbon isotopes. Geochimica et Cosmochimica Acta,393: 31?42. https://doi.org/10.1016/j.gca.2025.02.004.