2月17日，Nature报道称，非洲报告了第一例新型冠状病毒感染病例，即埃及一例。2月15日，埃及卫生部和世界卫生组织表示，埃及按计划追踪来自受影响国家的游客才发现该病例。该患者病毒测试呈阳性，但无症状，目前正在隔离中，并处于稳定状态。
研究人员一直担心这种病毒传播到非洲及其在非洲传播的可能性。巴黎皮埃尔•路易斯流行病学和公共卫生学院的传染病模型专家Vittoria Colizza告诉Nature杂志，她最担心的是七个非洲国家，这些国家有中等程度的病毒输入风险，但医疗系统薄弱，经济地位低下或政治局不稳定势，使他们极易受到影响。这些国家是尼日利亚、埃塞俄比亚、苏丹、安哥拉、坦桑尼亚、加纳和肯尼亚。
